腸管出血性大腸菌O157の病原遺伝子群の発現における外来性tRNAの役割

外源tRNA对肠出血性大肠杆菌O157致病基因表达的影响

• 批准号: 16790257
• 负责人: 小椋 義俊
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16790257/
• 关键词: 細菌; 病原性大腸菌; ゲノム; 病原遺伝子; 翻訳; 大腸菌; O157; tRNA

腸管出血性大腸菌O157に存在する3種類の新規tRNA(ileZ-argN-argO : IRR)の解析を行った。16年度までの解析により、IRRは転写されプロセッシングと塩基修飾を受けていることがわかった。これらのことから、それぞれはtRNAとして機能している可能性が高いと考えられた。そこで、17年度は、大腸菌K-12を用いて、in vivoでの機能解析を行った。IRRが認識すると予想されるコドンは大腸菌K-12では極端に使用頻度が低く、そのコドンを含む遺伝子の翻訳効率も低いことが知られている。そこで、大腸菌K-12株でIRRを発現させ、IRRの認識コドンを多く含む遺伝子の翻訳効率への影響を解析した。まず、lacZ遺伝子をプラスミドでクローニングし、その遺伝子上流にileZの認識コドンであるATAをタンデムに挿入した。ATAを含むlacZレポータープラスミドを導入した大腸菌では、ATAを含まない場合に比べて、LacZ活性が有意に低下したことから、マイナーコドンの挿入により、翻訳効率が低下したことが分かった。その株を、IRR発現ベクターで形質転換したところ、ベクターのみのコントロールに比べて、2倍近くLacZ活性が上昇した。これらのことから、IRRのうち、ileZについては、tRNAとしての機能を持つことが確認できた。現在、同様の方法を用いて、残り2つのtRNAについても機能解析を行っている。また、その後は、O157で7コピー存在するIRRをすべて欠失させ、IRR認識コドンを多く使用している遺伝子、特に志賀毒素などの病原因子の翻訳への影響を解析する予定である。

Analysis of three new tRNA (ileZ-argN-argO: IRR) species in intestinal hemorrhagic E. coli O157. In 2016, the analysis of IRR was carried out. The possibility of a high level of activity is high. The function analysis of Escherichia coli K-12 in vivo IRR is known to have a low frequency of use of Escherichia coli K-12 and a low efficiency of use of Escherichia coli. The IRR of E. coli K-12 strain was detected and analyzed. The information is available in the following languages: The activity of LacZ is lower than that of E. coli when ATA is contained. The activity of LacZ was increased by 2 times. The function of tRNA is confirmed. Now, the same method is used in the middle, and the residual 2 is used in the function analysis. The analysis of the effects of the presence of IRR, IRR, and O157 on the development of viral pathogens, especially Shiga toxin, is expected.

项目成果

大腸菌O157のゲノム研究とその応用.

大肠杆菌O157基因组研究及其应用。

• 发表时间: 2005
• 期刊: 臨床微生物迅速診断研究会誌(JARMAM) 16
• 作者: 大岡唯祐;小椋義俊;林哲也
• 通讯作者: 林哲也

腸管出血性大腸菌のゲノム解析

肠出血性大肠杆菌基因组分析

• 发表时间: 2004
• 期刊: ゲノム医学 4(2)
• 作者: 小椋義俊;林 哲也
• 通讯作者: 林 哲也

腸管出血性大腸菌のゲノムの特徴

肠出血性大肠杆菌的基因组特征

• 发表时间: 2004
• 期刊: 化学療法の領域 20(9)
• 作者: 大岡唯祐;小椋義俊;林 哲也
• 通讯作者: 林 哲也

Complexity of the genomic diversity of enterohaemorrhagic Escherichia coli O157 revealed by the combinational use of the O157 Sakai oligo DNA microarray and the Whole Genome PCR Scanning.

结合使用 O157 Sakai 寡核苷酸 DNA 微阵列和全基因组 PCR 扫描揭示了肠出血性大肠杆菌 O157 基因组多样性的复杂性。

• 发表时间: 2006
• 期刊: DNA Res. 13
• 作者: Y.Ogura;et al.
• 通讯作者: et al.