分子空間固定型ネガマイシンの標的分子同定と論理的リードスルー創薬への展開

分子空间固定负霉素的靶分子识别和逻辑通读药物发现的开发

• 批准号: 22KJ2791
• 负责人: 大村 紀子
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: Tokyo University of Pharmacy and Life Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ2791/
• 关键词: リードスルー; ナンセンス変異; 遺伝性疾患; ネガマイシン

ネガマイシン誘導体のリードスルー活性に関連する標的分子の同定を目的とし、アフィニティービーズの合成に着手した。前年度の構造活性相関研究より見いだされた、高活性誘導体TCP-306をリガンドとして磁気ビーズへの固定化を行い、COS-7細胞ライセートを用いたケミカルプルダウンを実施した。しかしながら、ネガマイシン誘導体に由来する特異的なバンドを検出することはできず、標的分子に関する情報は得られなかった。今後、ネガマイシン誘導体がタンパク質以外の分子を標的としている可能性も視野に入れ、引き続きリードスルー活性に関連する標的分子の同定を目指す。さらに本年度は、リードスルー作用の活性発現メカニズムの解明に迫るべく、ネガマイシン誘導体TCP-306がリードスルーを起こしやすい遺伝子配列的特徴（リードスルー特性）を調査した。リードスルーの起こりやすさ（リードスルー効率）は、i)PTCの種類、ii)そのmRNA上の存在位置、ⅲ)PTC周辺の塩基配列に大きく影響を受けることが知られている。筋ジストロフィーの原因遺伝子中のナンセンス変異配列13種を対象としたデュアルレポーターアッセイにより、遺伝子配列間および化合物間でのリードスルー効率を比較した。その結果、リードスルー化合物としてよく研究されているアミノグリコシドG418はDMD S319X(TGA-C)およびLAMA2 R1549X(TGA-C)配列に対し、比較的高いリードスルー効率を示した。一方、TCP-306はDMD R3381X(TGA-A)とLAMA2 C1546X(TGA-A)に対してG418を凌ぐリードスルー効率を示した。このことからネガマイシン誘導体はG418とは異なるリードスルー特性を示すことが示唆された。

The molecular structure of the active compound is the same as that of the target molecule, and the molecular structure of the molecule is the same as that of the target. In the previous year, the bioactive phase was studied. The highly active body TCP-306 was immobilized in the magnetic field, and the COS-7 cell was used in the experiment. The reason for the formation of the body is that the molecular molecules of the virus are known to be sensitive to each other. In the future, the target of the molecule is the same as that of the molecule, which is different from that of the molecule in the future. In the current year, you will be able to understand the characteristics of the TCP-306 system. You will need to know the characteristics of the system. We need to know the location of the mRNA, I) the location of the PTC, the location of the mRNA, and the location of the PTC peripherals. The reason for this is that there is a difference in the percentage of compounds between compounds in the sub-column of 13 compounds. The results showed that the ratio of G418 DMD S319X (TGA-C) to LAMA2 R1549X (TGA-C) was higher than that of other compounds. One party, TCP-306, DMD R3381X (TGA-A), LAMA2 C1546X (TGA-A), G418, and the rate is shown. I don't know what to do. I don't know. I don't know.

项目成果

筋ジストロフィー由来ナンセンス変異に対するネガマイシン誘導体のリードスルー効率

奈加霉素衍生物对抗肌营养不良症无义突变的通读效率

• 发表时间: 2023
• 作者: 大村 紀子;田口 晃弘;濵田 圭佑;今野 翔;谷口 敦彦;林 良雄
• 通讯作者: 林 良雄

Structure-Activity Relationship Study Focusing on 3-epi-Deoxynegamycin for Readthrough Activity

结构-活性关系研究重点关注 3-表-脱氧霉素的通读活性

• 发表时间: 2021
• 作者: Noriko Omura;Akihiro Taguchi;Keisuke Hamada;Tomoki Kuwahara;Mizuki Watanabe;Masanori Nakakuki;Sho Konno;Kentaro Takayama;Atsuhiko Taniguchi;Toshifumi Nomura;Satoshi Shuto;Yoshio Hayashi
• 通讯作者: Yoshio Hayashi

ネガマイシン3位アミノ基誘導体の創製と各種遺伝性疾患に対するリードスルー効果の検討

奈加霉素3-氨基衍生物的创建及对多种遗传病的通读作用研究

• 发表时间: 2021
• 作者: 大村 紀子;濵田 圭佑;田口 晃弘;今野 翔;高山 健太郎;谷口 敦彦;林 良雄
• 通讯作者: 林 良雄

分子空間固定型ネガマイシンの合成とそのリードスルー活性評価

分子空间固定负霉素的合成及其通读活性评价

• 发表时间: 2021
• 作者: 大村 紀子;田口 晃弘;濵田 圭佑;桑原 智希;渡邉 瑞貴;中久木 正則;今野 翔;高山 健太郎;谷口 敦彦;乃村 俊史;周東 智;林 良雄
• 通讯作者: 林 良雄

Effect of Conformational Restriction of 3-epi-Deoxynegamycin on Readthrough Activity

3-表-脱氧霉素的构象限制对通读活性的影响

• 发表时间: 2022
• 作者: Noriko Omura;Akihiro Taguchi;Keisuke Hamada;Tomoki Kuwahara;Mizuki Watanabe;Masanori Nakakuki;Sho Konno;Kentaro Takayama;Atsuhiko Taniguchi;Toshifumi Nomura;Satoshi Shuto;Yoshio Hayashi
• 通讯作者: Yoshio Hayashi