ゲノムの流動性をもたらす利己的遺伝子系
ゲノムの流動性をもたらす利己的遺伝子系
批准号:
11149204
负责人:
小林 一三
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 --
中文摘要
A)染色体上の制限修飾遺伝子によってドライブされるゲノム再編大腸菌染色体にPaeR7I制限修飾遺伝子を挿入し、これを形質導入での相同組み換えによって相同なDNAで置き換えようとした。このときにゲノムに起きる大規模なリアレンジメントの構造を、レアカッターによる制限分析、パルスフィールドゲル電気泳動、サザン法、インバースPCR、シークエンシングによって解析し、トランスポゾンIS3間の不等交差による染色体の大規模重複・逆位が起きていることを証明した。枯草菌染色体にBamHI制限修飾遺伝子を挿入し、これを自然形質転換での相同組み換えによって相同なDNAで置き換える系で、制限修飾遺伝子による抵抗を検出した。B)近緑細菌ゲノム配列の比較からの、制限修飾遺伝子による新しいゲノム多型形成の機構の発見二つのピロリ菌全ゲノム中の制限修飾遺伝子を比較して、制限修飾遺伝子が水平伝達していることの証拠を得た。また、制限修飾遺伝子が関与するらしい「長い標的DNAの重複を伴う遺伝子挿入」という遺伝子伝達機構を発見した。それを制限修飾遺伝子の利己的なふるまいと関係づけるモデルを提出した。C)大腸菌のRecBCD酵素によるカイ配列の認識の役割制限修飾遺伝子喪失後に起きる染色体切断と分離後宿主殺しに、カイ配列を認識するRecBCD酵素が重要であることを証明した。同様に、酸化的損傷などによって自然に起きる染色体切断にもRecBCDカイ系が重要であることをパルスフィールドゲル電気泳動で示した。D)遺伝子間ホモロジー相互作用と制限酵素作用に依存する非相同組換え「ホモロジー相互作用と1型の制限酵素によって引き起こされる非相同組換え」に関与する遺伝子産物を同定した。二つの遺伝子のホモロジーが無くなる端で起きる非相同組換えの産物を解析した。
英文摘要
A)染色体上の制限修飾遺伝子によってドライブされるゲノム再編大腸菌染色体にPaeR7I制限修飾遺伝子を挿入し、これを形質導入での相同組み換えによって相同なDNAで置き換えようとした。このときにゲノムに起きる大規模なリアレンジメントの構造を、レアカッターによる制限分析、パルスフィールドゲル電気泳動、サザン法、インバースPCR、シークエンシングによって解析し、トランスポゾンIS3間の不等交差による染色体の大規模重複・逆位が起きていることを証明した。枯草菌染色体にBamHI制限修飾遺伝子を挿入し、これを自然形質転換での相同組み換えによって相同なDNAで置き換える系で、制限修飾遺伝子による抵抗を検出した。B)近緑細菌ゲノム配列の比較からの、制限修飾遺伝子による新しいゲノム多型形成の機構の発見二つのピロリ菌全ゲノム中の制限修飾遺伝子を比較して、制限修飾遺伝子が水平伝達していることの証拠を得た。また、制限修飾遺伝子が関与するらしい「長い標的DNAの重複を伴う遺伝子挿入」という遺伝子伝達機構を発見した。それを制限修飾遺伝子の利己的なふるまいと関係づけるモデルを提出した。C)大腸菌のRecBCD酵素によるカイ配列の認識の役割制限修飾遺伝子喪失後に起きる染色体切断と分離後宿主殺しに、カイ配列を認識するRecBCD酵素が重要であることを証明した。同様に、酸化的損傷などによって自然に起きる染色体切断にもRecBCDカイ系が重要であることをパルスフィールドゲル電気泳動で示した。D)遺伝子間ホモロジー相互作用と制限酵素作用に依存する非相同組換え「ホモロジー相互作用と1型の制限酵素によって引き起こされる非相同組換え」に関与する遺伝子産物を同定した。二つの遺伝子のホモロジーが無くなる端で起きる非相同組換えの産物を解析した。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
半田直史: "ゲノムにとっての自己と非自己"臨床免疫. 31. 222-227 (1999)
Naofumi Handa:“基因组的自我和非自我”临床免疫学 31. 222-227 (1999)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
N. Handa: "Post-segregational killing by restriction modification gene compexes: obervations of individual cell deaths"Biochem.. 81. 931-938 (1999)
N. Handa:“限制性修饰基因复合物的分离后杀伤:个体细胞死亡的观察”Biochem.. 81. 931-938 (1999)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Thousands of adaptive changes emerging from thousands of genomes within a species
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批准号:23K05735
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2023
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限酵素修飾酵素遺伝子の利己的ライフサイクル:転移・増幅・伝達の実験室での再現
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批准号:19657002
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2007
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负责人:小林 一三
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依托单位:
ゲノム情報にもとづいた新規立体構造をもつ制限酵素の探索と機能解析
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批准号:07F07420
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2007
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限修飾酵素による遺伝子発現制御と、その制限修飾遺伝子(病原体)・ゲノム(宿主)相互作用での役割
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批准号:03F03312
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2004
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限酵素修飾酵素遺伝子の自己増殖
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批准号:03F03103
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2003
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限酵素修飾酵素遺伝子の自己増殖
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批准号:03F00103
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2003
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限修飾酵素による遺伝子発現制御と、その制限修飾遺伝子(病原体)・ゲノム(宿主)相互作用での役割
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批准号:03F00312
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2003
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限酵素修飾酵素遺伝子によるゲノムの存続と進化に関する実験的情報学的研究
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批准号:13206015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.52万
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财政年份:2001
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限酵素修飾酵素遺伝子によるゲノムの存続と進化に関する実験的情報学的研究
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批准号:12206026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:小林 一三
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依托单位:
ゲノムのアイデンティティーを規定する利己的な遺伝子
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批准号:10168204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1998
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负责人:小林 一三
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依托单位:
細菌ゲノムのアイデンティティーを規定する利己的な遺伝子
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批准号:09272207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:1997
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负责人:小林 一三
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依托单位:
制限修飾遺伝子の自己維持機能を利用したプラスミド安定化
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批准号:09558085
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$8.19万
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财政年份:1997
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负责人:小林 一三
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依托单位:
病原体としての制限酵素修飾酵素
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批准号:09877032
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:小林 一三
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依托单位:
「分子寄生体」としての制限酵素と宿主の共進化
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批准号:08257205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:小林 一三
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依托单位:
「超利己的遺伝子」単位としての制限修飾系
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批准号:08640784
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1996
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负责人:小林 一三
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依托单位:
メカニズムの理解にもとづく標的遺伝子組換えの改良
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批准号:07260205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:小林 一三
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依托单位:
がん細胞の遺伝子的不安定性の新しいメカニズム
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批准号:06280210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.66万
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财政年份:1994
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负责人:小林 一三
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依托单位:
ゲノムの進化と遺伝子組換えの進化
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批准号:06273211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1994
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负责人:小林 一三
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依托单位:
プログラム細胞死における破壊的遺伝子組換えの役割
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批准号:05268208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1993
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负责人:小林 一三
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依托单位:
エナメル上皮腫の臨床的病理学的研究-RIシンチグラフィーによる再発の早期診断法-
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批准号:04771673
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1992
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负责人:小林 一三
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依托单位:
海外基金