1分子時系列情報に基づく反応ネットワーク構造の構成論とその複雑さ解析

基于单分子时间序列信息的反应网络结构组成理论及其复杂性分析

基本信息

项目摘要

分子動力学計算や実験データから背後に潜む多次元有効自由エネルギー地形を構成する手法の開発:昨年度に引き続き、1分子時系列情報からガウス分布などの特定の分布関数の形を想定しないで"準安定状態"を構成し、自由エネルギー地形が正当化される時間スケールを同定しつつ、有効自由エネルギー地形を構成する方法論を開発・拡張した。準安定状態および遷移状態のあいだのエネルギー差を反映した自由エネルギー地形の樹形図を用いた可視化方法を考案した。また、複数の時定数が混在した生体分子ダイナミックスの各階層における軌道不安定性の性質を定量化する方法論を新規に開発した。一分子時系列情報から背後に潜む状態空間の遷移ネットワーク構造を再構成する手法の開発:昨年度に引き続き、局所平衡を予め規定しないで、異なる時空間スケールにおいて、時系列データの因果関係に基づいて状態および状態間遷移ネットワークを構成する方法論を開発した。ウェーブレット多重解像度解析と融合し、時間スケールの異なる複数の時系列情報のあいだの情報伝達、情報伝達の方向性、強さを移動エントロピー(Schreiber, Phys.Rev.Lett.85, 461(2000)を用いて定量化する方法論を考案した。具体的には、たんぱく質モデルの折れ畳み時系列に適用し、(1)平均的には、遅い時間スケールの状態空間から、速い時間スケールの状態空間への異方的な情報の流れが存在すること、(2)情報の流れは、軌道に沿って一様に起こるのではないこと、などを新規に見出した。
The molecular dynamics calculation is based on the calculation of molecular dynamics. There are many factors behind the calculation of molecular dynamics. There are many factors in the back of the system: yesterday, a series of events, the distribution, the distribution, the specific distribution, the stable state, the stable state, the temperature, the time, the temperature, the temperature, the There is a free way to change the terrain into a method to open a free environment. The stable state is stable, the state is stable, and the difference is reflected in the shape of the terrain. The numbers of DNA and multiplicative numbers are mixed in each channel of biological molecules and molecules. The method of quantitative analysis of instability is not stable and new rules are introduced. On the back of a series of conditions, the underlying space transmission system is used in the following operation: it was introduced last year, the balance of the bureau was used to regulate the operation, and the time series of cause and effect cause and effect was established. In order to improve the resolution of multi-resolution, the data fusion, the time and the complexity of the data, the accuracy and direction of the data in the series, and the method of quantitative analysis (Schreiber, Phys.Rev.Lett.85, 461 (2000)) are used to evaluate the test. There are some problems in the information flow of the party of the customer, the

项目成果

期刊论文数量(33)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
生体分子時系列情報から 我々は何を学び取ることができるか?
我们可以从生物分子时间序列信息中学到什么?
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yasuko Shiga;Kanji Akahori;小松崎 民樹
  • 通讯作者:
    小松崎 民樹
Topographical complexity of multidimensional energy landscapes
  • DOI:
    10.1073/pnas.0608517103
  • 发表时间:
    2006-12
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Gareth J Rylance;R. Johnston;Y. Matsunaga;Chun-Biu Li;A. Baba;T. Komatsuzaki
  • 通讯作者:
    Gareth J Rylance;R. Johnston;Y. Matsunaga;Chun-Biu Li;A. Baba;T. Komatsuzaki
Capturing the multiple-time-scale dynamical state-network in the time series of single molecule experiments
捕获单分子实验时间序列中的多时间尺度动态状态网络
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    寺本 央;小松崎 民樹;Akinori Baba;Kazuto Sei and Tamiki Komatsuzaki;Kazuto Sei and Tamiki Komatsuzaki
  • 通讯作者:
    Kazuto Sei and Tamiki Komatsuzaki
How can One Extract Free Energy Landscapes from Single Molecule Time Series?
如何从单分子时间序列中提取自由能景观?
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    寺本 央;小松崎 民樹;Akinori Baba
  • 通讯作者:
    Akinori Baba
1分子時系列情報に基づく反応ネットワーク構造の構成論とその複雑さ解析
基于单分子时间序列信息的反应网络结构组成理论及其复杂性分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yasuhiro Matsunaga;Chun-Biu Li;Tamiki Komatsuzaki;馬場 昭典;小松崎 民樹
  • 通讯作者:
    小松崎 民樹
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

