安定同位体ラベルーNMRスペクトルによる蛋白質の動的高次構造の研究

使用稳定同位素标记核磁共振谱研究蛋白质的动态构象

基本信息

  • 批准号:
    62220026
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.02万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Special Project Research
  • 财政年份:
    1987
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1987 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

蛋白性プロテアーゼ・インヒビターSSIの溶液内における立体構造の揺らぎは, SSIの機能と構造の理解にとって必須の情報である. 我々はSSIの主鎖カルボニル炭素のNMRシグナルを利用することにより, SSIにおける主鎖ポリペプチド構造の揺らぎについて詳しく検討した. 揺らぎ易い部分の特定には低温におけるSSIのカルボニル炭素NMRの線幅の比較が直接的情報を与える. N-末端数残基は結晶中において運動性が高いためか, 或いは静的なパッキング構造の乱れのいずれかにより, X線回折において電子密度が殆ど観測されない. 我々は会合状態にあると思われる高濃度SSI溶液を用いて, N-末端より6残基は溶液内において極めて高い運動性にあることを明瞭に示した. さらに, 詳細なスペクトルの温度依存性の測定などから結晶構造中, 温度因子の高い部分のカルボニル炭素シグナルの線幅が鋭いことを見出した. このような部分は50%重水中におけるカルボニル炭素シグナルの線型を利用するDEALS法を利用して明らかにできる場合も多い. SSIの機能との関連上最も重要な情報はサブチリシンとの複合体形成に伴う構造変化が, 阻害機能の発現機構とどのように関わってくるかを知ることにある. 遊離の状態でのSSIの立体構造の形成原理を解き明かすことによりこのような情報が得られると考え, SSIの立体構造が二つのドメインからなりたち, その一方の構造(ドメイン2)が機能発現に最も直接に関与すると考えることにより多くの事実が統一的に理解できる. SSIの機能を特徴づける阻害活性の広いスペクトルはこの機能ドメインのもつ本質的な柔らかさにより説明可能である. 今後は蛋白質の動的構造と機能との関わりの重要性を実験的に指摘するために, これらの仮説を出発点として種々のプロテアーゼとの複合体形成に伴うSSIの構造変化の多様性を実験的に証明する予定である.
Protein properties: protein, protein, protein. The main lock structure of SSI and carbon NMR system are discussed in detail. Comparison of carbon NMR amplitudes at low temperatures and low temperatures is a direct source of information. N-terminal residues are highly mobile in crystals, or relatively static in structures, X-ray retroflex electron densities, etc. The high concentration SSI solution was used in the N-terminal region, and the high mobility of the N-terminal region was demonstrated in the solution. In addition, the temperature dependence of the crystal structure was measured in detail. The DEALS method can be used in many cases. The most important information on SSI functions and relationships is the structural transformation of SSI complexes, the mechanism of SSI functions and the mechanism of SSI functions. The formation principle of SSI's three-dimensional structure in free state is explained clearly, and the information is obtained. The three-dimensional structure of SSI is divided into two parts, and one part of the structure (2) is directly related to the function realization. SSI's functional characteristics include: resistance activity, selection, function, nature, flexibility, description, possibility, etc. In the future, the structure and function of protein motion are related to the importance of protein development, and the complex formation of protein motion is accompanied by the structural transformation of SSI.

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
W.M.Westler, M. Kainosho H. Nagao, N. Tomonaga J.L. Markley: J. Amer. Chem. Soc.
W.M.Westler、M.Kainosho H.Nagao、N.Tomonaga J.L.Markley:J.Amer。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
甲斐荘,内田,長尾: 蛋白質・〓〓・〓素(別冊). 32. 40-55 (1987)
Kaisou、Uchida、Nagao:蛋白质/〓〓〓〓〓(分卷)32. 40-55 (1987)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kainosho, Nagao, Tsuji: Biochemistry. 26. 1068-1075 (1987)
Kainosho、Nagao、Tsuji:生物化学。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
甲斐荘・三宅・内田: 日本農芸化学会誌. 62.
Kaisho、Miyake 和 Uchida:日本农业化学学会杂志 62。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
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  • 通讯作者:
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  • 资助金额:
    $ 1.02万
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