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脊椎動物へのレトロポゾンの分散と種形成の分子機構

脊椎動物へのレトロポゾンの分散と種形成の分子機構
脊椎动物中反座子扩散和物种形成的分子机制
批准号：
01580149
负责人：
岡田 典弘
金额：
$1.09万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1989
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1989 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-01580149/
关键词：
レトロポゾン種形成サケリジンtRNA増巾

项目摘要

项目成果

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1.レトロポゾンの増幅によるサケ科ゲノムのシェイピングとリシェイピングについてサケ科は進化的に非常に新しい魚類でる。一説によれサケ科が成立したのは、200万年前であり、サケ属が成立したのは数十万年前であると言われている。従って例えばサケ属に属するシロサケとカラフトマスが分岐したのは、それよりもはるかに最近の出来事であると考えられる。これは、例えばラットとマウスが分岐したのが1千万年以上前であり、ヒトとチンパンジ-が100万年以上前に分岐したと言うことを考えれば、如何に最近の出来事であるかがわかる。我々は、サケ属4種、ニジマス属2種、イワナ属4種、イトウ属1種、合計11種のサケ科魚類のゲノムを分析することにより、以下のことを明らかにした。(1)サケ科には、配列の異なる3種類の、リジンtRNAを起源としたと考えられるレトロポゾンが存在する。(2)第一のレトロポゾンは、11種のサケ科の魚類全部で増幅している。第二のレトロポゾンは分析したイワナ属4種全部で増幅しているが、サケ属、ニジマス属、イトウ属では、増幅していない。第三のレトロポゾンはサケ属の中のシロサケとカラフトマスでのみ増幅している。(3)この様にサケ科魚類では、共通にリジンtRNAを起源としていると考えられるが、しかし配列の異なるレトロポゾンが、進化の異なる段階での差時的に増幅を行っている事が明らかになった。我々は、この様なレトロポゾンの増幅が、新しい表現型の出現と密接に相関している可能性があるのではないかと考えている。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
N.Okada: "Lysine tRNA-like structure of the human ALu family:Implications of its generation mechanism and possible functions." J.Mol.Evol.
N.Okada：“人类 ALu 家族的赖氨酸 tRNA 样结构：其生成机制和可能功能的含义。”
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
H.Endoh: "Highly repetitive and transcribable sequence in the tortoise genome is probably a retroposon." Eur.J.Biochem.
H.Endoh：“乌龟基因组中高度重复和可转录的序列可能是逆转录子。”
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
M.Hirono: "Tetrahymena actin,cloning and sequencing of the Tetrahymena actin gene and identification of its gene product." J.Mol.Biol.194. 181-192 (1987)
M.Hirono：“四膜虫肌动蛋白，四膜虫肌动蛋白基因的克隆和测序及其基因产物的鉴定。”
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
H.Endoh: "Tetrahymera pyriformis DNA fragment with a gene cluster for 3 putative serine tRNAs and an asparagine tRNA." Nucleic Acids Res.17. 10122 (1989)
H.Endoh：“梨形四膜虫 DNA 片段，带有 3 个假定的丝氨酸 tRNA 和一个天冬酰胺 tRNA 的基因簇。”
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    生物多様性獲得の分子機構
    • 批准号：
      21247038
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $10.73万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      岡田 典弘
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    哺乳類ゲノムにおけるレトロポゾン由来の高度保存配列の同定と機能解析
    • 批准号：
      07F07423
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.79万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      岡田 典弘
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    Sauria SINEの挿入を指標としたヘビ類の起源解明
    • 批准号：
      06F06184
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.54万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      岡田 典弘
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    SINE挿入を指標とした翼手目ヒナコウモリ科内部の系統解析
    • 批准号：
      05F05182
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.54万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      岡田 典弘
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    海外基金