小松崎 民樹其他文献

グラフカット:2次劣モジュラ関数最小化でどこまでやれるか
图割:最小化二次子模函数能走多远?
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    永幡 裕;前田 理;寺本 央;Chun-Biu Li;堀山 貴史;武次 徹也;小松崎 民樹;石川 博
  • 通讯作者:
    石川 博
Energy landscapes learned from time series and networks
从时间序列和网络中学习的能源景观
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    永幡 裕;前田 理;寺本 央;Chun-Biu Li;堀山 貴史;武次 徹也;小松崎 民樹;小松崎 民樹;Tamiki Komatsuzaki
  • 通讯作者:
    Tamiki Komatsuzaki
Counting lines and conics on a surface
计算曲面上的直线和二次曲线
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    寺本 央;小松崎 民樹;Y.Miyaoka
  • 通讯作者:
    Y.Miyaoka
Theo orbibundle Miyaoka-Yau inequality and an effective Bogomolov-McQ uillan theorem
Theo 球束 Miyaoka-Yau 不等式和有效的 Bogomolov-McQ uillan 定理
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    寺本 央;小松崎 民樹;Y.Miyaoka;Yoichi Miyaoka;Yoichi Miyaoka
  • 通讯作者:
    Yoichi Miyaoka
The relationship between mechanical behaviors and surface roughness of submeter-sized granite sample in bi-axial friction experiments
亚米级花岗岩试样双轴摩擦力学行为与表面粗糙度的关系
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    田畑 公次;中村 篤祥;本多 淳也;小松崎 民樹;Kazuo Mizoguchi,Sachiko Iizuka
  • 通讯作者:
    Kazuo Mizoguchi,Sachiko Iizuka

小松崎 民樹的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('小松崎 民樹', 18)}}的其他基金

Cell diagnosis by bridging Raman Spectral Imaging and Information Science
通过连接拉曼光谱成像和信息科学进行细胞诊断
  • 批准号:
    18F18719
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築
为复杂反应系统奠定动力学理论基础
  • 批准号:
    20038001
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築
为复杂反应系统奠定动力学理论基础
  • 批准号:
    19029030
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相空間構造に基づく多遷移反応動力学とメソスケールで発現する新規なダイナミックス
基于相空间结构和介观尺度发生的新颖动力学的多转变反应动力学
  • 批准号:
    16032209
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
1分子時系列情報に基づく生体分子の構造転移パスウェイの多重性・多型性解析
基于单分子时间序列信息的生物分子结构转变途径的多重性和多态性分析
  • 批准号:
    15014221
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相空間構造に基づく多遷移反応動力学とメソスケールで発現する新規なダイナミックス
基于相空间结构和介观尺度发生的新颖动力学的多转变反应动力学
  • 批准号:
    15035210
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
アミノ酸配列空間上の蛋白質の折れ畳みダイナミックスにおける規則的階層性の探索
搜索氨基酸序列空间中蛋白质折叠动力学的规则层次结构
  • 批准号:
    14015219
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
アミノ酸配列空間上の蛋白質の折れ畳みダイナミックスにおける規則的階層性の探索
搜索氨基酸序列空间中蛋白质折叠动力学的规则层次结构
  • 批准号:
    13208017
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
化学反応における遷移過程の動力学的階層構造に関する研究
化学反应过渡过程的动力学层次结构研究
  • 批准号:
    12042254
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

相似海外基金

ポリシーに着目した学術情報流通に関する分野間の慣習の研究
以政策为重点的学术信息发布跨学科实践研究
  • 批准号:
    24K21053
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
コンパイラ中間表現に基づく情報流解析による安全性検証の多プログラミング言語展開
基于编译器中间表示的信息流分析多编程语言安全验证开发
  • 批准号:
    24K14906
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
芸術・文化財情報流通のための多言語辞書データ開発の研究
艺术品文化财产信息发布多语言词典数据开发研究
  • 批准号:
    23K22017
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
情報流分析のための動的認識論理の構成的研究
信息流分析动态认知逻辑的建设性研究
  • 批准号:
    23K16952
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
不正情報流の防止によるゼロトラストモデルの重大脅威への対応力向上の研究
通过防止未经授权的信息流提高零信任模型应对严重威胁的能力研究
  • 批准号:
    23K16887
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
芸術・文化財情報流通のための多言語辞書データ開発の研究
艺术品文化财产信息发布多语言词典数据开发研究
  • 批准号:
    22H00745
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
補完代替医療に関する情報流通の適正化に向けた法的統制
对适当分发补充和替代医学信息的法律控制
  • 批准号:
    22K01296
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
情報流のパス展開理論と神経ネットワーク活動計測に基づく生物の行動決定機構の解明
基于信息流路径扩展理论和神经网络活动测量阐明生物体的行为决策机制
  • 批准号:
    22K03453
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
レジリエントな情報社会のためのデータ駆動型情報流通制御技術
数据驱动的信息分发控制技术,打造弹性信息社会
  • 批准号:
    22K11990
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
IoT/CPSサービスのための階層化ネットワーククラスタ形成による情報流通基盤
基于分层网络集群形成的物联网/CPS服务的信息分发基础设施
  • 批准号:
    21K11872
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 4.54万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了