複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築
複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築
批准号:
20038001
负责人:
小松崎 民樹
金额:
$1.98万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009
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英文摘要
我々は熱的に揺らぐ環境下における状態変化の決定性の存在を調べるために、熱雑音存在下の化学反応を多次元一般化ランジュバン方程式で表現し、時間依存標準形理論をランダムな外力を受ける系に拡張し、系の反応性を決定する力学構造を抽出することに成功した。その結果、系の持つ複数の自由度間の非線形相互作用、およびランダムな外力の存在下においても、それらに応じた適切な座標を構成してその座標に射影して見ることによって運動が単純な形になることを見出し、またその座標変換を得るための具体的な手法を構築することに成功した。この特別な座標で見ることにより、ランダム力の存在下にあっても少なくとも鞍部点近くの領域においては反応するものとしないものとを分かつ境界が存在し、反応の帰趨は系が鞍部点近傍に入った時点でこの境界面のどちら側にあるかのみで決まっていることを実証した。この境界面は本研究で導入した新しい座標がゼロになる場所として解析的に与えることができる。新しい座標は元の座標およびランダム力の非線形な(汎)関数であるが、その解析的な形を見ることにより系の反応性に影響を及ぼす因子を環境の熱ゆらぎの効果、非線形性の効果、およびそれらが複合的に組合わされた効果に分類して理解することができる。また、高温・高エネルギー状況下において、そのような反応座標が存在しえない(ような)状況においても、相空間上に反応する・しないを分割する反応分割面は頑健に存在しえることを新規に見出した。独立な反応座標と反応の可否を律する反応分割面の存在は"対"として捉えられている従来の常識を覆すものであり、高温・高エネルギー領域における新規な反応様式の発見と高く評価することができる。
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Extracting a Multidimensional Free Energy Landscape from a Scalar Single-Molecule Time Series(一般、ポスター)
从标量单分子时间序列中提取多维自由能景观(一般,海报)
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mio Eida, Yoshitaka Hashimoto, Kyuichi Kanagawa, T.Komatsuzaki]
通讯作者:
T.Komatsuzaki
Dynamic pathways to mediate reactions buried in thermal fluctuations II : numerical illustrations using a model system
热波动中介导反应的动态途径 II:使用模型系统的数值说明
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Journal of Chemical Physics
影响因子:
4.4
作者:
[友岡義晴, 摂待力生, 他, Shinnosuke Kawai and Tamiki Komatsuzaki]
通讯作者:
Shinnosuke Kawai and Tamiki Komatsuzaki
Dynamical Origin of Change of States in Chemical Reactions and Conformation Changes-Toward Biological Functions under Thermal Fluctuation(招待、口頭)
化学反应状态变化和构象变化的动力学起源——热波动下的生物功能(邀请,口头)
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[渡邊秀和, 山口祥一, Sen Sobhan, 森田明弘, 田原太平, 松田智博, 小松崎民樹]
通讯作者:
小松崎民樹
反応O+OH→H+O2における非統計性と反応動力学(一般、口頭)
O+OH→H+O2 反应中的非统计学和反应动力学(普通,口服)
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[河合信之輔, 小松崎民樹, Pascal Larregaray]
通讯作者:
Pascal Larregaray
多自由度 Hamilton 系における安定/不安定多様体の可能な折り畳みパターンとそれらの力学系の性質との関係(一般、口頭)
多自由度哈密顿系统中稳定/不稳定流形的可能折叠模式及其与动力系统性质的关系(一般,语言)
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[馬場昭典, 小松崎民樹, 齊藤健二, 金台燕, 森田明弘, 藤田守文, 小松崎民樹, 齊藤健二, 宮前孝行, T.Sugimura, 寺本央]
通讯作者:
寺本央
共 68 条
Cell diagnosis by bridging Raman Spectral Imaging and Information Science
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批准号:18F18719
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2018
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築
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批准号:19029030
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2006
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
1分子時系列情報に基づく反応ネットワーク構造の構成論とその複雑さ解析
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批准号:18016019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.54万
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财政年份:2006
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
相空間構造に基づく多遷移反応動力学とメソスケールで発現する新規なダイナミックス
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批准号:16032209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2004
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
1分子時系列情報に基づく生体分子の構造転移パスウェイの多重性・多型性解析
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批准号:15014221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2003
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
相空間構造に基づく多遷移反応動力学とメソスケールで発現する新規なダイナミックス
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批准号:15035210
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:2003
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
アミノ酸配列空間上の蛋白質の折れ畳みダイナミックスにおける規則的階層性の探索
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批准号:14015219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2002
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
アミノ酸配列空間上の蛋白質の折れ畳みダイナミックスにおける規則的階層性の探索
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批准号:13208017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.69万
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财政年份:2001
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
化学反応における遷移過程の動力学的階層構造に関する研究
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批准号:12042254
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$2.56万
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财政年份:2000
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负责人:小松崎 民樹
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依托单位:
海外基金