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Sauria SINEの挿入を指標としたヘビ類の起源解明

使用蜥蜴 SINE 的插入作为指标来阐明蛇的起源

基本信息

批准号：
06F06184
负责人：
岡田典弘
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究ではヘビとトカゲ類の系統関係を解析するにあたり、そのゲノムにおけるSINEに関して解析をおこなった。SINEとはゲノム中に散在する短い反復配列であり、その有無を様々な種の相同遺伝子座間で比較することにより、信頼性の非常に高い系統樹の再構築が可能であることが知られている。平成19年度はヘビ・トカゲ類のゲノム中に存在するレトロポゾンの一種であるSauria SINEの解析を中心に進めた。特にSINEが水平伝播を起こした可能性について研究し、Sauria SINEが爬虫類ゲノムからウイルスゲノムへ水平伝播を起こした証拠を発見した。このウイルスはヒトの天然痘ウイルスに類似したものであるが、これまで哺乳類以外に感染するといった報告例は知られていない。そのため本研究の水平伝播の証拠は、このウイルスが爬虫類にも感染し得るという可能性を示す結果となった。この成果は2007年に論文としてPNAS誌に掲載された。さらに現在では、爬虫類の中でも唯一ゲノムプロジェクトが進められているトカゲ(グリーンアノール)のゲノムデータを詳細に解析し、Sauria SINEのみならず様々なタイプ新規レトロポゾンを発見している。これらは将来おこなわれるであろう様々な爬虫類のゲノム解析において必要な情報となる。このグリーンアノールの成果は近い将来論文として発表する予定である。

This study is aimed at analyzing the relationship between the two systems. SINE is a very high level tree that can be reconstructed by comparing the same genetic loci with each other. In 2019, there was an increase in the number of people in the group. In particular, the possibility of SINE horizontal propagation has been studied, and Sauria SINE has been discovered in reptiles. This is the first time that we've reported an infection other than mammalian infection. The results of this study demonstrate the likelihood of infection in reptiles. The results were published in the journal PNAS in 2007. Now, in reptiles, there are only one kind of special needs to be developed. The special needs of reptiles are analyzed in detail. Sauria SINE is a new kind of special needs to be developed. The reptiles need to analyze the necessary information. The results of this project are expected to be published in the near future.