未知腸内ファージの発掘と新たな腸内細菌-ファージ間相互作用の解明

未知肠道噬菌体的发现并阐明新的肠道细菌-噬菌体相互作用

• 批准号: 22KJ3178
• 负责人: 森永 花菜
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3178/
• 关键词: 腸内細菌; ファージ; 相互作用

本研究では、ヒトの健康や疾患に関わる重要な難培養性腸内細菌の培養化を通じて、それらに感染する未知ファージを発見し、そのゲノム・形態・生理機能を詳らかにすると共に、宿主腸内細菌とファージの未知の相互作用を解明することを目指している。本研究によって、未知のファージが獲得でき、その遺伝学的・生物学的特徴や宿主との相互作用が明らかになれば、生物学・医学細菌学の基盤的知見の拡充と深化を促すだけでなく、腸内フローラの特異的な制御（ファージセラピー）によるヒトの健康維持・疾患予防に繋がる研究基盤の構築が見込まれる。今年度は、昨年度までに構築した腸内細菌ライブラリーを用いることで、絶対嫌気性細菌に感染する新奇ファージの分離を目指した。その結果、マウス糞便より、未知のファージを分離することに成功した。本ファージの系統を明らかにするため、ファージを大量培養し、精製した後、ゲノムを抽出した。抽出したゲノムをシーケンス解析したところ、本ファージは、ヒトの腸内に豊富に存在するものの、分離例の少ない新奇なファージであることが示された。本ファージは、宿主細菌を大きく溶菌することなく増幅するという特徴を持つ興味深い形質を示すファージであることが明らかとなった。また、本ファージ添加時の宿主細菌の生育を、嫌気条件下で経時的に顕微鏡観察することで、本系統のファージに対する宿主細菌の応答を初めて捉えることに成功した。今後、単離した新奇ファージのより詳細な遺伝学的・生物学的特徴や宿主との相互作用を明らかにする予定である。

This study で は, ヒ ト や の health disorders に masato わ る important の な difficult raising sexually intestinal bacteria culture change を tong じ て, そ れ ら に infection す る unknown フ ァ ー ジ を 発 し, そ の ゲ ノ ム, morphology, physiology を detailed ら か に す る と に, host intestinal bacteria と フ ァ ー ジ の unknown の interaction を interpret す る こ と を refers し て い る. This study に よ っ て, unknown の フ ァ ー ジ が get で き, そ の heritage 伝, the biology of 徴 や host と の interaction が Ming ら か に な れ ば, biology, medical bacteriology の base plate knowledge の company, filling と deepen を promote す だ け で な く, intestinal フ ロ ー ラ の specific な suppression (フ ァ ー ジ セ ラ ピ ー) に よ る ヒ ト の maintain health, disease prevention Youdaoplaceholder0 the construction of the base plate が can be found in 込まれる. Our annual ま は, yesterday で に build し た intestinal bacteria ラ イ ブ ラ リ ー を with い る こ と で, absolutely too 気 seaborne に bacteria infection す る novel フ ァ ー ジ の separation を refers し た. Youdaoplaceholder0 そ results, ウス ウス feces よ た, unknown <s:1> ファ ジを ジを separation する とに とに successful た た. This フ ァ ー ジ の system を Ming ら か に す る た め, フ ァ ー ジ を mass culture し, refined し た, ゲ ノ ム を spare し た. Take し た ゲ ノ ム を シ ー ケ ン ス parsing し た と こ ろ, this フ ァ ー ジ は, ヒ ト の intestinal に aboundant に exist す る も の の, less separation cases の な い novel な フ ァ ー ジ で あ る こ と が shown さ れ た. This フ ァ ー ジ は, host bacteria を き く lysis す る こ と な く rights of す る と い う, 徴 を hold つ tumblers deep い character を shown す フ ァ ー ジ で あ る こ と が Ming ら か と な っ た. ま た, this フ ァ ー ジ の fertility を の when adding a host bacteria, anaerobic 気 conditions で 経 when に 顕 micromirror 観 examine す る こ と で, this system の フ ァ ー ジ に す seaborne る host bacteria の 応 answer early を め て catch え る こ と に successful し た. In the future, 単 し た novel フ ァ ー ジ の よ り detailed な but 伝, of biology, 徴 や host と の interaction を Ming ら か に す る designated で あ る.

项目成果

マウス腸内から単離した未知嫌気性細菌の系統と生理機能の解明

阐明从小鼠肠道分离的未知厌氧菌的谱系和生理功能

• 发表时间: 2022
• 作者: 森永花菜;草田裕之;坂本幸子;村上匠;豊田敦;森宙史;孟憲英;髙篠素子;室冨和俊;玉木秀幸.
• 通讯作者: 玉木秀幸.

Granulimonas faecalis gen. nov., sp. nov., and Leptogranulimonas caecicola gen. nov., sp. nov., novel lactate-producing Atopobiaceae bacteria isolated from mouse intestines, and an emended description of the family Atopobiaceae

粪颗粒单胞菌属

• DOI: 10.1099/ijsem.0.005596
• 发表时间: 2022
• 期刊: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
• 影响因子: 2.8
• 作者: Morinaga Kana;Kusada Hiroyuki;Sakamoto Sachiko;Murakami Takumi;Toyoda Atsushi;Mori Hiroshi;Meng Xian-Ying;Takashino Motoko;Murotomi Kazutoshi;Tamaki Hideyuki
• 通讯作者: Tamaki Hideyuki

マウス腸内に棲息する未知嫌気性腸内細菌の単離と系統・生理学的特性の解明

小鼠肠道中未知厌氧肠道细菌的分离并阐明其系统发育和生理特征

• 发表时间: 2022
• 作者: 森永花菜;草田裕之;坂本幸子;村上匠;豊田敦;森宙史;孟憲英;髙篠素子;室冨和俊;玉木秀幸.
• 通讯作者: 玉木秀幸.