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Sauria SINEの挿入を指標としたヘビ類の起源解明

Sauria SINEの挿入を指標としたヘビ類の起源解明
使用蜥蜴 SINE 的插入作为指标来阐明蛇的起源
批准号：
06F06184
负责人：
岡田 典弘
金额：
$1.54万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06F06184/
关键词：
レトロポゾン爬虫類進化ゲノムプロジェクト水平伝播SINE分子系統解析有鱗目SINE法レトロボゾン

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究ではヘビとトカゲ類の系統関係を解析するにあたり、そのゲノムにおけるSINEに関して解析をおこなった。SINEとはゲノム中に散在する短い反復配列であり、その有無を様々な種の相同遺伝子座間で比較することにより、信頼性の非常に高い系統樹の再構築が可能であることが知られている。平成19年度はヘビ・トカゲ類のゲノム中に存在するレトロポゾンの一種であるSauria SINEの解析を中心に進めた。特にSINEが水平伝播を起こした可能性について研究し、Sauria SINEが爬虫類ゲノムからウイルスゲノムへ水平伝播を起こした証拠を発見した。このウイルスはヒトの天然痘ウイルスに類似したものであるが、これまで哺乳類以外に感染するといった報告例は知られていない。そのため本研究の水平伝播の証拠は、このウイルスが爬虫類にも感染し得るという可能性を示す結果となった。この成果は2007年に論文としてPNAS誌に掲載された。さらに現在では、爬虫類の中でも唯一ゲノムプロジェクトが進められているトカゲ(グリーンアノール)のゲノムデータを詳細に解析し、Sauria SINEのみならず様々なタイプ新規レトロポゾンを発見している。これらは将来おこなわれるであろう様々な爬虫類のゲノム解析において必要な情報となる。このグリーンアノールの成果は近い将来論文として発表する予定である。
英文摘要
本研究ではヘビとトカゲ類の系統関係を解析するにあたり、そのゲノムにおけるSINEに関して解析をおこなった。SINEとはゲノム中に散在する短い反復配列であり、その有無を様々な種の相同遺伝子座間で比較することにより、信頼性の非常に高い系統樹の再構築が可能であることが知られている。平成19年度はヘビ・トカゲ類のゲノム中に存在するレトロポゾンの一種であるSauria SINEの解析を中心に進めた。特にSINEが水平伝播を起こした可能性について研究し、Sauria SINEが爬虫類ゲノムからウイルスゲノムへ水平伝播を起こした証拠を発見した。このウイルスはヒトの天然痘ウイルスに類似したものであるが、これまで哺乳類以外に感染するといった報告例は知られていない。そのため本研究の水平伝播の証拠は、このウイルスが爬虫類にも感染し得るという可能性を示す結果となった。この成果は2007年に論文としてPNAS誌に掲載された。さらに現在では、爬虫類の中でも唯一ゲノムプロジェクトが進められているトカゲ(グリーンアノール)のゲノムデータを詳細に解析し、Sauria SINEのみならず様々なタイプ新規レトロポゾンを発見している。これらは将来おこなわれるであろう様々な爬虫類のゲノム解析において必要な情報となる。このグリーンアノールの成果は近い将来論文として発表する予定である。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Sauria SINEs: Novel short interspersed retroposable elements that are widespread in reptile genomes
DOI： 10.1007/s00239-005-0201-5
发表时间： 2006-05-01
期刊： JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION
影响因子： 3.9
作者： [Piskurek, Oliver, Austin, Christopher C., Okada, Norihiro]
通讯作者： Okada, Norihiro
The evolution of SINEs in lizards and snakes uncover a lateral transfer event of a SINE from a highly poisonous snake to a smallpox-related virus
蜥蜴和蛇中 SINE 的进化揭示了 SINE 从剧毒蛇到天花相关病毒的横向转移事件
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [Piskurek, O., Austin, C.C., Okada, N, Oliver Piskurek]
通讯作者： Oliver Piskurek
生物多様性獲得の分子機構
  • 批准号：
    21247038
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额：
    $10.73万
  • 财政年份：
    2009
  • 负责人：
    岡田 典弘
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
哺乳類ゲノムにおけるレトロポゾン由来の高度保存配列の同定と機能解析
  • 批准号：
    07F07423
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.79万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    岡田 典弘
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
SINE挿入を指標とした翼手目ヒナコウモリ科内部の系統解析
  • 批准号：
    05F05182
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.54万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    岡田 典弘
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
LINE逆転写酵素によるRNA3,末端配列の認識機構
  • 批准号：
    14035218
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $2.05万
  • 财政年份：
    2002
  • 负责人：
    岡田 典弘
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology