Biocomputing der Organisation von Chromatinstrukturen auf großen Längenskalen

大尺度染色质结构的生物计算

• 批准号: 5306208
• 负责人: Professor Dr. Christoph Cremer
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Molekulare Biologie gGmbH (IMB)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2000-12-31 至 2003-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5306208?language=en
• 关键词: Biocomputing; der; Organisation; von; Chromatinstrukturen

Bei dem hier vorgeschlagenen Biocomputing-Projekt soll die dreidimensionale dynamische Organisation bzw. Verteilung von Chromosomen-territorien und -domänen im Zellkern auf geometrische Randbedingungen hin untersucht werden. Dazu soll ein im Rahmen des o.g. Graduiertenkollegs im Forschungsbereich Angewandte Optik & Informationsverarbeitung des Kirchhoff Instituts für Physik der Universität Heidelberg (Leiter: C. Cremer) entwickeltes Computermodell der dreidimensionalen (3D) "Groß"Struktur des gesamten menschlichen Genoms ("Large Scale Chromatin Structure" weiterentwickelt und seine experimentell testbaren Konsequenzen unter verschiedenen vorgegebenen Randbedingungen berechnet werden. Gesamtziel der Untersuchungen ist es, zur Frage eines Zusammenhangs zwischen der "Groß"Struktur des menschlichen Genoms und funktionell bedeutsamen Größen beizutragen. Die geplante Dynamisierung dieses Modells mit Brownscher Dynamik wird dabei einen zeitlichen Überblick über das Bewegungsverhalten ganzer Chromosomenterritorien und seiner Subkompartimente ermöglichen. Die aus den entwickelten Modellen berechneten experimentell testbaren Parameter sollen soweit vorhanden, mit bekannten Werten aus der Literatur verglichen werden.

在生物计算领域，三维动态组织的研究项目。在Zellkern上利用几何随机化方法将色元区域和区域划分为韦尔登。我只知道我是个好人。海德堡大学基尔霍夫物理研究所研究应用光学与信息管理专业毕业生（Leiter：C. Cremer）开发了三维（3D）“大规模染色质结构“计算机模型（“大规模染色质结构”weiterentwickelt und seine experimentell testbaren Konsequenzen unter verbedenen vorgebenen Randbedingungen berechnet韦尔登.因此，我们认为，Frage是人类基因组和功能基因组的“Grounding“结构的一种组合。使用Brownscher Dynamik建立的动力学模型将使我们能够更好地了解染色体的结构和相互间的差异。通过实验建立的模型可以确定测试参数，并可以从韦尔登中获得知识。