癌抑制遺伝子座のゲノム構造解析:ゲノムシークエンシングによる発癌機構の解明

抑癌基因座的基因组结构分析：通过基因组测序阐明致癌机制

• 批准号: 08283202
• 负责人: 油谷 浩幸
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08283202/
• 关键词: 癌抑制遺伝子; 染色体欠失; FHIT; 胃癌; 癌遺伝学

本研究においてはゲノム全体を対象として発癌の過程に関与する遺伝子変異を捕らえることを目指している。1.染色体欠失領域の検出 RDA法を用いて胃癌細胞株2MD3及び同一症例からの健常部DNA(NF8)との間でサブトラクションハイブリダイゼーションを繰り返し行なうことによって、健常部のみに存在するDNA、すなわち癌部に欠失したDNA断片のみを変異産物として特異的に増幅した。RDA産物の塩基配列を決定し、Sequence Tagged Site(STS)を作成した。2.欠失領域のクローン化と染色体マッピング 上述のSTSを用いて雑種細胞パネルをスクリーニングし、局在する染色体を決定した。CEPH YACライブラリーのスクリーニングの結果からより精密な局在化ができた。欠失領域のクローン化にはBACクローンを用いた。ゲノムデータベースを活用し、遺伝子座近傍に存在する候補遺伝子を検索した。7-14(1p),7-61(3p distal),7-50(16q23)及び7-20(3p14)の4つのホモ欠失産物が得られ、7-50及び7-20は2Mから2MD3への転化の過程において生じた欠失であった。一例として7-50(16q23)周囲のマーカーとの位置関係を示す。D16S518○-afma336yg9○-WI-2755●-D16S3029○-D16S504○(○:retention,●:deletion)であり、欠失領域はおよそ1Mb以内に限定された。3.FHIT遺伝子の構造解析 胃癌細胞株2MD3において検出された3p14におけるホモ欠失部位に報告されたFHIT遺伝子(Ohta,et al.1996)について解析を行った。なお、FHIT遺伝子の第4エクソンは我々が以前にエクソントラッピング法で同定した配列と同一であった。胃癌および、子宮頚癌においてスプライシングの異常によると思われる異常な転写産物が高頻度に認められた。ただし、点突然変異は見いだされなかった。

This study aims to explore the relationship between genetic diversity and cancer development. 1. RDA method for detecting chromosome deletion domain was used in gastric cancer cell line 2MD3 and normal DNA(NF8) of the same case. The DNA fragments of normal DNA fragments were detected in normal DNA fragments and abnormal DNA fragments were detected in normal DNA fragments. RDA product base alignment determination, Sequence Tagged Site(STS) creation 2. The chromosome of the missing region is determined by the STS. CEPH YAC's Revolutions and Results The missing area is the BAC. A candidate candidate for the next generation of genetic material exists in the vicinity of the genetic material. 7-14(1p), 7 -61(3p distal), 7 -50(16q23), and 7-20(3p14) are among the 4 missing products from the 2M, 7-50, and 7-20 transitions. An example of the positional relationship between the 7-50(16q23) cycle is shown. D16S518○-afma336yg9○-WI-2755●-D16S3029○-D16S504○(○:retention,●:deletion), missing field 1Mb. 3. Structural analysis of the FHIT gene in gastric cancer cell line 2MD3. Analysis of the FHIT gene in human gastric cancer cell line 2MD3. FHIT is the fourth time that we've been able to find the right solution. Gastric cancer, uterine cancer, and other abnormal conditions And then suddenly, you see something different.

项目成果

Aburatani,H.: "Idcntification of chromosomal alteration in cancer by represeutational differeuce analysis." JJpr Res Soc Gastroenterological Cascinogenesis. 8. 57-65 (1996)

Aburatani,H.：“通过再现差异分析鉴定癌症中的染色体改变。”

Hallstenson,K.et al.: "Representational Difference Analysis and Loss of Heteiszygosity Studies detect 3p Deletions in Neurollastoma.Tumors." Eun.J.Cancer. (in press). (1997)

Hallstenson,K.et al.：“代表性差异分析和杂合性丢失研究检测神经母细胞瘤中的 3p 缺失。肿瘤。”

Aburatani,H.et al.: "High resolution physical mapping by combined Alu-hybridizatiu/PCR screening:Construction of a yeast ortificial chromosome map covering 31centimorgans in 3p21-pk" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 92. 4474-4479 (1996)

Aburatani, H.等人：“结合 Alu 杂交/PCR 筛选的高分辨率物理作图：构建覆盖 3p21-pk 中 31 厘摩的酵母人工染色体图谱”Proc.Natl.Acad.Sci.USA。