時間分解振動分光法による蛋白質高次構造変化の機能に果す役割の解明
時間分解振動分光法による蛋白質高次構造変化の機能に果す役割の解明
批准号:
13308039
负责人:
北川 禎三
金额:
$16.81万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2004
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基質の脱着に伴う蛋白質高次構造の超高速ダイナミクスを調べるために、本研究では蛋白にミオグロビン(Mb)を、リガンドに一酸化炭素(CO)を用いた。一酸化炭素結合形ミオグロビン(MbCO)のCOは光で解離する。すなわち、MbCOのFe-CO結合は可視レーザー光照射により300フェムト秒以内に切れる。COは蛋白外に出ていき、蛋白はdeoxyMbの平衡構造に向かって変化していくが、その過程をピコ秒の時間分解共鳴ラマン分光法で調べた。主光源は1.5ps幅、82MHz繰り返し、平均出力0.7WのTi : sapphireレーザーで、それをNd : YLFレーザーの倍波(527nm)で増幅し、1kHz繰り返しのパルス列にしてから2系列に分け、各々の波長に変換した。光解離にはOPG法で変換した540nmのパルスを用い、ラマン散乱励起光としてはメタンの誘導ラマン散乱で得た442nmのパルスを用いた。両パルスの時間相関幅は2.3psで遅延時間のゼロは0.2psの精度で決まっている。この測定系は国際的にもトップレベルで、同レベルのデータをとれるグループは国際的にも無いと云える光解離1ps後のスペクトルではFc-His伸縮(ν_<Fe-His>)は222Cm^<-1>に、ヘムの面外振動(γ_7)が300cm^<-1>に、側鎖C_βC_cC_d変角振動[δ(C_βC_cC_d)]が369cm^<-1>に観測された。ν_<Fe-His>及びγ_7バンドの面積強度を遅滞時間に対してフロットすると、γ_7は速い立ち上がりの後、一定強度を示したが、ν_<Fe-His>はその後20ps迄じわじわと強度増加を示した。解析の結果、これはMbCO形ではヘム面内に位置していた鉄イオンが、deoxy形でヘム面より0.3ÅだけHis側にずれる構造変化を反映している事がわかった。その変化の80%は非常に速いが残り20%が1〜20psで起こる。一方ν_<Fe-His>振動数は、時定数106±14psで低波数シフトしたが、ポルフィリン環のγ_7やδ(C_βC_cC_d)バンドはその様なシフトを示さなかった。また蛋白のない鉄ポルフィリンイミダゾール錯体のCO光解離でも、ν_<Fe-lm>はν_<Fe-His>.バンドと同じように強度の時間変化を示したが、振動数変化は示さなかった。したがってν_<Fe-His>の振動数の時間変化は、蛋白質の3次構造の時間変化を反映しているものと思われる。
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Y Mizutani, T Kitagawa: "Vibrational Energy Relaxation of Metalloporphyrins in a Condensed Phase Probed by Time-Resolved Resonance Raman Spectroscopy"Bulletin of Chemical Society of Japan. 75. 1-17 (2002)
Y Mizutani、T Kitakawa:“通过时间分辨共振拉曼光谱探测凝聚相中金属卟啉的振动能量弛豫”日本化学会会刊。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
北川 禎三 他: "生物と金属:金属イオンの生体内で働く仕組み"クバプロ. 207 (2001)
Teizo Kitakawa 等人:“生物学和金属:金属离子如何在生物体中发挥作用”KubaPro 207 (2001)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
N.Haruta, T.Kitagawa: "Time-resolved UV Resonance Raman Investigation of Protein Folding : Characterization of Kinetic and Equilibrium Intermediates of Apomyoglobin"Biochemistry. 41(印刷中). (2002)
N.Haruta、T.Kitakawa:“蛋白质折叠的时间分辨紫外共振拉曼研究:脱肌红蛋白的动力学和平衡中间体的表征”生物化学 41(出版中)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
S.G.Kruglik, P.Mojzes, Y.Mizutani, T.Kitagawa, P-Y.Turpin: "Time-resolved Resonance Raman Study of the Exciplex Formed Between Excited CuPorphyrin and DNA"Journal of Physical Chemistry. 105. 5018-5031 (2001)
S.G.Kruglik、P.Mojzes、Y.Mizutani、T.Kitakawa、P-Y.Turpin:“激发铜卟啉和 DNA 之间形成的激基复合物的时间分辨共振拉曼研究”物理化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
N.Haruta, M.Aki, S.Ozaki, Y.Watanab, T.Kitagawa: "Protein Conformation Change of Myoglobin upon Ligand Binding Probed by Ultraviolet Resonance Raman Spectroscopy"Biochemistry. 40. 6956-6963 (2001)
N.Haruta、M.Aki、S.Ozaki、Y.Watanab、T.Kitakawa:“通过紫外共振拉曼光谱探测配体结合时肌红蛋白的蛋白质构象变化”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 7 条
時間分解紫外共鳴ラマン分光法によるガスセンサーヘム蛋白の情報検出・伝達の構造化学的研究
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批准号:04F04382
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
サブナノ秒遠紫外レーザーパルスの発生とその時間分解紫外共鳴ラマン分光への応用
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批准号:04F04116
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
紫外共鳴ラマン分光法によるDNA結合蛋MerRの金属錯体における金属種区別法の解明
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批准号:03F03100
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2003
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
紫外共鳴ラマン分光法によるDNA結合蛋白MerRの金属錯体における金属種区別法の解明
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批准号:03F00100
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2003
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
時間分解紫外共鳴ラマン法によるセンサー蛋白の情報感知・伝達及び機能発現機構の解明
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批准号:14103003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$43.1万
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财政年份:2002
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
可溶性グアニレートシクラーゼのNOに誘起される構造変化:可視及び紫外共鳴ラマン分光法による研究
