制限酵素修飾酵素遺伝子の利己的ライフサイクル:転移・増幅・伝達の実験室での再現
限制酶修饰酶基因的自私生命周期:转移、扩增和传播的实验室复制。
基本信息
- 批准号:19657002
- 负责人:
- 金额:$ 2.3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2007
- 资助国家:日本
- 起止时间:2007 至 2008
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
(A)転移の再現系。PaeR71制限修飾遺伝子を複製が高温感受性のプラスミドに連結し、高温へのシフトを行い、染色体のISとのCo-integrate形成による染色体への転移など、3つのタイプの産物が観察されていた。制限酵素活性を欠損するコントロールでも細胞数の増加が起きないように、抗生物質で処理し続けたところ、制限酵素の活性に依存して転移産物の頻度が選択的に増加する事が示された。マイトマイシンC処理では、制限酵素活性を欠いたコントロールでも頻度の上昇を観察した。(B)増幅の再現系。大腸菌染色体上でEcoRI制限修飾遺伝子がいったんタンデムに増幅すると、制限酵素活性に依存して、その状態が維持されることを示した。これは、突然変異生成の機構に関連する発見である。枯草菌染色体でBamHI制限修飾遺伝子と抗生物質耐性遺伝子からなる単位をタンデムに増幅させた場合、その産物の抗生物質耐性遺伝子産物活性がコピー数に比例して上昇するが、BamHI制限酵素の活性はそれほど増加しないことを示した。これは、制限修飾系の自己増殖が遺伝子産物の発現に有効であることを示す。黄色ブドウ球菌10株のゲノム配列での、タンデムなパラログ・クラスターを分子系統学的手法で解析し、「遺伝子の中央の保存部分の間での組み換えによるゲノム再編」「遺伝子の3'部分プラス下流の遺伝子の5'部分が単位になっている」という進化機構を示唆した。これは、種内多数株のゲノム配列比較によって進化機構を明らかにした例となった。(C)伝達の再現系。染色体でBamHI遺伝子を増幅させた枯草菌から抽出したゲノムDNAをドナーとして自然形質転換を行い、増幅による形質転換体の頻度の上昇を調べた。
(A)The system of reproduction of the shift. PaeR71 restriction modifier gene replication, high temperature sensitivity, high temperature response, chromosome IS and Co-integration, chromosome shift, 3-factor response products were observed. The increase in cell count due to lack of restriction enzyme activity, the dependence of antibiotic treatment on restriction enzyme activity, and the increase in the frequency of shift products due to selection were shown. The frequency of enzyme activity was detected. (B)Increase amplitude of reproduction system. E. coli chromosome EcoRI restriction modification gene increases in amplitude, restricts enzyme activity, and maintains its status The sudden change in the structure of the relationship between The activity of BamHI restriction enzyme in Bacillus subtilis chromosome was increased when the activity of BamHI restriction enzyme increased. This restriction modification system is responsible for the development of genetic products. The molecular phylogenetic analysis of the 10 strains of Pseudomonas flava was carried out. The molecular phylogenetic analysis was carried out."The composition of the central part of the gene was changed.""The 3'part of the gene was changed. The 5' part of the gene was changed." A comparison of the arrangement of most plants within a species shows that the evolutionary mechanism is different from that of other species. (C)Reproduction of the system. Chromosome BamHI gene amplification is regulated by the increase in the frequency of chromosome DNA amplification.
项目成果
期刊论文数量(30)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
種内多ゲノム比較:黄色プドウ球菌パラログ遺伝子群のORFを進化単位としない再編多様化
种内多基因组比较:不使用金黄色葡萄球菌旁系同源基因组的ORF作为进化单位的重组和多样化
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:鶴剛史;小林一三
- 通讯作者:小林一三
Death through chromosomal breakage
因染色体断裂而死亡
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:古田芳一;鶴剛史;半田直史;小林一三;Kobayashi I
- 通讯作者:Kobayashi I
利己的制限修飾遺伝子間に起きる、ゲノム上のメチル化サイトの取り合いが、ホスト殺しをもたらす
自私的限制性修饰基因之间对基因组上甲基化位点的竞争导致宿主死亡
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Marat Sadykov;半田直史;鶴剛史;小林一三
- 通讯作者:小林一三
種内多ゲノム比較:病原性関連パラログ遺伝子群のORFを進化単位としない再編多様化
种内多基因组比较:不以 ORF 作为进化单位的致病性相关旁系同源基因组的重组和多样化
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:中野良美;河野孝夫;日比輝正;河野志織;馬場敦;御子柴克彦;中嶋一範;服部光治;鶴剛史;Takeshi Tsuru;鶴剛史
- 通讯作者:鶴剛史
DNA結合タンパク質の構造ゲノム科学:メタゲノム・データの活用によるGIY-YIGファミリーのサブファミリーの発見
DNA 结合蛋白的结构基因组学:利用宏基因组数据发现 GIY-YIG 家族的亚家族
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Katarznya H. Kaminska;河合幹彦、Michal Boniecki;小林一三、Janusz M. Bujnicki
- 通讯作者:小林一三、Janusz M. Bujnicki
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小林 一三其他文献
A RESEARCH ON FORM AND CONSTRUCTION OF STONE HUTS ON MT. FUJI
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- 影响因子:0
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- 影响因子:0
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
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- 发表时间:
2006 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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$ 2.3万 - 项目类别:
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11149204 - 财政年份:1999
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$ 2.3万 - 项目类别:
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