权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

シグナル配列を有する新規ORF翻訳産物の生理活性の探索法の開発

开发一种用信号序列探索新型 ORF 翻译产物生理活性的方法

基本信息

批准号：
11877019
负责人：
油谷浩幸
金额：
$ 0.45万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至 2000
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年6月にヒトゲノム配列の概要版が完成し、塩基配列にもとづいて新規のORF(Open Reading Frame)産物を同定することが可能となった。1.ゲノム配列からの7回膜貫通型受容体遺伝子の同定工業技術院電子総合研究所の諏訪らのグループと共同してドラフト配列からの遺伝子予測を行った。6つ全てのフレームから一定の長さ以上のORFをSwissprotに登録されている7_tmタンパク1,169個に対してBLAST検索を行った。また、SosuiやEngelmanのアルゴリズムによって膜貫通ドメイン数を予測して配列上では相同性の低いタンパクについての抽出も試みた。既知遺伝子を含めて1,000を越えるクローンがユニークな7_tmタンパクと考えられた。今後、オリゴヌクレオチドマイクロアレイを用いて発現プロファイルから組織特異性や薬剤応答性について検討を加える予定である。2.機能未知のタンパク質によるシグナル伝達系の探索予め各種レポーター遺伝子を組み込んだ培養細胞系を準備する。機能未知の新規遺伝子を発現ベクターに組み込み、上記の細胞系にトランスフエクションすることによって何れのシグナル伝達系が作動するかを解析することができる。同時にGeneChip解析を行うことにより、ネットワーク解析あるいはシミュレーションのための重要なデータになるものと期待される。3.アッセイ系としては、FRETを用いての相互作用の検出に着手している。

Last June, the outline version of the Open Reading Frame was completed, and the new ORF(Open Reading Frame) product was finalized. 1. The research and development of the seven-film through-type receptor in the Institute of Electronics of the National Institute of Industrial Technology 6. All ORFs of a certain length were registered in Swissprot, and 1,169 ORFs were registered in Swissprot. For example, Sosui-Engelman's search engine can predict the number of membrane penetration devices and the number of extraction devices with low similarity. It is known that the original son contains In the future, the development of tissue-specific agents will be discussed in the future. 2. To explore the cell lines with unknown function and to prepare the cell lines for culture. The new gene with unknown function was discovered in the cell line and analyzed in the cell line. At the same time, GeneChip analysis is very important. 3. The interaction between FRET and NAPSO is discussed.