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ゲノム情報を利用した転写因子の標的遺伝子単離法の開発

ゲノム情報を利用した転写因子の標的遺伝子単離法の開発
利用基因组信息开发转录因子靶基因分离方法
批准号：
12024217
负责人：
高橋 直樹
金额：
$1.6万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2000 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12024217/
关键词：
転写因子標的遺伝子ゲノムDNAアレイモデル生物

项目摘要

项目成果

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ゲノム情報を利用した標的遺伝子群の単離法の確立を目指し、全ゲノム配列の明らかになっている線虫および酵母をモデル生物として、実験法の検討を行った。標的配列の効率的な単離のため、これまで用いていた転写因子の特異的抗体による精製に代わって、タグ付き遺伝子導入個体を作製し、そのタグを利用した標的配列の単離が可能であるかどうか検討した。さらに全ゲノムレベルでの単離を行うためゲノムDNAアレイを用いた標的配列同定法の検討も行った。酵母ゲノムDNAアレイとしてaffymetrixの非翻訳領域を含むオリゴチップおよびORFチップを用いたが、両チップともHAタグを用いた精製DNAによってMATα2の標的遺伝子の特異的検出ができた。次に全ゲノム配列が明らかになっている多細胞生物である線虫で同様な解析を行うため以下の実験を行った。転写因子にタグを結合した遺伝子を導入したトランスジエニック個体において、導入遺伝子は線虫のミュータントフェノタイプをレスキューした。このことはタグ付き転写因子が正常蛋白と同様の標的遺伝子群の制御をしていることを示しており、タグを用いた標的配列の単離が可能であると考えられる。線虫は酵母と違い転写調節領域がかならずしもORF近傍(1kb内)に存在するするとは考えられないので、全ゲノムをスクリーニングするためには10万スポットのゲノムチップを作製する必要があるが、予備実験として1000スポットのゲノムチップを試作し、ゲノム中の標的配列を10倍以上濃縮できれば標的遺伝子を特定できることを確認した。
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会议论文
データ伝送エネルギーコスト低減を目指す高効率Si基板上半導体薄膜レーザ実現
  • 批准号：
    23KJ0935
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.15万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
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  • 批准号：
    19658051
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    $2.24万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
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  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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    $4.16万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
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    18920006
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  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    高橋 直樹
  • 依托单位：
    生理学研究所 技術課
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