课题基金 / 基金详情

テロメア結合タンパク質によるシロイヌナズナの葉の老化誘導機構の構造科学的解析

テロメア結合タンパク質によるシロイヌナズナの葉の老化誘導機構の構造科学的解析
端粒结合蛋白诱导拟南芥叶片衰老机制的结构科学分析
批准号:
13014215
负责人:
森田 勇人
金额:
$0.96万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 --

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
シロイヌナズナのAtTRPは、第5染色体上に1コピーだけ存在するテロメア結合タンパク質で、Myb様のDNA結合モチーフを持ち、植物に存在するいくつかのイニシエーター結合タンパク質との類似性を持つ。AtTRPのMyb様領域はタンパク質全体のC末端側の領域に存在し、ゲルシフト実験の結果より、Myb様領域単独(55アミノ酸残基)ではテロメアリピートに対する結合親和性が低く、Myb領域の後ろのC末側領域(58アミノ酸残基)が存在して初めてテロメアリピートに対する選択的結合親和性が確認された。本研究では、部分的に欠損したC末領域を持つMyb様領域の作製を行い、ゲルシフト実験ならびに多次元NMR分光法による立体構造解析を行うことで、Myb様領域に続くC末側の領域がテロメア領域認識において果たす機能を解明することを目的とした。AtTRPのMyb様領域と完全長のC末領域を含むタンパク質は、大腸菌による大量発現系で可溶性画分として作製できたが、部分的に欠損したC末領域を持つMyb様領域は殆どが不溶性画分として回収され、変性剤による再生効率も低かった。そこで、タンパク質のフォールディングのタイミングが大腸菌と異なるコムギ胚芽の抽出物を用いた無細胞合成系を使用して大量発現を試みた。その結果、Myb様領域と完全長もしくは欠損したC末領域を持つタンパク質の殆ど全てを可溶性画分して回収することに成功した。さらに、この無細胞合成系では、約300μlの反応系で15nmol以上蛋白質が合成され、発現されたタンパク質にのみ特異的にラベルアミノ酸の取り込みが行われた。従って、全く精製を行わない試料溶液を用いて、発現したタンパク質の^1H-^<15>N HSQCスペクトルを測定することに成功した。現在、ゲルシフト実験を行うことでテロメアリピートの選択的認識に必須のC末領域の特定、ならびに^<15>N、^<13>Cの選択的二重標識体を作製し完全長のC末領域を持つMyb様領域の溶液構造解析を進めている。
英文摘要
シロイヌナズナのAtTRPは、第5染色体上に1コピーだけ存在するテロメア結合タンパク質で、Myb様のDNA結合モチーフを持ち、植物に存在するいくつかのイニシエーター結合タンパク質との類似性を持つ。AtTRPのMyb様領域はタンパク質全体のC末端側の領域に存在し、ゲルシフト実験の結果より、Myb様領域単独(55アミノ酸残基)ではテロメアリピートに対する結合親和性が低く、Myb領域の後ろのC末側領域(58アミノ酸残基)が存在して初めてテロメアリピートに対する選択的結合親和性が確認された。本研究では、部分的に欠損したC末領域を持つMyb様領域の作製を行い、ゲルシフト実験ならびに多次元NMR分光法による立体構造解析を行うことで、Myb様領域に続くC末側の領域がテロメア領域認識において果たす機能を解明することを目的とした。AtTRPのMyb様領域と完全長のC末領域を含むタンパク質は、大腸菌による大量発現系で可溶性画分として作製できたが、部分的に欠損したC末領域を持つMyb様領域は殆どが不溶性画分として回収され、変性剤による再生効率も低かった。そこで、タンパク質のフォールディングのタイミングが大腸菌と異なるコムギ胚芽の抽出物を用いた無細胞合成系を使用して大量発現を試みた。その結果、Myb様領域と完全長もしくは欠損したC末領域を持つタンパク質の殆ど全てを可溶性画分して回収することに成功した。さらに、この無細胞合成系では、約300μlの反応系で15nmol以上蛋白質が合成され、発現されたタンパク質にのみ特異的にラベルアミノ酸の取り込みが行われた。従って、全く精製を行わない試料溶液を用いて、発現したタンパク質の^1H-^<15>N HSQCスペクトルを測定することに成功した。現在、ゲルシフト実験を行うことでテロメアリピートの選択的認識に必須のC末領域の特定、ならびに^<15>N、^<13>Cの選択的二重標識体を作製し完全長のC末領域を持つMyb様領域の溶液構造解析を進めている。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Y.Kasai: "Physicochemical analysis of the interaction between a metal ion and the metal-ion-binding motif in hammerhead ribozymes"Nucleic Acid. Res. Suppl.1. 81-82 (2001)
Y.Kasai:“金属离子与锤头核酶中金属离子结合基序之间相互作用的物理化学分析”核酸。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
A.Kimura: "A high temperature-sensitive mutant of Synechococcus sp. PCC 7942 with modifications in the endogenous plasmid, pAQ1"Plant Cell Physiol.. 43(2). 217-223 (2002)
A.Kimura:“聚球藻属高温敏感突变体。PCC 7942,在内源质粒 pAQ1 中进行了修饰”《植物细胞生理学》43(2)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Y.Tanaka: "Identification of the metal ion binding sites on an RNA motif from hammerhead ribozyme using ^<15>N-NMR spectroscopy"J. Am. Chem. Soc.. (In press). (2002)
Y.Tanaka:“使用 15 N-NMR 光谱鉴定来自锤头核酶的 RNA 基序上的金属离子结合位点”J。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
小麦胚芽抽出物中に含まれるプロリン脱水素酵素の選択的阻害剤の開発
  • 批准号:
    16048222
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.98万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    森田 勇人
  • 依托单位:
藻類の低温環境適応におけるmRNAの構造転移を誘導する蛋白質の構造機能相関の解析
  • 批准号:
    12780498
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 资助金额:
    $1.54万
  • 财政年份:
    2000
  • 负责人:
    森田 勇人
  • 依托单位:
重金属イオンによるラン藻の転写調節因子SmtBの機能制御機構の構造化学的解析
  • 批准号:
    10179214
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $1.34万
  • 财政年份:
    1998
  • 负责人:
    森田 勇人
  • 依托单位:
海外基金