课题基金 / 基金详情

ゲノム情報を利用した転写因子の標的遺伝子単離法の開発

ゲノム情報を利用した転写因子の標的遺伝子単離法の開発
利用基因组信息开发转录因子靶基因分离方法
批准号：
11149216
负责人：
高橋 直樹
金额：
$1.6万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1999
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1999 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11149216/
关键词：
転写調節動物発生ホメオボックス線虫ゲノム情報標的遺伝子

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
高等植物の発生過程は多くの転写因子の空間的、時間的に特異な発現によってコントロールされていると考えられる。ホメオボックスやZnフィンガーなどのモチーフを利用したスクリーニングやゲノムプロジェクトなどによって、これまでに数多くの転写因子をコードする遺伝子がクローン化されてきた。しかしこれらの転写因子が発現制御する標的遺伝子群についてはほとんど明らかにされていない。我々はマウスを実験材料として、転写因子の抗体を用いた標的遺伝子クローン化法を開発し、Hox遺伝子のいくつかの標的遺伝子を特定してきた。本研究の目的は、ゲノム情報の明らかになっている線虫をモデル動物として、効率の良い標的遺伝子群の単離法を開発し、多くの動物種で保存されている、発生過程における転写調節機構を明らかにすることである。昨年度作製したタグ付き転写因子導入線虫個体を用いて、転写因子が生体内で結合している配列を濃縮したDNAプールを調製した。この中に濃縮された配列(標的配列)をゲノムDNAチップを用いて検出することができることを示すためにチップを試作し、条件の検討を行った。昨年度作製した、短い(約100bp)線虫ゲノムDNA断片をλgt10ベクターに組み込んだライブラリーを用い、その挿入配列をPCR法によって調製した。このゲノム断片をスポットしたゲノムDNAチップを試作した。線虫全ゲノム中の標的配列を明らかにするためには、10万スポットのチップを必要とするが、今回は1000スポットのチップを作製し、ラジオアイソトープラベルプローブによる検出、Cy3,Cy5を用いた comparative hybridizationなどの条件について検討を行った。
英文摘要
高等植物の発生過程は多くの転写因子の空間的、時間的に特異な発現によってコントロールされていると考えられる。ホメオボックスやZnフィンガーなどのモチーフを利用したスクリーニングやゲノムプロジェクトなどによって、これまでに数多くの転写因子をコードする遺伝子がクローン化されてきた。しかしこれらの転写因子が発現制御する標的遺伝子群についてはほとんど明らかにされていない。我々はマウスを実験材料として、転写因子の抗体を用いた標的遺伝子クローン化法を開発し、Hox遺伝子のいくつかの標的遺伝子を特定してきた。本研究の目的は、ゲノム情報の明らかになっている線虫をモデル動物として、効率の良い標的遺伝子群の単離法を開発し、多くの動物種で保存されている、発生過程における転写調節機構を明らかにすることである。昨年度作製したタグ付き転写因子導入線虫個体を用いて、転写因子が生体内で結合している配列を濃縮したDNAプールを調製した。この中に濃縮された配列(標的配列)をゲノムDNAチップを用いて検出することができることを示すためにチップを試作し、条件の検討を行った。昨年度作製した、短い(約100bp)線虫ゲノムDNA断片をλgt10ベクターに組み込んだライブラリーを用い、その挿入配列をPCR法によって調製した。このゲノム断片をスポットしたゲノムDNAチップを試作した。線虫全ゲノム中の標的配列を明らかにするためには、10万スポットのチップを必要とするが、今回は1000スポットのチップを作製し、ラジオアイソトープラベルプローブによる検出、Cy3,Cy5を用いた comparative hybridizationなどの条件について検討を行った。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Takeuchi,J.K.et.al: "Tbx5 and Tbx4 genes determine the wing/leg identify of limb buds"Nature. 398. 810-814 (1999)
Takeuchi，J.K.等人：“Tbx5 和 Tbx4 基因决定肢芽的翼/腿识别”自然。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
データ伝送エネルギーコスト低減を目指す高効率Si基板上半導体薄膜レーザ実現
  • 批准号：
    23KJ0935
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.15万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
食品に含まれる催奇性の新しい検出法の開発
  • 批准号：
    19658051
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.24万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Mab21遺伝子の性行動制御機構の解明
  • 批准号：
    19040005
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $4.16万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
2光子励起顕微鏡によるinvivo観察のための固定具の開発
  • 批准号：
    18920006
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
  • 资助金额：
    $0.42万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    生理学研究所 技術課
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