SINE挿入を指標とした翼手目ヒナコウモリ科内部の系統解析

使用 SINE 插入作为指标对翼手目、翼手科进行系统发育分析

• 批准号: 05F05182
• 负责人: 岡田 典弘
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05F05182/
• 关键词: 分子系統解析; ヒナコウモリ科; SINE法; レトロポゾン

本研究の目的は、「SINE法」を指標として、多岐にわたるヒナコウモリ科内部の系統関係を明らかにすることである。ヒナコウモリ属の中でも特にMiniopterus属は生態的・形態的に非常に多様な属であり、世界的に多くの種が分布している。しかしながらその種間の系統関係および単系統性に関しては完全には解明されていないため、世界的に注目されている分類群である。そのため本研究でもMiniopterus属周辺の系統関係の解明を目指して解析をおこなっている。特に昨年度沖縄県にて入手したMiniopterus fuscusのサンプルは非常に貴重であり、その詳細な解析を現在おこなっている。SINEとはゲノム中に散在する短い反復配列であり、その有無を様々な種の相同遺伝子座間で比較することにより、信頼性の非常に高い系統樹の再構築が可能であるととが知られている。ヒナコウモリ上科のゲノム中には、VES-SINEが特異的に分布することがすでに知られており、本研究においては、このVES-SINEの挿入パターンを指標の一つとして用いる。ヒナコウモリ科に関する系統解析をおこなうにあたって、VES-SINE配列群からサブグループを検出し、これらの中から適切な増幅活性時期を持つグループを解析に用いる必要があるため、Miniopterus fuscusのゲノムライブラリを作成し、ここからVES-SINE配列を多数単離して、これらの解析をおこなっている。VES-SINEはヒナコウモリ科にも存在するが、それ以外のSINEもそれらのゲノム中に存在するかもしれないたあ、今年度はその探索をおこなった。これまでゲノムライブラリのランダムシークエンスを進めてきたものの、現在のところ新規SINEは発見されていない。この探索は今後も引き続きおこなう予定である。

The purpose of this study is to use the "SINE method" as an indicator and to determine the internal system relationship of the multi-dimensional system. The ヒナコウモリの中でも特にMiniopterus genus is an ecological and morphological に多様な genus であり, and the world's に多くのspecies がdistribution している. Systematic relationship between species The world's most famous taxonomic group is the world's most famous taxonomic group.そのためThis study is based on the analysis of the genus Miniopterus and its systematic relationship. Specially, I purchased the Miniopterus fuscus last year and it is very precious and has a detailed analysis. It is now available. SINE とはゲノ中に scattered in する Short い Repeatedly arranged であり, その有无を様々なkindの Same remains between the seatsでComparison することにより, 信格性のvery high phylogenetic tree のreconstruction がpossible であるととが知られている.ヒナコウモリ上科のゲノム中には, VES-SINEがspecific に DISTRIBUTION することがすでにknow られており、This study uses においては、このVES-SINEのinsertion index の一つとしている.ヒナコウモリ科に关する system analysis をおこなうにあたって, VES-SINE arrangement group からサブグループを検出し, これらの中から appropriately なincreased active period をhold つグループをanalytic に用いるNecessary があるため, Miniopterus fuscusのゲノムライブラリを成し, ここからVES-SINE arrangement を多単里して, これらのanalytic をおこなっている. VES-SINEはヒナコウモリ科にもexistingするが、それのSINEもそThe existence of れらのゲノムするかもしれないたあ, and this year's はそのExploration をおこなった.これまでゲノムライブラリのランダムシークエンスを入めてきたものの、Now のところ新regulationSINEは発见されていない.このExplorationはThe future will lead to the future and the future will be determined.