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抗マラリア剤の開発を志向したマラリア原虫由来加水分解酵素の立体構造解析

疟疾寄生虫水解酶的三维结构分析用于抗疟药物的开发

基本信息

批准号：
15790074
负责人：
日下部吉男
金额：
$ 2.24万
依托单位：
Showa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

SAHHの単結晶は、反応生成物であるAdoの存在下で、クエン酸ナトリウムを沈殿剤とした場合に得られた。つくば市高エネルギー加速器研究機構のPF-AR NW12において2.4Å分解能の回折強度データを収集した。結晶学的パラメータは、斜方晶系、空間群P2_12_12_1、格子定数a=77.09Å,b=86.15Å,c=333.8Åでありこのデータを利用し、PfSAHH/Ado複合体の結晶構造解析に成功した。HsSAHHとPfSAHHの構造比較により、活性部位(Ado結合サイト)にHsSAHHには存在しない「くぼみ」があることが明らかとなった(Tanaka et al.,J.Mol.Biol.343,1007-1017(2004))。既存の各種阻害剤のPfSAHH及びHsSAHHに対する阻害活性データは、PfSAHHに存在する「くぼみ」が種選択的阻害剤をデザインするための標的となることを示唆している。SAHHの選択的阻害薬であるNoraristeromycinのアデニン環2位にフッ素を導入した2-F-NAMは、PfSAHHに対する阻害能は維持していたがHsSAHHに対する阻害能を失っている(立体障害が原因と推定される)。そこで、PfSAHH/2-F-NAM複合体の立体構造決定により、アデニン環2位への官能基導入が実際にPfSAHH特有の「くぼみ」を埋め、選択性に寄与しているのかを検証するため、我々はPfSAHH/2-F-NAM複合体の結晶化を行ったところ、1.2Mクエン酸ナトリウム、0.1M Hepes(pH7.5)、タンパク質濃度4mg/mLという条件下で結晶が得られた。得られた結晶をPF-AR NW12において2.5Å分解能の回折強度データを収集し、PfSAHH/Ado複合体をサーチモデルとした分子置換法により位相決定を行い、結晶構造解析に成功した。今現在、モデルの精密化を行っているところである。得られた構造から、阻害剤の種選択性向上に役立つ立体構造情報を得たい。

SAHH is a crystalline and anti-crystalline product obtained in the presence of Ado. PF-AR NW12, a research facility for high-energy accelerator in Beijing, has a 2.4-degree decomposition energy and a reflection intensity profile. Crystallographic analysis of PfSAHH/Ado complex was successfully carried out by using the following methods: orthorhombic system, space group P2_12_12_1, lattice number a=77.09,b=86.15,c=333.8. HsSAHH (Tanaka et al., J.Mol.Biol.343,1007-1017(2004))。PfSAHH and HsSAHH exist as a barrier to the existence of a variety of barriers. SAHH selective inhibition is due to the introduction of 2-F-NAM and PfSAHH at the 2-position of noralisteromycin and the loss of HsSAHH inhibition (steric inhibition is presumed). The crystallization of PfSAHH/2-F-NAM complex was obtained under the following conditions: 1.2M Hep, 0.1M Hepes(pH 7.5), 4mg/mL Hep. PfSAHH/Ado complexes were successfully analyzed by molecular displacement method. Now, the precision of the car is very high. Get the information of three-dimensional structure by selecting the type of structure and resistance.