X線精密構造解析のためのリボソームの結晶化
X線精密構造解析のためのリボソームの結晶化
批准号:
10878109
负责人:
田中 勲
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 2000
中文摘要
リボソームはmRNAの塩基配列に従ってポリペプチド鎖を正確に伸長し,タンパク質を合成する細胞内小器官である.しばしば,蛋白質合成工場に例えられる通り,遺伝暗号解読,ペプチジルトランスファー,トランスロケーション,分子的な校正など,生命にとって極めて重要でかつ複雑な仕事を整然と行なっており,その構造が決定された場合の生物科学全体に与えるインパクトは計り知れないものがある.本研究では,リボソームの原子レベルでの立体構造解析を行なうための,高分解能のX線回折を与える結晶を調製することを目的とした.このため,好気性の超好熱古細菌Aeropyrum pernix(至適生育温度90度)嫌気性の超好熱古細菌Pyrococcus horikoshii(至適生育温度98度),高度好熱真性細菌Rhodothermus obamensis,からリボソームを調製することを試みた.超遠心分離法,疎水性クロマトグラフィー,ショ糖連続密度勾配遠心法を用いて,70Sリボソーム,各サブユニットの調製方法を確立した.また,超遠心分離で粗精製した70Sリボソームは,さらに疎水クロマトグラフィーを用いることで,より純度高く精製することができることを確認した.すべてのリボソームサンプルについて,蛋白質合成活性を調べ,高温(70度)において活性があることを確認した.今後は,さらに結晶化条件の検討を行いX線構造解析に持ち込むことを計画している.
英文摘要
リボソームはmRNAの塩基配列に従ってポリペプチド鎖を正確に伸長し,タンパク質を合成する細胞内小器官である.しばしば,蛋白質合成工場に例えられる通り,遺伝暗号解読,ペプチジルトランスファー,トランスロケーション,分子的な校正など,生命にとって極めて重要でかつ複雑な仕事を整然と行なっており,その構造が決定された場合の生物科学全体に与えるインパクトは計り知れないものがある.本研究では,リボソームの原子レベルでの立体構造解析を行なうための,高分解能のX線回折を与える結晶を調製することを目的とした.このため,好気性の超好熱古細菌Aeropyrum pernix(至適生育温度90度)嫌気性の超好熱古細菌Pyrococcus horikoshii(至適生育温度98度),高度好熱真性細菌Rhodothermus obamensis,からリボソームを調製することを試みた.超遠心分離法,疎水性クロマトグラフィー,ショ糖連続密度勾配遠心法を用いて,70Sリボソーム,各サブユニットの調製方法を確立した.また,超遠心分離で粗精製した70Sリボソームは,さらに疎水クロマトグラフィーを用いることで,より純度高く精製することができることを確認した.すべてのリボソームサンプルについて,蛋白質合成活性を調べ,高温(70度)において活性があることを確認した.今後は,さらに結晶化条件の検討を行いX線構造解析に持ち込むことを計画している.
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A.Miyamoto et al.: "Role of the N-terminal region of ribosomal protein S7 in its interaction with 16S rRNA which binds to the concavity formed by the β-ribbon arm and the α-helix"Eur.J.Biochem.. 266. 591-598 (1999)
A.Miyamoto 等人:“核糖体蛋白 S7 的 N 末端区域在与 16S rRNA 相互作用中的作用,16S rRNA 与 β-带臂和 α-螺旋形成的凹面结合”Eur.J.Biochem.。 266.591-598 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M.Yao et al.: "Crystal structure of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase from Hansenula saturnus"J.Biol.Chem.. 275. 34557-34565 (2000)
M.Yao 等:“来自汉逊酵母的 1-氨基环丙烷-1-羧酸脱氨酶的晶体结构”J.Biol.Chem.. 275. 34557-34565 (2000)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
I.Tanaka et al.: "The Ribosome : Structure,Function,Antibiotics,and Cellular Interactions"R.A.Garret,S.R.Douthwaite,A.Liljas,A.T.Matheson,P.B.Moore,and H.F.Noller. 565 (2000)
I.Tanaka 等人:“核糖体:结构、功能、抗生素和细胞相互作用”R.A.Garret、S.R.Douthwaite、A.Liljas、A.T.Matheson、P.B.Moore 和 H.F.Noller。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
I.Tanaka et.al.: "Matching the Crystallographic structure of ribosomal protein S7 to a three-dimensional model of the 16S ribosomal RNA" RNA. 4. 542-555 (1998)
I.Tanaka 等人:“将核糖体蛋白 S7 的晶体结构与 16S 核糖体 RNA 的三维模型进行匹配”RNA。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
K.Kitano et al.: "Utilization of microgravity to improve the crystal quality of biologically important proteins : chaperonin-60, GrpE, B-subunit of V-type ATPase, and MIF"J.Cryst.Groth. 210. 819-823 (2000)
K.Kitano 等人:“利用微重力提高生物学重要蛋白质的晶体质量:伴侣蛋白 60、GrpE、V 型 ATP 酶的 B 亚基和 MIF”J.Cryst.Groth。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
力学的応答測定を利用した極微小タンパク質結晶の判別・評価法の開発
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批准号:21657026
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2009
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负责人:田中 勲
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依托单位:
疾病関連因子を制御する転写因子の構造解析
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批准号:05F05446
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2005
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负责人:田中 勲
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依托单位:
RNA-蛋白質複合体マシーナリー・リボソームの構造研究
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批准号:11169201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$45.31万
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财政年份:2001
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负责人:田中 勲
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依托单位:
リボソーム蛋白質によるrRNAの構造構築と翻訳発現の制御
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批准号:10174201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:田中 勲
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依托单位:
カルシウム結合リゾチ-ムのX線結晶構造解析
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批准号:03680046
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1991
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负责人:田中 勲
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依托单位:
高度好熱菌DNA結合蛋白質のX線結晶構造解析
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批准号:61580138
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1986
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负责人:田中 勲
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依托单位:
高度好熱菌のリボソーマルタンパク質のX線構造解析
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批准号:60780296
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1985
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负责人:田中 勲
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依托单位:
ボーマンバークタイプインヒビター及びその複合体の構造研究
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批准号:56790184
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.61万
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财政年份:1981
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负责人:田中 勲
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依托单位:
エラスチン弾性の分子構造学的な解明
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批准号:X00210----479194
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.4万
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财政年份:1979
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负责人:田中 勲
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依托单位:
海外基金