線虫の発生過程における低分子非翻訳RNA種の発現比較

线虫发育过程中小非翻译 RNA 种类表达的比较

• 批准号: 15011201
• 负责人: 牛田 千里
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Hirosaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15011201/
• 关键词: ゲノム; 発生・分化; 低分子RNA; 線虫; ncRNA; RNomics

本研究は線虫(Caenorhabditis elegans)の非翻訳RNA分子種を組織的に網羅し,それらの機能解析を通して非翻訳RNA分子が複雑な遺伝子ネットワークの中でどのように他の因子と関わりあって発生,行動,老化といった生命現象に関与しているか理解することを目的とする。平成15年度は、これまでに確立した50nt以下の低分子RNAを再現性よく分離する二次元電気泳動法を用いて泳動像を比較することにより、線虫の発生過程で特徴的な発現パターンを示す非翻訳RNA種を同定することを中心に実験を進めた。この結果、50nt以下のRNA画分について,卵から調製したものとmixed stageの虫から調製したものとでは異なる電気泳動像を示すことを明らかにし,それぞれのRNAスポットを,卵特異的に検出されるもの,mixed stage特異的に検出されるもの,両者に共通に検出されるものに分類した。また,これらのRNA種の配列決定を行う方法を確立し,いくつかについて解析を行った。この他,これまでに単離した新規非翻訳RNA種候補のうち,タンパク質遺伝子のイントロンをコードする部分に遺伝子が存在するもの8種類(CeR-3,4,5,6,7,8,9,19RNA)について,発現の確認や末端配列の決定を行い,論文にまとめた(印刷中)。

This study aims to understand the role of non-inverted RNA molecules in the development, movement and aging of organisms. In 2015, the reproducibility of low molecular weight RNA below 50nt was established. The separation was compared with that of the secondary electrokinetic method. The characteristics of the development process of the parasite were revealed. As a result, RNA molecules below 50nt were isolated from each other, and the electrokinetic images of these molecules were displayed in the mixed stage. The method for determining the alignment of RNA species was established and analyzed. 8 species (CeR-3,4,5,6,7,8,9,19RNA) were identified and terminal alignment determination was performed in this paper (in press).

项目成果

M.Wachi, T.Ogawa, K.Yokoyama, Y.Hokii, M.Shimoyama, A.Muto, C.Ushida: "Isolation of eight novel Caenorhabditis elegans small RNAs."GENE. 印刷中.

M. Wachi、T. Okawa、K. Yokoyama、Y. Hokii、M. Shimoyama、A. Muto、C. Ushida：“八种新型秀丽隐杆线虫小 RNA 的分离正在出版。”