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レトロポゾンの増幅機構に関する研究

逆转录子扩增机制研究

基本信息

批准号：
03680135
负责人：
岡田典弘
金额：
$ 1.02万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1991
资助国家：
日本
起止时间：
1991 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03680135/
关键词：
レトロポゾンサケ科魚類 SINE 反復配列転移RNA 系統関係分子生物学塩基配列

项目摘要

我々は、サケ科魚類に存在する三種のレトロポゾンを単離し、そのそれぞれが、進化の異なる段階で増幅を行なっていることを明らかにした。すなわち、SmaIファミリ-はシロサケ、カラフトマスのみに存在するところから、この二種の共通祖先で増幅を行なったと考えられる。又、FokIファミリ-は、イナワ属のみに存在するところから、イワナ属が他のサケ科の魚類から分岐した後に、イワナ属の共通祖先で増幅を行なったと考えられる。第三のファミリ-であるHpaIファミリ-は、サケ科魚類のすべてに存在するので、サケ科魚類の共通祖先で増幅を行なったと考えられる。更に、私は、サケ科のすべての魚類のゲノムに存在するHpaIファミリ-が、サケ科の共通祖先ばかりではなく、進化の様々な段階で増幅を行なったサブファミリ-の検出を試みた。HpaIファミリ-のメンバ-をヒメマス、サクラマス、シロサケ、スチ-ルヘッドから単離し、塩基配列を決定し、ユニットをはさむように3'と5'側でプライマ-を合成し、サケ科各種のゲノムを鋳型としてPCRを行なったところ、全部で5種の進化の異なる段階で増幅を行なったようなHpaIファミリ-のサブファミリ-の検出に成功した。この結果サクラマスを除く6種のサケ属の系統関係が明らかになった。更に、SmaIファミリ-の起源と増幅のメカニズムを明らかにする目的で、SmaIファミリ-と相同性をもつ配列をサケ科魚類ゲノムで検索したところ、サケ科の魚類のうちで最も古い属と考えられるコルゴヌス属で、SmaIファミリ-と非常によく似たファミリ-が、増巾していることが明らかとなった。以上の事実により、サケ科の共通祖先でSmaIファミリ-及びコルゴヌス属で増幅しているファミリ-の原配列というべきものが存在し、それぞれの時期に少し配列が変化したファミリ-が増幅してきたものと想定される。

There are three kinds of information systems in our department and department of medical education, such as isolation, transmission, and improvement. There are two kinds of common ancestral records, namely, the common ancestral license, the same as the other two kinds of common ancestral license. In addition, the common ancestor of the genus FokI, the genus of the genus, the family of the family, and the common ancestor of the genus. In the third chapter, there are some common ancestral records, such as the common ancestral records, such as the HpaI family, the family, the family, and the family. For more information, and more information. HpaI products are not available in any number of industries, such as the number of customers, the number of users, the number of products, the number of products, and the number of products. In all 5 minutes, you will be able to change the number of HpaI messages in each segment. The results show that the system is responsible for the elimination of all six types of computers. In addition, SmaI, SmaI, and homology are listed in the following categories: the most ancient genus, the most ancient genus, the most common genus, the most ancient genus, the most common genus, the most ancient genus, the The above information and medical records are common to the ancestor of the SmaI system, which is the same as that of the family. In the original configuration, there is a link between the data and the data. In the previous configuration, the system is configured to change the number of users in the system.