T4ファージ尾繊維および小尾繊維とリポ多糖との相互作用

T4噬菌体尾纤维和小尾纤维与脂多糖的相互作用

• 批准号: 10134214
• 负责人: 有坂 文雄
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10134214/
• 关键词: バクテリオファージT4; 尾繊維; 小尾繊維; リポ多糖; Rコア糖鎖; 糖・蛋白質相互作用; 感染

本研究ではLPSの構造のどの部分がファージとの相互作用に重要であるかを調べるために、LPS糖鎖の長さの異なる3株の変異株を含む5株の大腸菌を取り上げ、各株からそれぞれLPSを単離した。2株の野生株はD21(Kl2由来)とB株である。ほとんどの遺伝学的研究はK12株を用いて行われているが、ファージの研究では主としてB株が用いられている。LPSは脂質の部分で会合しやすく、単離したLPSは通常大きな会合体を形成している。精密な物理化学的測定を行うためには、均一な分子量のLPSまたは糖鎖部分を得ることが必要なので、1%酢酸による比較的穏和な酸処理によって多糖の部分を切り離して用いた。LPSを1%酢酸で100℃、90分処理して糖鎖部分を切り離した後、凝集したリピドAを遠心で取り除いてから、ゲルろ過(Sephadex G50)によって各オリゴ糖を得た。次に、これらの糖鎖部分の糖組成を、強アルカリ条件でのイオン交換クロマトグラフィーにより分析した。大腸菌BとD21-e7の糖鎖はGlc,Hep,KDO、D21株ではそれに加えてGalとGlcNAcが検出された。他方、D21-flはHep,KDO、YA2l-6株ではKDOのみにより構成されていることが確認された。これらの異なる糖鎖構造のLPSを持つ大腸菌株、またそこから単離したLPSについて、T4ファージの感染効率、失活率、小尾繊維との結合を調べ、相互に比較した。その結果、その結果、感染にはグルコース及びヘプトース残基が重要でおることが確認されたが、gpl2はある程度KDOにも親和性があることが認められた。

This study で は LPS の tectonic の ど の part が フ ァ ー ジ と の interaction に important で あ る か を adjustable べ る た め に, LPS sugar long locks の さ の different な る 3 strains の - contains different strains を む 5 strains の coliform を taking り げ, various plants か ら そ れ ぞ れ LPS を 単 from し た. Two wild strains of the species である D21(origin of Kl2)とB strain である. ほ と ん ど の heritage 伝 learning research は K12 を strains with い て line わ れ て い る が, フ ァ ー ジ の research で は main と し て が B strain with い ら れ て い る. The lipid <s:1> part of LPS で will conjoin to やすく and 単 will separate from the た. Usually, the large な な will combine to を form て and る. Line precision な physicochemical determination を う た め に は, uniform な molecular weight の LPS ま た は sugar lock parts を must る こ と が necessary な の で, 1% boggy acid に よ る compare one and な acid 処 Richard に よ っ て polysaccharide の を cutting り from し て in い た. LPS を 1% boggy acid で 100 ℃, 90 処 し て sugar lock parts cut を り from し た, agglutination し た リ ピ ド A を telecentric で take り except い て か ら, ゲ ル ろ too (Sephadex G50) に よ っ て each オ リ ゴ sugar を た. に, こ れ ら の sugar の sugar of part of the lock を, strong ア ル カ リ conditions で の イ オ ン exchange ク ロ マ ト グ ラ フ ィ ー に よ り analysis し た. Coliform B と D21 - e7 の sugar lock は Glc, Hep, KDO, D21 plant で は そ れ に plus え て Gal と GlcNAc が 検 out さ れ た. Fang, D21 - fl は Hep, KDO, YA2l - 6 strains で は KDO の み に よ り constitute さ れ て い る こ と が confirm さ れ た. こ れ ら の different な る sugar lock structure の LPS を hold つ coliform strains, ま た そ こ か ら 単 from し た LPS に つ い て, T4 フ ァ ー ジ unseen の infection rate, the deactivation rate, small tail 繊 d と の compared with を べ, mutual に し た. そ の results, そ の results, infection に は グ ル コ ー ス and び ヘ プ ト ー ス residues が important で お る こ と が confirm さ れ た が, gpl2 は あ る degree KDO に も affinity が あ る こ と が recognize め ら れ た.

项目成果

Shigeki TAKEDA: "Discovery of the tail tube gene of bacteriophage Mu and sequence analysis of the sheath and tube genes"Biochim. Biophys. Acta. 1399. 88-92 (1998)

Shigeki TAKEDA：“噬菌体Mu尾管基因的发现以及鞘和管基因的序列分析”Biochim。

有坂文雄: "超遠心分析の基礎と新たな展開(2)" 蛋白質核酸酵素. 13(14). 2145-2152 (1998)

Fumio Arisaka：“超速离心分析的基础知识和新进展 (2)”蛋白质核酸酶 13(14) (1998)。

Shigeki TAKEDA: "Mapping of Functional Sites on the Primary Structure of the Tail Lysozyme of Bacteriophage T4 by Mutation Analysis" Biochem.Biophys.Acta. 1384. 243-252 (1998)

Shigeki TAKEDA：“通过突变分析绘制噬菌体 T4 尾部溶菌酶一级结构的功能位点”Biochem.Biophys.Acta。

有坂文雄: "生体物質相互作用のリアルタイム解析実験法" シュプリンガーフェーラーク東京社, 268 (1998)

有坂文雄：“生物材料相互作用实时分析的实验方法”Springer-Verlag Tokyo，268 (1998)

有坂文雄: "超遠心分析の基礎と新たな展開(1)" 蛋白質核酸酵素. 43(3). 2024-2032 (1998)

有坂文雄：“超速离心分析的基础知识和新进展（1）”蛋白质核酸酶43（3）（1998）。