ゲノムの流動性をもたらす利己的遺伝子系

自私的基因系统导致基因组流动性

• 批准号: 11149204
• 负责人: 小林 一三
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11149204/
• 关键词: ゲノム進化; 多様性; ガノム再編; 遺伝子組換え; 相同組換え; 制限酵素; ゲノムメチル化

A)染色体上の制限修飾遺伝子によってドライブされるゲノム再編大腸菌染色体にPaeR7I制限修飾遺伝子を挿入し、これを形質導入での相同組み換えによって相同なDNAで置き換えようとした。このときにゲノムに起きる大規模なリアレンジメントの構造を、レアカッターによる制限分析、パルスフィールドゲル電気泳動、サザン法、インバースPCR、シークエンシングによって解析し、トランスポゾンIS3間の不等交差による染色体の大規模重複・逆位が起きていることを証明した。枯草菌染色体にBamHI制限修飾遺伝子を挿入し、これを自然形質転換での相同組み換えによって相同なDNAで置き換える系で、制限修飾遺伝子による抵抗を検出した。B)近緑細菌ゲノム配列の比較からの、制限修飾遺伝子による新しいゲノム多型形成の機構の発見二つのピロリ菌全ゲノム中の制限修飾遺伝子を比較して、制限修飾遺伝子が水平伝達していることの証拠を得た。また、制限修飾遺伝子が関与するらしい「長い標的DNAの重複を伴う遺伝子挿入」という遺伝子伝達機構を発見した。それを制限修飾遺伝子の利己的なふるまいと関係づけるモデルを提出した。C)大腸菌のRecBCD酵素によるカイ配列の認識の役割制限修飾遺伝子喪失後に起きる染色体切断と分離後宿主殺しに、カイ配列を認識するRecBCD酵素が重要であることを証明した。同様に、酸化的損傷などによって自然に起きる染色体切断にもRecBCDカイ系が重要であることをパルスフィールドゲル電気泳動で示した。D)遺伝子間ホモロジー相互作用と制限酵素作用に依存する非相同組換え「ホモロジー相互作用と1型の制限酵素によって引き起こされる非相同組換え」に関与する遺伝子産物を同定した。二つの遺伝子のホモロジーが無くなる端で起きる非相同組換えの産物を解析した。

A) Restriction modification gene on chromosome B) Restriction modification gene on chromosome A) Restriction modification gene on chromosome B) Restriction modification gene C) Restriction gene on chromosome A) Restriction modification gene C) Restriction gene on chromosome B) Restriction gene C) Restriction gene on chromosome A) Restriction gene C) Restriction gene This paper demonstrates the structure of large-scale chromosome duplication, restriction analysis, electrokinetic analysis, separation method, PCR, chromosome duplication analysis, heterojunction analysis, chromosome inversion analysis, etc. Bacillus subtilis chromosome BamHI restriction modification gene insertion, transformation of the same group, DNA substitution, restriction modification gene detection B) Comparison of gene sequences, restriction modifiers, novel genes, and mechanisms for the formation of polytypes in near-green bacteria. Comparison of gene sequences, restriction modifiers, and mechanisms for the formation of polytypes in near-green bacteria. "DNA duplication in long target DNA" and "DNA detection mechanism" are found in the following documents: The relationship between the two groups is discussed in detail. C) RecBCD enzyme recognition of gene alignment in Escherichia coli is important after chromosome cleavage and host-killing after gene loss. The same is true for the DNA damage caused by DNA sequencing. D) The interaction between genes and restriction enzymes depends on different components. The interaction between genes and restriction enzymes depends on different components. The second is to analyze the products of different combinations.

项目成果

半田直史: "ゲノムにとっての自己と非自己"臨床免疫. 31. 222-227 (1999)

Naofumi Handa：“基因组的自我和非自我”临床免疫学 31. 222-227 (1999)。

N. Handa: "Post-segregational killing by restriction modification gene compexes: obervations of individual cell deaths"Biochem.. 81. 931-938 (1999)

N. Handa：“限制性修饰基因复合物的分离后杀伤：个体细胞死亡的观察”Biochem.. 81. 931-938 (1999)