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免疫精製法を用いた転写ネットワークの解析

免疫精製法を用いた転写ネットワークの解析
使用免疫纯化方法分析转录网络
批准号：
13206048
负责人：
高橋 直樹
金额：
$4.16万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2001 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13206048/
关键词：
転写調節DNAマイクロアレイ酵母転写因子蛋白DNA相互作用システムバイオロジー

项目摘要

项目成果

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遺伝子の特異的転写は、遺伝子の近傍に存在するシスエレメントに複数の転写因子が結合することによって、実現されていると考えられる。極めて多くの転写因子をコードすると考えられる遺伝子がこれまでに同定されているが、それらの転写因子のほとんどについては、その機能が明らかにされていない。本研究の目的は、酵母をモデルとし、特異的配列の認識によって転写調節に関わっていると考えられる蛋白群について、それらの細胞内での全結合配列をDNAアレイを用いて同定するという研究法を開発し、転写ネットワークの全容を明らかにすることである。今年度は、20の様々なタイプの転写因子について、HAタグを結合した遺伝子を相同組み替えで酵母に導入し、タグを利用して濃縮したDNAを用いたゲノム中の全in vivo結合配列の同定をマイクロアレイでおこなった。その結果は下記の3つのグループに分類された。1.MATα2,MCM1のように十分な濃縮が確認でき、全ゲノム中の標的配列を検出できていると考えられるもの(特にMATα2は、全ての既知標的遺伝子の特定ができた)。2.YDR451,YOX1のように、有意な結果は得られたが、濃縮の程度が十分でないため標的配列を確実に検出できないもの。3.CRZ1のように特異的濃縮が確認できなかったもの。これらの結果から本研究法の有用性が明らかになったとともに、約200と考えられる酵母転写因子について解析を行うことによって転写ネットワークの全容を明らかにできる可能性が示された。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
高橋直樹 他: "生物薬科学実験講座8 遺伝子"廣川書店(印刷中). (2002)
高桥直树等：《生物制药科学实验课程 8 基因》广川书店（2002 年出版）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Kojima, T. et al.: "Cell-type non-selective transcription of mouse and human genes encoding neural-restrietive silencer factor"Molecular Brain Research. 90. 174-186 (2001)
Kojima, T. 等人：“编码神经抑制沉默因子的小鼠和人类基因的细胞类型非选择性转录”分子脑研究。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Kojima, T. et al.: "Genomic organization of the full-length Sck/ShcB : specific association of p68-Sck/ShcB with pp135"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 284. 1039-1047 (2001)
Kojima, T. 等人：“全长 Sck/ShcB 的基因组组织：p68-Sck/ShcB 与 pp135 的特异性关联”Biochem。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
データ伝送エネルギーコスト低減を目指す高効率Si基板上半導体薄膜レーザ実現
  • 批准号：
    23KJ0935
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.15万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
食品に含まれる催奇性の新しい検出法の開発
  • 批准号：
    19658051
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.24万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Mab21遺伝子の性行動制御機構の解明
  • 批准号：
    19040005
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $4.16万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
2光子励起顕微鏡によるinvivo観察のための固定具の開発
  • 批准号：
    18920006
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
  • 资助金额：
    $0.42万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    生理学研究所 技術課
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