权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

アミノ酸配列空間上の蛋白質の折れ畳みダイナミックスにおける規則的階層性の探索

搜索氨基酸序列空间中蛋白质折叠动力学的规则层次结构

基本信息

批准号：
13208017
负责人：
小松崎民樹
金额：
$ 2.69万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

効率良く折れ畳む蛋白質(good folder)とそうではない人工蛋白質(bad folder)のThirumalaiらの46ビーズモデルに対する折れ畳みシュミレーションのダイナミックスに対し、主成分解析と埋め込み論を併用し、折れ畳み易さ・頑健性の違いをその規則構造の次元性、階層的なメカニズムの有無、エネルギーLandscapeの観点から解析した。揺らぎの大きい10数主成分の次元が相対的に低く、かつ転移温度では他の温度領域のそれに比べて顕著に小さく、転移温度領域のダイナミックスは非ブラウン運動的な規則性を保有する傾向があることが分かった。数十個の原子クラスターの擬相転移や液体のガラス転移においても、相転移温度付近において、非確率過程的なダイナミックスが知られており、本研究はGarciaらによる酸化チトクロームcの水溶液中の蛋白揺らぎの異常拡散に対する理論的な裏づけを与えたことに相当する。ファネル・非ファネル型ランドスケープによる相違は、ファネル型のエネルギー地形のほうがフオールディングダイナミックスをより幅広い温度領域に渡ってregularizeする傾向があることが具体的に示唆された。研究成果に関しては、Telluride Summer、Colorado USA(invited)、The 4^<th> International Conference on Biological Physics, Kyotoなどの国際会議および生理学研究所研究会「蛋白質ダイナミクス及びプリオン機構研究会」(依頼)、日本物理学会、分子構造総合討論会などで発表した。学術雑誌物性研究、生物物理(依頼)、Journal of Physical Chemistry(invited)に年度内に投稿する。

A good folder of protein and a bad folder of Thirumalai have been developed. The analysis of Thirumalai protein and bad folder has been carried out. The analysis of Thirumalai protein and bad folder has been carried out. The principal components of the 10-digit system have a tendency to maintain the regularity of motion in the range of temperature, which is lower than that in the range of temperature. The pseudo-phase shift of dozens of atoms, the phase shift of liquids, the approximation of phase shift temperature, and the uncertainty of the process are known. This study is equivalent to Garcia's theory of the anomalous dispersion of proteins in aqueous solutions. The temperature field of the product is regulated according to the temperature field of the product. Research achievements include: Telluride Summer, Colorado USA(invited), The 4th <th>International Conference on Biological Physics, Kyoto, and Institute of Physiology,"Institute of Protein Research and Development"(Japan), Japanese Physical Society, and Molecular Structure Conference. Academic journal Physical properties research, Biophysics (invited), Journal of Physical Chemistry(invited)