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批准号:01F00289
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2001
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
時間分解紫外共鳴ラマン分光法によるミオグロビンの蛋白折れたたみ機構の研究
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批准号:98F00451
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1999
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
時間分解紫外共鳴ラマン分光法によるタンパク質ダイナミクスの研究
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批准号:97F00403
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1998
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
生体エネルギー変換における金属イオンと蛋白質の役割
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批准号:08249106
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$103.17万
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财政年份:1996
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
生体機能における金属イオンの特異的作用の分子科学
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批准号:07354022
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项目类别:Grant-in-Aid for Co-operative Research (B)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:1995
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
生体系におけるNOの合成と反応及びその検出
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批准号:06353017
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项目类别:Grant-in-Aid for Co-operative Research (B)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1994
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
新規デザインに基づくラマン散乱測定用高感度マルチチャンネル光子計数ヘッドの製作
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批准号:02554020
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B)
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资助金额:$6.14万
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财政年份:1991
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
金属酵素活性部位の精密モデル化
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批准号:03241105
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$32.51万
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财政年份:1991
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
金属酵素活性部位の精密モデル化
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批准号:04225106
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$33.28万
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财政年份:1991
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
金属酵素活性部位の精密モデル化
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批准号:04255106
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.0万
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财政年份:1991
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
シトクロム酸化酵素におけるプロトンポンプと酸素還元反応とのカップリング機構
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批准号:63617515
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.66万
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财政年份:1988
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
レーザービーム中にある分子の可視吸収スペクトル測定装置の試作
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批准号:63840016
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
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资助金额:$2.75万
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财政年份:1988
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
シトクロム酸化酵素におけるプロトンポンプと酸素還元反応とのカップリング機構
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批准号:62617521
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1987
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
シトクロム酸化酵素によるH⌒チャンネル開閉と酸素還元反応とのカップリング機構
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批准号:60215017
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1985
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
シトクロム酸化酵素による H^+ チャンネル開閉と酸素還元反応とのカップリング機構
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批准号:59223015
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1984
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负责人:北川 禎三
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依托单位:
海外基金