疾病関連因子を制御する転写因子の構造解析

控制疾病相关因子的转录因子的结构分析

• 批准号: 05F05446
• 负责人: 田中 勲
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05F05446/
• 关键词: 構造生物学; 転写因子; 癌; 病関連因子; X線結晶構造解析; 疾病関連因子

Streptmyces coelicolor A3(2)由来SC06571の結晶の非対称単位中の6分子のそれぞれは,TIMバレル構造をとり,3つの2量体が,それぞれの持つ2回軸と直交する3回軸で会合して,全体として点群D_3に属していることがわかった.TIMバレルを持つ蛋白質には,さまざまな異なる反応を触媒する酵素が存在する.Daliサーバーを使ったホモロジー蛋白質のサーチによると,放線菌のキシロースイソメラーゼなど,イソメラーゼファミリー蛋白質が高いZスコアーを示した.しかし,これらホモログ蛋白質の会合状態はSC06571と異なっている.幾つかのものは単量体として働き,他のものは2量体や4量体として存在している,これらの中で2量体の会合状態がSC06571と最も似ているのは,D-fructose and D-psicoseの相互変換を触媒するDPEaseであった.しかし,SC06571の2量体会合の方が,DPEaseよりもさらに緊密な会合状態を示している.上に述べたように,SC06571では,さらにこれが会合して6量体の構造をとっているが,これはイソメラーゼファミリー蛋白質としてはじめての例である.この成果はProtein & Peptide Lettersに投稿,現在,印刷中である.また,昨年度までに大量発現,精製に成功していたetsがん遺伝子群転写因子EIAFについては,結晶化スクリーニングを実施し,さらに結晶化条件を精査することによって,回折実験可能な結晶を得ることに成功した.SPring-8でのデータ収集の結果,分解能3.5Å,空間群C2,格子定数はa=247Å,b=73.4Å,c=134.4Å,β=120.6°であることが判明した.現在,多波長異常散乱法による構造解析を行うために,Se-Met置換蛋白質を調製中である.

Streptmyces coelicolor A3(2) is derived from SC06571 and consists of 6 molecules in the asymmetric unit.TIM structure, 3 molecules in 2 molecules, 3 molecules in 2 axes, 3 axes in 3 axes, all of which belong to the point group D_3. TIM structure, 3 molecules in 3 axes, all of which belong to the point group D_3. The presence of different enzymes in the body of the organism.Dali serves as a catalyst for the development of protein. However, the convergence state of the rice bran protein is different from that of SC06571. A few of them are in a single volume, and the other two are in a single volume, and the DPEase is in a single volume. SC06571 - 2 volume convergence direction,DPEase SC06571 is the first to be incorporated into the structure of 6 molecules. Protein & Peptide Letters Submission, Now, Printing. In the past year, a large number of crystals were discovered and refined successfully, and the crystallization conditions were carefully investigated.SPring-8 was collected successfully, and the decomposition energy was 3.5, space group C2, lattice number was a=247,b=73.4,c=134.4. β=120.6°Now, multi-wavelength anomalous scattering method