重水素交換によるプロトカドヘリンCNR-EC1とインテグリンとの相互作用の解析
重水素交換によるプロトカドヘリンCNR-EC1とインテグリンとの相互作用の解析
批准号:
17048014
负责人:
池上 貴久
金额:
$3.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
中文摘要
CNRは、よく知られた細胞接着分子である古典的カドヘリンとは異なり、脳神経系において特異的に発現し、免疫系と同様に体細胞突然変異を通して、多様化組織化の機能をもつ多様化膜分子群として注目されている。そのCNRのEC1ドメインをNMRで解析した。低濃度、高pHというNMR測定にとっては不利な条件であったため、距離情報や角度情報だけでなく、残余双極子相互作用から得た方向情報も加えて立体構造の精密化を行った。古典的キドヘリンの立体構造と比較してみると、全体の構造については似ていたが、機能に関わる重要な部位でかなりの相違が見られた。例えば、古典的カドヘリンにおいて相手方分子のN末端領域を収容するための疎水性ポケットが存在しないこと、また、インテグリンと相互作用すると予想されるRGD配刻を含むループ部分が存在することなどが挙げられる。上記の相違点は、古典的カドヘリンとプロトカドヘリンの機能の違いに関わる部位と予想されたので、それを追求するための機能実験を行った。N-cadherinのEC1ドメインをCNRのEC1に置換した蛋白賛は凝集活性を示さなかった。このことから、CNR-EC1はN-cadherinのEC1とは異なり、同種親和性がないことが明らかとなった。これは、上記のCNR-EC1には疎水性ポケットが存在しないことをよく説明している。また、インテグリンを生やした動物細胞はCNR-EC1と接着した。以上より、CNR-EC1は古典的カドヘリンとは異なり、同種親和性ではなく、そのRGD配列でのインテグリンとの異種親和性を通して、脳神経系の形成に寄与していることが示唆された。
英文摘要
CNRは、よく知られた細胞接着分子である古典的カドヘリンとは異なり、脳神経系において特異的に発現し、免疫系と同様に体細胞突然変異を通して、多様化組織化の機能をもつ多様化膜分子群として注目されている。そのCNRのEC1ドメインをNMRで解析した。低濃度、高pHというNMR測定にとっては不利な条件であったため、距離情報や角度情報だけでなく、残余双極子相互作用から得た方向情報も加えて立体構造の精密化を行った。古典的キドヘリンの立体構造と比較してみると、全体の構造については似ていたが、機能に関わる重要な部位でかなりの相違が見られた。例えば、古典的カドヘリンにおいて相手方分子のN末端領域を収容するための疎水性ポケットが存在しないこと、また、インテグリンと相互作用すると予想されるRGD配刻を含むループ部分が存在することなどが挙げられる。上記の相違点は、古典的カドヘリンとプロトカドヘリンの機能の違いに関わる部位と予想されたので、それを追求するための機能実験を行った。N-cadherinのEC1ドメインをCNRのEC1に置換した蛋白賛は凝集活性を示さなかった。このことから、CNR-EC1はN-cadherinのEC1とは異なり、同種親和性がないことが明らかとなった。これは、上記のCNR-EC1には疎水性ポケットが存在しないことをよく説明している。また、インテグリンを生やした動物細胞はCNR-EC1と接着した。以上より、CNR-EC1は古典的カドヘリンとは異なり、同種親和性ではなく、そのRGD配列でのインテグリンとの異種親和性を通して、脳神経系の形成に寄与していることが示唆された。
期刊论文(2)
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科研奖励(0)
会议论文
Structure of the cadherin-related neuronal receptor/protocadherin-alpha first extracellular cadherin domain reveals diversity across cadherin families.
钙粘蛋白相关神经元受体/原钙粘蛋白-α第一个细胞外钙粘蛋白结构域的结构揭示了钙粘蛋白家族的多样性。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
The Journal of Biological Chemistry 281・44
影响因子:
--
作者:
[森下, 博文]
通讯作者:
博文
^1H, ^<13>C and ^<15>N resonance assignments of the first cadherin domain of Cadherin-related neuronal receptor (CNR) / protocadherin α
钙粘蛋白相关神经元受体(CNR)/原钙粘蛋白α的第一个钙粘蛋白结构域的^1H、^<13>C和^<15>N共振分配
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Biomolecular NMR 31・4
影响因子:
--
作者:
[海津 正賢(Umitsu, Masataka)]
通讯作者:
Masataka)
Structural Analysis of a Metabolic Enzyme Complex: Insights into Coupling between Glycolysis and Fermentation
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批准号:23K05667
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:池上 貴久
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依托单位:
環境に対応して機能を変えるホモ多量体酵素の動的構造変化の解析
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批准号:20K06509
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2020
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负责人:池上 貴久
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依托单位:
核磁気共鳴による藍色細菌時計蛋白質の相互作用とダイナミクスの研究
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批准号:19042016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.97万
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财政年份:2007
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负责人:池上 貴久
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依托单位:
新規カドヘリンファミリーCNR‐EC1のReelin相互作用による構造変化の解析
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批准号:16048218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2004
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负责人:池上 貴久
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依托单位:
酸化DNA修復酵素MutM,OGG1,MTH1の立体構造解析
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批准号:11146213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:池上 貴久
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依托单位:
ヒトXPA蛋白質のRPA,及び損傷DNAとの複合体の立体構造解析
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批准号:10165216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:池上 貴久
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依托单位:
海外基金