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ヒトXPA蛋白質のRPA,及び損傷DNAとの複合体の立体構造解析

人类XPA蛋白与RPA和受损DNA复合物的三维结构分析

基本信息

批准号：
10165216
负责人：
池上貴久
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
起止时间：
1998 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10165216/
关键词：
色素性乾皮症 XPA 核磁気共鳴 NMR RPA 損傷DNA 遺伝子修復ヌクレオチド除去修復

项目摘要

1、 DNA、RPA70と相互作用する部位の決定核磁気共鳴の化学シフト摂動実験法により、ヒト遺伝子修復系蛋白質XPAの中央ドメインが、RPAの単鎖DNA結合ドメイン(RPA70_<181-422>)、あるいは、cisplatinによる損傷24-mer二本鎖DNAと結合する部位を同定した。その結果、亜鉛含有サブドメインはRPA70_<181-422>と相互作用し、C末側サブドメインのくぼみはDNAと相互作用することが分かった。従来より、転写因子などのzinc-fingerと核酸が相互作用する例が多く見い出されているが、XPAの亜鉛含有サブドメインは、蛋白質と相互作用する数少ない例の一つである。亜鉛含有サブドメインが負に帯電していることからも、DNAと静電的に反発しあうと推測できる。一方、DNAと相互作用するC末側サブドメインのくぼみは、ほぼDNAの直径と同じ大きさをもち、表面が正に帯電していることから、当結果と矛盾しないといえる。2、運動性の解析アミド^<15>N核の磁化の緩和時間の測定と解析から、XPA中央ドメインの分子全体および分子内部の運動性を解析した。その結果、分子全体の溶液内での回転拡散には異方性が存在することが分かった(回転拡散テンソルの主値の比率が1.38)。構造決定された分子座標の慣性テンソルの異方性は回転拡散テンソルの異方性とよく一致した。その異方性も考慮した内部運動の解析からC末側サブドメインのくぼみ領域が非常に柔軟であることが分かった。このくぼみの柔軟性は、XPA蛋白質が構造の異なるさまざまなDNA損傷に適応して結合し、それらを認識するために必要であると考察される。

1. The interaction between DNA and RPA70 was determined by nuclear magnetic resonance (NMR), chemical chemistry, chemical reaction, protein repair, XPA, RPA, RPA, cisplatin, cisplatin, DNA, 24-mer, and so on. The results show that there is a significant difference between lt;181 70 _ & RPA70 & RPA70-422gt, interaction, interaction. There are many examples of nucleic acid interaction, such as writing factor, zinc-finger, nucleic acid interaction, XPA, protein interaction, protein interaction and protein interaction. The message contains the reverse message of DNA quiet, the reverse of the message, the push of the button. On the one hand, the DNA interacts with each other. At the end of the day, the diameter of the DNA is the same as that of the other, the diameter of the interface is the same as that of the other, and the result is that there is a contradiction. 2. Dynamic analysis and lt;15>N nuclear magnetization analysis and time measurement analysis, and XPA central molecular dynamics analysis of all molecules. The results showed that there was a significant difference in the distribution of DNA in the molecular solution (the ratio of concentration to concentration was 1.38). It is determined that the molecular locus should be consistent with each other in terms of sex. At the end of the day, it is very flexible in the field of information management. This is because of the flexibility, XPA protein, and so on. The results show that the combination of DNA and protein is necessary.