Theoretical investigation of reaction fields of biological macromolecular systems based on quantum sciences and mathematical informatics

基于量子科学和数学信息学的生物大分子系统反应场的理论研究

• 批准号: 25287099
• 负责人: Tateno Masaru
• 金额: $ 12.23万
• 依托单位: University of Hyogo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2017-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25287099/
• 关键词: 電子ダイナミクス; ハイブリッド触媒; 電子状態理論; パターン認識; 情報微分幾何学; ゲノムDNA; リボザイム; 転写制御; 電子構造理論; 情報理論; 機械学習; 情報幾何学; ゲノム情報学; 多様体; 計算科学; 情報科学; 量子科学; 生命物理学; 生体高分子; DNA; タンパク質; 核酸; 生体触媒反応における電子構造のダイナミクス; ゲノムDNAの高次構造モデル; 転写制御配列の自動同定システム; 自動解析ウェブサービスシステム; 細胞

项目成果

Proton transfer mechanisms in photosystem II: hybrid ab initio quantum mechanics study

光系统 II 中的质子转移机制：混合从头算量子力学研究

• 发表时间: 2016
• 作者: Atsushi Nakamura;Jiyong Kang;Yasufumi Umena;Keisuke Kawakami;Shen Jian-Ren;Nobuo Kamiya;and Masaru Tateno
• 通讯作者: and Masaru Tateno

Development and application of ab initio identification system of transcription factor binding motif in genome-wide data

全基因组数据转录因子结合基序从头开始识别系统的开发与应用

• 发表时间: 2014
• 作者: Yuya Takahashi;Jiyoung Kang;Kim Kyoung-tark;Masaru Tateno
• 通讯作者: Masaru Tateno

量子と情報による生命の理解

通过量子和信息了解生命

• 发表时间: 2013
• 作者: 西田圭佑;鈴木昭夫;若林大佑;柴崎裕樹;亀卦川卓美;船守展正;Masaru Tateno
• 通讯作者: Masaru Tateno

Catalytic mechanisms by Ras：hybrid quantum mechanics/molecular mechanics molecular dynamics simulations of the complex with the GAP

Ras催化机制：混合量子力学/分子力学GAP配合物的分子动力学模拟

• 发表时间: 2013
• 作者: Takuya Takeda;Tetsuhiko Itagaki;Jiyoung Kang;Masaru Tateno
• 通讯作者: Masaru Tateno

Dynamical enzymatic mechanisms of GTP hydrolysis by complex of oncogenic product Ras and Ras-GAP: hybrid quantum mechanics / molecular mechanics molecular dynamics simulations

致癌产物 Ras 和 Ras-GAP 复合物水解 GTP 的动态酶机制：混合量子力学/分子力学分子动力学模拟

• 发表时间: 2013
• 作者: Masaru Tateno;Jiyoung Kang;Kyoung-Tark Kim
• 通讯作者: Kyoung-Tark Kim