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複雑系反応過程における非平衡非定常性の解明

複雑系反応過程における非平衡非定常性の解明
复杂反应过程中非平衡不稳定的阐明
批准号:
20038038
负责人:
戸田 幹人
金额:
$1.86万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009

项目摘要

项目成果

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実在系における反応過程の中でも、特に大自由度複雑系である生体分子や炭素クラスターに対して、非定常非平衡反応過程の動力学を解析する手法を開拓した。非定常性を抽出するためにウエーブレット変換を用い、さらに重要な自由度に縮約するために特異値分解を適用することで、大自由度系の反応過程における重要な反応自由度の抽出を行った。この方法は非常に一般的に有効である。この手法を、アデニレートキナーゼにおける大変形運動の分子動力学データや、脂肪酸の代謝に関連するタンパク質1TIBの分子動力学データ、さらには強レーザー場中の炭素クラスター解離過程の動力学データの解析に適用して、その有効性を検証した。アデニレートキナーゼでは、従来知られていた蝶番的な変形運動に加えて、2次構造が部分的に壊れる集団運動の可能性を指摘した。1TIBでは、ドッキング過程で重要となる集団運動の卓越性を示し、機能発現に関して近年提唱されたpopulation shift説の可能性を見出した。炭素クラスターでは、レーザー場中に置ける振動エネルギーの分配と再集中の過程を見出し、そのメカニズムを解明する端緒についた。以上の時系列解析で重要な役割を果たす特異値分解に関しても、ランダム行列理論の立場から解析を行った。特にラゲール分布と固定跡分布に関して特異値の一体分布の厳密解を求め、数値計算との一致を確認した。これらのランダム行列理論は、時系列解析において、重要な自由度を抽出するために有用となることが予想される。実在系の反応過程に対する応用は今後の課題である。
期刊论文(26)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
タンパク質分子の分子動力学に対する時系列解析III
蛋白质分子的分子动力学时间序列分析III
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [櫻井乃梨子、戸田幹人、渕上壮太郎, 木寺詔紀]
通讯作者: 木寺詔紀
Ergodic Problems for Real Complex Systems in Chemical Physics
化学物理中真实复杂系统的遍历问题
DOI: --
发表时间: 2011
期刊: Advances in Chemical Physics
影响因子: --
作者: [T.Komatsuzaki, A.Baba, S.Kawai, M.Toda, J.E.Straub, R.S.Berry]
通讯作者: R.S.Berry
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [M.Kamada, M.Toda, M.Takata, K.Joe]
通讯作者: K.Joe
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Physical Review Letters 100
影响因子: --
作者: [H. Kubotani, S. Adachi and M. Toda]
通讯作者: S. Adachi and M. Toda
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    Study of rain fall based on super-droplet method and hierarchical Lagrangian analysis
    • 批准号:
      23K03265
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.91万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      戸田 幹人
    • 依托单位:
    強レーザー場と結合した高励起分子振動・分子集団運動の非線型動力学
    • 批准号:
      14077212
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $5.95万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      戸田 幹人
    • 依托单位:
    化学反応の統計性・選択性と相空間構造
    • 批准号:
      12042238
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
    • 资助金额:
      $2.3万
    • 财政年份:
      2000
    • 负责人:
      戸田 幹人
    • 依托单位:
    化学反応の統計性・選択性と相空間構造
    • 批准号:
      11166233
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
    • 资助金额:
      $1.22万
    • 财政年份:
      1999
    • 负责人:
      戸田 幹人
    • 依托单位:
    海外基金