The mechanistic basis of human epigenome establishement

人类表观基因组建立的机制基础

• 批准号: 23249019
• 负责人: SASAKI Hiroyuki
• 金额: $ 30.95万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-05-31 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23249019/
• 关键词: 遺伝学; エピゲノム; DNAメチル化; 小分子RNA

In tis study, we tried to identify factors that determine DNA methylation patterns of human cells, with a long-term goal of clarifying mechanisms regulating gene expression. First, we identified ZBTB24 protein as a novel methylation pattern determinant, based on the study of an immune-deficiency syndrome accompanied by DNA hypomethylation at certain DNA sequences. A gene knockout study in mice confirmed that it is indeed a factor regulating DNA methylation. Second, based on the comparative study of methylation patterns between human and chimpanzee, we identified CTCF protein, a transcription factor, and its target sequence as methylation determinants. Species-specific sequence changes that disrupted CTCF binding were correlated with hypermethylation. Lastly, we identified CpG dinucleotide density in tandem repetitive sequences as another determinant. Our results provide a basis to study the roles of methylation in evolution, variability and disease such as cancer.

在这项研究中，我们试图确定决定人类细胞DNA甲基化模式的因素，长期目标是阐明调控基因表达的机制。首先，我们确定ZBTB24蛋白作为一种新的甲基化模式的决定因素，基于免疫缺陷综合征伴随着DNA低甲基化在某些DNA序列的研究。在小鼠中进行的基因敲除研究证实，它确实是调节DNA甲基化的一个因素。第二，通过对人类和黑猩猩甲基化模式的比较研究，我们确定了转录因子CTCF蛋白及其靶序列为甲基化决定簇。破坏CTCF结合的物种特异性序列变化与超甲基化相关。最后，我们确定了串联重复序列中的CpG二核苷酸密度作为另一个决定因素。我们的研究结果为研究甲基化在进化、变异和癌症等疾病中的作用提供了基础。

项目成果

エピジェネティクスと生体恒常性維持

表观遗传学和生物稳态

• 发表时间: 2013
• 作者: M. Kataoka;A. Murakami;S. Ohno;K. Fujisawa and A. Iizuka;佐々木裕之
• 通讯作者: 佐々木裕之

エピゲノムとヒトの発生・生殖

表观基因组和人类发育/繁殖

• 发表时间: 2013
• 作者: Asai M.;Asai;N.;Murata;A.;Yokota;H.;Ohmori;K.;Mii;S.;Enomoto;A.;Murakumo;Y. and Takahashi;M.;佐々木裕之
• 通讯作者: 佐々木裕之

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霊長類間のDNAメチル化多型の解析

灵长类动物DNA甲基化多态性分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 福田渓;他
• 通讯作者: 他

2型ICF症候群原因遺伝子ZBTB24のDNAメチル化制御機構の解明

阐明2型ICF综合征基因ZBTB24的DNA甲基化控制机制

• 发表时间: 2013
• 作者: 新田洋久,鵜木元香,一柳健司,古庄知己,重村倫成,高橋浩士;Guillaume Velasco;Claire Francastel;CapucinePicard,大津真,金子新,久保田健夫,佐々木裕之
• 通讯作者: CapucinePicard,大津真,金子新,久保田健夫,佐々木裕之