枯草菌sigma-H蛋白質をモデルとした機能複合体形成

以枯草芽孢杆菌 sigma-H 蛋白为模型的功能复合物形成

• 批准号: 13760057
• 负责人: 朝井 計
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Saitama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13760057/
• 关键词: 枯草菌; シグマ因子; 翻訳終結; sigma-H; 転写後調節

細菌は2種(PrfA、PrfB)の、終止コドン認識の異なる[それぞれ(UAA、UAG)、(UAA、UGA)]ペプチド鎖解離因子を持つ。申請者が既に新規に取得しているprfB変異株では37℃で胞子形成率が低下し、同時に胞子形成開始に必須なsigma-H蛋白質の半減期が野生株に比べ短くなっていた。prfB変異株のin vivoにおける翻訳のリードスルー率、フレームシフト率をそれぞれlacZ活性及びフレームシフトにより完全長の生成されるPefBタンパク質を指標にし観察したところ、ともに温度に依存して上昇していた。またこれはリードスルーの率をさげるリボゾーム蛋白質の変異により抑圧され、同時に胞子形成も回復した。従ってこれらのことより、prfB変異株では温度上昇にともないリードスルー率が上昇することで、sigma-Hが不安定化し胞子形成開始が阻害されていることが考えられた。温度のシフトアップ・ダウンがprfB変異株の胞子形成に与える影響を調べたところ、胞子形成のごく初期が温度感受性であることがわかった。この時期はまさにsigma-Hの安定・活性化の時期と呼応している。また、prfB変異の胞子形成復帰サプレッサー変異は、RNAポリメラーゼのβサブユニトをコードするrpoB遺伝子に起こった。このことは、sigma-Hの翻訳終結と、RNAポリメラーゼのホロ酵素形成がなんらかの形で共役している事を示唆する。同様に胞子形成の温度感受性を示すと報告のあったprfB1変異(Karow et al. J. Bacteriol. (1998)180:4166-4170.)を同様に解析している。この変異部位はC末端にあるが申請者の変異はそれよりN末端よりのコドン認識に関わるとされる領域にある。

Two (PrfA, PrfB) bacteria は の, termination コ ド ン know の different な る [そ れ ぞ れ, UAA, UAG), (UAA, VGA)] ペ プ チ ド lock dissociation factor を つ. Applicants が に both new rules に obtain し て い る prfB - different strains で は 37 ℃ で low が し spore forming rate, at the same time に spore formation must start に な sigma - H protein の half life が wild strains に shorter than べ く な っ て い た. の prfB - different strain in vivo に お け る turn 訳 の リ ー ド ス ル ー rate, フ レ ー ム シ フ ト rate を そ れ ぞ れ lacZ activity and び フ レ ー ム シ フ ト に よ り completely long の generated さ れ る PefB タ ン パ ク を quality indicators に し 観 examine し た と こ ろ, と も に に temperature dependent し て rise し て い た. ま た こ れ は リ ー ド ス ル ー の rate を さ げ る リ ボ ゾ ー ム protein の - different に よ り 圧 suppression さ れ, at the same time に spore formed も reply し た. 従 っ て こ れ ら の こ と よ り, prfB - different strains で は temperature rise に と も な い リ ー ド ス ル ー rate rising が す る こ と で, sigma - H が unrest し spore formation began が resistance against さ れ て い る こ と が exam え ら れ た. Temperature の シ フ ト ア ッ プ · ダ ウ ン が prfB - different strains の spore forming に and え る influence を adjustable べ た と こ ろ, spore formation の ご く early が temperature sensitivity で あ る こ と が わ か っ た. The <s:1> <s:1> period まさに まさにsigma-H <s:1> stabilization and activation <s:1> period と hu 応 て る る る. ま た, prfB - different の spore formed after 帰 サ プ レ ッ サ ー - different は, RNA ポ リ メ ラ ー ゼ の beta サ ブ ユ ニ ト を コ ー ド す る rpoB heritage 伝 son に up こ っ た. こ の こ と は, sigma - H の turn 訳 end と, RNA ポ リ メ ラ ー ゼ の ホ ロ enzyme formation が な ん ら か の form で し total service て い を る things in business す る. Similar に spore formation <s:1> temperature sensitivity を reports すと あったprfB1 variation (Karow et al. J. Bacteriol. (1998)180:4166-4170.)を similar に analysis に て る る る る る る る る. こ の - different parts は C terminal に あ る が applicants の - different は そ れ よ り N terminal よ り の コ ド ン know に masato わ る と さ れ る field に あ る.

项目成果

Wolfgang Schumann: "Functional Analysis of Bacterial Genes"John Wiley & Sons,LTD. 373 (2001)

沃尔夫冈·舒曼：《细菌基因的功能分析》约翰·威利

Asai Kei: "DNA microarray analysis of Bacillus subtilis sigma factor of extracytosolic function family"FEMS Microbiol. Lett.. (in press). (2003)

浅井庆：“胞质外功能家族枯草芽孢杆菌西格玛因子的 DNA 微阵列分析”FEMS Microbiol。

Asai Kei: "The Bacillus subtilis yabQ gene is essential for formation of the spore cortex"Microbiology. 147(Pt4). 919-927 (2001)

Asai Kei：“枯草芽孢杆菌 yabQ 基因对于孢子皮层的形成至关重要”微生物学。