リボソーム蛋白質によるrRNAの構造構築と翻訳発現の制御

核糖体蛋白对 rRNA 结构构建和翻译表达的控制

• 批准号: 10174201
• 负责人: 田中 勲
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10174201/
• 关键词: リボソーム; リボソーム蛋白質; RNA; 翻訳

S7と結合する16S rRNAフラグメントは3'大ドメインの下部と特定されている.本研究では,そのフラグメントとS7との間での複合体の結晶化実験を行なった.Bacillus stearothermophilusのS7を大量に精製,一方,16S rRNAのフラグメント(926-986/1219-1393)はT7 RNA polymeraseを用いた転写系によって大量調製した.この際,リボザイムを末端につけることにより末端がそろったRNAを作ることができた.現在複合体の結晶化の準備中である.既に構造解析を行なったS7と16S rRNAのモデルとの複合体モデルをコンピュータグラフィクスを使って調べることにより,S7のリボソーム上での位置と向きを決定すると共にこれまで提出されていた16S rRNAのモデルが正しいことを示した(RNA印刷公表).ペプチジルトランスフェラーゼセンターにあるリボソームタンパク質L2のRNA結合ドメインの結晶化に成功し(J.Struct.Biol.印刷中)その立体構造解析を行なった.この構造解析により,リボソームの中で最大のL2タンパク質がドメインより構成されていること,それぞれのドメインは70残基ほどの大きさからなること,ドメイン間にRNA結合部位が存在することを示した(EMBO.J.印刷中).

S7と binds to する16S rRNAフラグメ ト ト <e:1> 3' large ドメ <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> る る る る る る る る る と specific されて されて る る る る. This study で は, そ の フ ラ グ メ ン ト と S7 と の between で の complex の crystallization be 験 を line な っ た. Bacillus stearothermophilus の S7 を に refined in great quantities, side, 16 s rRNA の フ ラ グ メ ン ト (926-986/1219-1393) は T7 has RNA Polymerase を with い た planning write system に よ っ て large modulation し た. こ の interstate, リ ボ ザ イ ム を end に つ け る こ と に よ り end が そ ろ っ た RNA を as る こ と が で き た. Now complex の crystallization の prepared で あ る. Both に structure line を な っ た S7 と 16 s rRNA の モ デ ル と の complex モ デ ル を コ ン ピ ュ ー タ グ ラ フ ィ ク ス を make っ て adjustable べ る こ と に よ り, S7 の リ ボ ソ ー ム on で と の position to き を decided す る と altogether に こ れ ま で proposed さ れ て い た 16 s RRNA の モ デ ル が is し い こ と を shown し た printing male table (RNA) ペ プ チ ジ ル ト ラ ン ス フ ェ ラ ー ゼ セ ン タ ー に あ る リ ボ ソ ー ム タ ン パ ク qualitative L2 の rna-binding ド メ イ ン の crystallization に し success (J.S truct. Biol. In press) そ の three-dimensional structure parsing line を な っ た. こ の structure に よ り, リ ボ ソ ー ム の で maximum の L2 タ ン パ ク qualitative が ド メ イ ン よ り constitute さ れ て い る こ と, そ れ ぞ れ の ド メ イ ン は 70 residues ほ ど の big き さ か ら な る こ と, ド メ イ ン に rna-binding part が exist between す る こ と を shown し た (EMBO. J. Printing in progress.

项目成果

T.Nakashima et.al.: "Crystallization and preliminary X-ray crystallographic structure of a235 rRNA binding domain of the ribosomal protein C2 from B.stearothermophilu" J.Struct.Biol.124. 99-101 (1998)

T.Nakashima 等人：“嗜热脂肪芽孢杆菌核糖体蛋白 C2 的 a235 rRNA 结合域的结晶和初步 X 射线晶体结构”J.Struct.Biol.124。

I.Tanaka et.al.: "Matching the Crystallographic structure of ribosomal protein S7 to a three-dimensional model of the 16S ribosomal RNA" RNA. 4. 542-555 (1998)

I.Tanaka 等人：“将核糖体蛋白 S7 的晶体结构与 16S 核糖体 RNA 的三维模型进行匹配”RNA。