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癌細胞染色体欠失領域に存在する癌抑制遺伝子の同定と機能解析

癌细胞染色体缺失区域抑癌基因的鉴定和功能分析

基本信息

批准号：
10151212
负责人：
油谷浩幸
金额：
$ 1.73万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
起止时间：
1998 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10151212/
关键词：
癌抑制遺伝子染色体欠失胃癌サブトラクション

项目摘要

本研究では胃癌細胞株OCUM-2Mの亜株として腹膜播種を来すようになった胃癌細胞株OCUM-2MD3を用いて、その過程におけるゲノム変異を検出するべく体系的な解析を行った。RDA(Representational Difference Analysis)法によるゲノムサブトラクションにより、染色体3p14、1p22-23及び16q22-23にホモ欠失領域が検出された。染色体1p22-23に同定されたホモ欠失を来しているゲノム領域においては、染色体のへテロ接合性の消失(LOH)も高率に認められた。およそ100kbの塩基配列を決定することにより、約7kbの新規遺伝子ZAP1を単離した。ZAP1遺伝子産物は1696アミノ酸からなり、シグナル配列を有すると思われる。ほぼ全ゲノム構造を明らかにし、癌細胞DNAにおける変異を解析したところ、腎癌及び膵癌細胞株においてp(A)6の繰り返しがp(A)5と変異している例が認められるなど、ミスマッチ修復異常の標的遺伝子となっている可能性もある他、スプライシングの異常が高頻度に観察され、ZAP1遺伝子の変異が2Mから2MD3への悪性化に関与している可能性が示唆された。また、ZAP1とホモロジーを有するZAP2遺伝子が9qに見いだされ、両者はともに細胞外基質を形成するタンパク分子であると推定されることから、その不活化がアポトーシス誘導を回避する機構に関与することも考えられる。同様の解析で染色体16q22-23領域における重複するホモ欠失変異を5つの癌細胞株で同定できた。同領域に細胞増殖を抑制するシグナル分子の存在が考えられ、現在、同領域のグノムシークエンスおよびエクソントラッピングやcDNAセレクションによる転写産物の同定を急いでいる。

In this study, the analysis of the system was carried out for the use and development of gastric cancer cell line OCUM-2MD3 after peritoneal seeding. RDA(Representative Difference Analysis) method is used to detect the missing region of chromosome 3p14, 1p22-23 and 16q22-23. Chromosome 1p22-23 is identical to chromosome 1 p22 - 23. It has a high rate of loss of zygosity (LOH). The 100kb base sequence is determined by the new vector ZAP1, which is about 7kb long. ZAP1 gene product is 1696 years old. The structure of the tumor cell DNA is different from that of cancer cell DNA. The tumor cell DNA is different from that of cancer cell DNA. ZAP1 gene variation is related to the characterization of 2M and 2MD 3 genes, and the possibility of this change is also discussed. ZAP1, ZAP 2, ZAP 3, ZAP 4, ZAP 5, ZAP 6, ZAP 7, ZAP 8, ZAP 9, ZAP 9, ZAP Analysis of homology in chromosome 16q22 -23 domain is repeated in 5 cancer cell lines. The existence of a molecule that inhibits cell proliferation in the same domain and the identification of the product of the gene in the same domain are examined.