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複雑系反応過程における非平衡非定常性の解明

复杂反应过程中非平衡不稳定的阐明

基本信息

批准号：
20038038
负责人：
戸田幹人
金额：
$ 1.86万
依托单位：
Nara Women's University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

実在系における反応過程の中でも、特に大自由度複雑系である生体分子や炭素クラスターに対して、非定常非平衡反応過程の動力学を解析する手法を開拓した。非定常性を抽出するためにウエーブレット変換を用い、さらに重要な自由度に縮約するために特異値分解を適用することで、大自由度系の反応過程における重要な反応自由度の抽出を行った。この方法は非常に一般的に有効である。この手法を、アデニレートキナーゼにおける大変形運動の分子動力学データや、脂肪酸の代謝に関連するタンパク質1TIBの分子動力学データ、さらには強レーザー場中の炭素クラスター解離過程の動力学データの解析に適用して、その有効性を検証した。アデニレートキナーゼでは、従来知られていた蝶番的な変形運動に加えて、2次構造が部分的に壊れる集団運動の可能性を指摘した。1TIBでは、ドッキング過程で重要となる集団運動の卓越性を示し、機能発現に関して近年提唱されたpopulation shift説の可能性を見出した。炭素クラスターでは、レーザー場中に置ける振動エネルギーの分配と再集中の過程を見出し、そのメカニズムを解明する端緒についた。以上の時系列解析で重要な役割を果たす特異値分解に関しても、ランダム行列理論の立場から解析を行った。特にラゲール分布と固定跡分布に関して特異値の一体分布の厳密解を求め、数値計算との一致を確認した。これらのランダム行列理論は、時系列解析において、重要な自由度を抽出するために有用となることが予想される。実在系の反応過程に対する応用は今後の課題である。

A new approach to the dynamic analysis of unsteady and nonequilibrium reaction processes in biological molecules and carbon molecules is developed in this paper. Non-stationary extraction of important degrees of freedom, reduction of important degrees of freedom, and extraction of important degrees of freedom This method is very general. The molecular dynamics model of the molecular dynamics of the mass 1TIB in the metabolism of fatty acids is applicable to the kinetic analysis of the carbon mass dissociation process in the strong reaction field. The molecular dynamics model of the mass 1TIB in the metabolism of fatty acids is applicable to the kinetic analysis of the carbon mass dissociation process in the strong reaction field. The possibility of collective motion of the secondary structure is discussed. 1. The importance of TIB in the population shift process has been demonstrated in recent years, as has the possibility of population shift. The process of distribution and reconcentration of carbon vibration in the field is shown in the table below. The above analysis of the time series is important for the analysis of the specific value of the relevant, the analysis of the position of the column theory Special distribution and fixed distribution are related to the calculation of special value and the consistency of integral distribution. The theory of time series analysis, the extraction of important degrees of freedom, and the calculation of useful values. In the process of reaction, the problem of the future is solved.