遺伝子発現プロファイル解析による肝細胞癌診断法の開発

利用基因表达谱分析开发肝细胞癌诊断方法

基本信息

  • 批准号:
    12217031
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3.33万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

肝細胞癌特異的な発現プロファイルを同定することにより新規の診断アルゴリズムを確立し、また、肝発癌で発現する遺伝子を同定する目的で最大6万個の遺伝子あるいはEST(Expressed Sequence Tag)についてオリゴヌクレオチドアレイを用いて肝細胞癌における遺伝子発現プロファイルの解析をおこなった。2方向クラスタリングによるクラスター解析による癌部、非癌部の分類に加えて、肝癌の分化度による分類、非癌部では正常肝と慢性肝炎、肝硬変にそれぞれ分類することが可能であった。さらに症例数は少ないものの、肝硬変組織についてはB型・C型肝炎ウイルスにより分類することも可能であった。一方、正常、慢性肝炎、肝硬変、早期癌である高分化型肝癌、古典的肝癌である中分化型肝癌、小児肝腫瘍である肝芽腫に特異的な判別遺伝子の選定が可能であり、各グループへの重み付け場合分け解析が可能であった。今後、複数の腫瘍マーカーによる肝癌の診断、オーダーメイド医療、予後判定、肝癌進展のメカニズムの解明が可能であると考えられた。また、Unigeneデータベースに登録されているESTクローンのクラスターより最も完全長に近いクローンについての塩基配列を決定し、さらにヒトグノム配列からの遺伝子予測データも参照することにより肝細胞癌に特異的に発現が亢進している新規遺伝子を同定した。さらに、遺伝子発現の組織特異性については、GeneChipデータとともにSAGE(Serial Analysis of Gene Expression)データを統合することにより、遺伝子毎に種々の細胞や臓器での発現レベルが一覧できるようなデータベースを構築中である。
Hepatocellular carcinoma-specific hepatocellular carcinoma-specific hepatocellular carcinoma new rules for the diagnosis of hepatocellular carcinoma have been established, Liver cancer is now the same as the target, the maximum number is 60,000, the remaining number is EST (Expressed Sequence tag) Cell carcinoma is still in use. 2-way クラスタリングによるクラスター analysisによるclassification of cancerous parts and non-cancerous partsに加えて、differentiation of liver cancer Degree classification, non-cancerous parts, normal liver, chronic hepatitis, cirrhosis classification, possible classification. The number of cases of さらににないものの, cirrhosis of the liver and liver cirrhosis, type B and hepatitis C, are classified as possible. One side, normal, chronic hepatitis, cirrhosis, early stage cancer, well-differentiated liver cancer, classic liver cancer, moderately differentiated liver cancer, small liver tumor It is possible to select specific liver bud tumors and analyze them in different situations. From now on, diagnosis and treatment of plural tumors and liver cancer, It is possible to determine the progress of liver cancer after treatment and to explain the possibility of liver cancer progression.また、Unigeneデータベースに登录されているESTクローンのクラスターよりMost Completely Long にNearly いクローンについての塩婩组をdetermination Set し, さらにヒトグノムmatching sequence からの缝子 predicted データもreference することThe specific symptoms of hepatocellular carcinoma are hyperactive and the new rules are the same. Serial Analysis of Gene Expression)データを合合することにより、缝子毎に kind々の丝Cell や蓓器での発出レベルが一覧できるようなデータベースを CONSTRUCTION 中である.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Ge X: "A Physics-Inspired algorithm for information visualization with application to gene expression analysis."Journal of the School of Engineering. XLVII. 89-103 (2000)
葛X:“一种受物理启发的信息可视化算法,应用于基因表达分析。”工程学院学报。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Tsutsumi,Shuichi: "Classification of Hepatocellular Carcinoma by Gene Expression Profiling Analysis."Genome Informatics. 11. 240-241 (2000)
Tsutsumi,Shuichi:“通过基因表达谱分析对肝细胞癌进行分类。”基因组信息学。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Asagoshi K: "Distinct repair activities of human 7,8-dihydro-8-oxoguanine DNA glycosylase and formamidopyrimidine DNA glycosylase for formamidopyrimidine and 7,8-dihydro-8-oxoguanine."J Biol Chem. 275(7). 4956-64 (2000)
Asagoshi K:“人 7,8-二氢-8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶和甲酰胺嘧啶 DNA 糖基化酶对甲酰胺嘧啶和 7,8-二氢-8-氧代鸟嘌呤的独特修复活性。”J Biol Chem。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Hippo,Y: "Differential gene expression profiles of scirrhous gastric cancer cells with highly metastatic potential to peritoneum or lymph nodes."Cancer Research. 61(3). 889-895 (2001)
Hippo,Y:“具有向腹膜或淋巴结高度转移潜力的硬质胃癌细胞的差异基因表达谱。”癌症研究。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Minowa O: "Mmh/Ogg1 gene inactivation results in accumulation of 8-hydroxyguanine in mice."Proc Natl Acad Sci USA.. 97(8). 4156-61 (2000)
Minowa O:“Mmh/Ogg1 基因失活导致小鼠体内 8-羟基鸟嘌呤的积累。”Proc Natl Acad Sci USA.. 97(8)。
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  • 发表时间:
  • 期刊:
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    0
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  • 通讯作者:
    油谷 浩幸

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知道了