炎症性腸疾患のHLA領域内疾患感受性遺伝子の解析
炎症性肠病HLA区域疾病易感基因分析
基本信息
- 批准号:12204016
- 负责人:
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- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
- 财政年份:2000
- 资助国家:日本
- 起止时间:2000 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
炎症性腸疾患は、発病に遺伝的要因の関与が明らかとされている多因子病である。罹患同胞対を用いた研究より、HLA領域に本疾患の感受性遺伝子が連鎖(LODスコア3.6以上)することが明らかとなった。本申請者らのHLA領域全域におけるassociation mappingにおいても、HLA-DRB1からHLA-Bを頂点とする相関(case-control study)を認め、更にtransmission disequilibrium testにても一部のSNP(single nucleotide polymorphism)で有意な相関があることを確認しており、本疾患の感受性遺伝子はHLA領域に存在すると考えられる。一方1999、ヒトゲノムプロジェクトの成果として、HLA領域完全シークエンスが公表された。そこで我々は、そのゲノム情報と現在まで蓄積されたEST情報を利用して、HLA領域に存在する遺伝子のexon,intron構造の一部を決定し、その遺伝子の中から下部消化管特異的発現をする遺伝子を選ぶことで、遺伝学的手法(相関、連鎖)以外の方法により疾患感受性候補遺伝子の絞り込みを行なうことを計画した。今年度は、ESTとゲノム配列を対応させ遺伝子構造を決定した。決定した遺伝子構造の信頼性より以下のgroupに分類した。Group1:遺伝子構造が既知の遺伝子、Group2:対応するヒトEST情報が得られる遺伝子、Group3:対応するヒト以外のEST情報が得られる遺伝子、Group4:コンピューター(Grail,Genefind)による構造予測のみの遺伝子。結果は136遺伝子中、133遺伝子について、すべて或いは一部のintron-exon構造を決定した。Group1は78遺伝子、group2は43遺伝子、group3は2遺伝子、group4は10遺伝子であった。133の発現遺伝子のexon,intron構造を確認したことで、消化管特異的発現を確認するための、RT-PCR用primerを設計可能となり、現在primerのデザインが終了した。
The main causes of inflammatory bowel disease が, the occurrence of に and subsequent 伝 are related to が, ら, とされて, る and multifactorial disease である. Suffer compatriots を using seaborne い た research よ り, HLA に の this disease susceptibility heritage 伝 son が chain (LOD ス コ ア above 3.6) す る こ と が Ming ら か と な っ た. All the applicants ら の HLA field domain に お け る association mapping に お い て も, hla-drb1 か ら HLA - B を vertex と す る phase masato (case - control study を recognize め, more に transmission disequilibrium Test に て も a の SNPS (single nucleotide polymorphism) で intentionally な phase masato が あ る こ と を confirm し て お り, this disease is の susceptibility but 伝 は に HLA field exist す る と exam え ら れ る. One party 1999, ヒトゲノムプロジェ, ト, <s:1>, と, て, HLA field complete シ, エ, エ, スが public table された. そ こ で I 々 は, そ の ゲ ノ ム intelligence と now ま で accumulation さ れ た EST intelligence を using し て exist, HLA に す る posthumous son 伝 の exon, exon) tectonic の a を decided し, そ の heritage 伝 child の か ら lower digestive tube specific 発 now を す る posthumous son 伝 を choose ぶ こ と で, but 伝 learn technique の way beyond masato, chain (phase) に よ り disease susceptibility alternate heritage 伝 son の ground り 込 み を line な う こ と を project し た. This year, を and ESTとゲノム are matched with を to determine the を structure of 応させ 伝 substructures. Determine the construction of <s:1> trust of 伝 subtypes of <s:1> た よ よ the following <s:1> groupに classification <s:1> た. Group1: heritage 伝 sub structure が already know の heritage 伝, Group2: 応 seaborne す る ヒ ト EST intelligence が ら れ る heritage 伝, Group3: 応 seaborne す る ヒ の EST intelligence が ト must ら れ る heritage 伝, Group4: コ ン ピ ュ ー タ ー (Grail, Genefind) に よ る structure can be の み の 伝 son . Results 136 legacy は 伝 of, 133 survived 伝 に つ い て, す べ て or い は a の exon) - exon structure を し た. Group1 伝 78 remains 伝, group2 伝 43 remains 伝, group3 伝 2 remains 伝, group4 伝 10 remains であった. 133 の 発 now heritage 伝 son の exon, exon) tectonic を confirm し た こ と で, digestive tube specific 発 を now confirmed す る た め の, rt-pcr with primer を design may と な り, now primer の デ ザ イ ン が end し た.
项目成果
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专著数量(0)
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