Sauria SINEの挿入を指標としたヘビ類の起源解明

使用蜥蜴 SINE 的插入作为指标来阐明蛇的起源

• 批准号: 06F06184
• 负责人: 岡田 典弘
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06F06184/
• 关键词: レトロポゾン; 爬虫類進化; ゲノムプロジェクト; 水平伝播; SINE; 分子系統解析; 有鱗目; SINE法; レトロボゾン

本研究ではヘビとトカゲ類の系統関係を解析するにあたり、そのゲノムにおけるSINEに関して解析をおこなった。SINEとはゲノム中に散在する短い反復配列であり、その有無を様々な種の相同遺伝子座間で比較することにより、信頼性の非常に高い系統樹の再構築が可能であることが知られている。平成19年度はヘビ・トカゲ類のゲノム中に存在するレトロポゾンの一種であるSauria SINEの解析を中心に進めた。特にSINEが水平伝播を起こした可能性について研究し、Sauria SINEが爬虫類ゲノムからウイルスゲノムへ水平伝播を起こした証拠を発見した。このウイルスはヒトの天然痘ウイルスに類似したものであるが、これまで哺乳類以外に感染するといった報告例は知られていない。そのため本研究の水平伝播の証拠は、このウイルスが爬虫類にも感染し得るという可能性を示す結果となった。この成果は2007年に論文としてPNAS誌に掲載された。さらに現在では、爬虫類の中でも唯一ゲノムプロジェクトが進められているトカゲ(グリーンアノール)のゲノムデータを詳細に解析し、Sauria SINEのみならず様々なタイプ新規レトロポゾンを発見している。これらは将来おこなわれるであろう様々な爬虫類のゲノム解析において必要な情報となる。このグリーンアノールの成果は近い将来論文として発表する予定である。

This study で は ヘ ビ と ト カ ゲ の system masato is を parsing す る に あ た り, そ の ゲ ノ ム に お け る going に masato し て parsing を お こ な っ た. Going と は ゲ ノ ム に scattered in す る short い repeatedly with column で あ り, そ の presence of を others 々 な traces of the same kind of の 伝 stroma で comparison between す る こ と に よ り, letter 頼 の に の い system tree to build very high が may で あ る こ と が know ら れ て い る. Pp.47-53 19th annual は ヘ ビ · ト カ ゲ class の ゲ ノ ム に exist す る レ ト ロ ポ ゾ ン の a で あ る saurias going の parsing を center に into め た. Special に going が horizontal 伝 sowing を こ し た possibility に つ い て research し, saurias going が reptiles ゲ ノ ム か ら ウ イ ル ス ゲ ノ ム へ horizontal 伝 sowing を こ し た card 拠 を 発 see し た. こ の ウ イ ル ス は ヒ ト の natural acne ウ イ ル ス に similar し た も の で あ る が, こ れ ま で に than mammals す る と い っ た report cases は know ら れ て い な い. そ の た 伝 sowing の め の this research level certificate 拠 は, こ の ウ イ ル ス が reptiles に し も infection to る と い う possibility を す results indicated と な っ た. The に 2007 に paper と て て て was published in the PNAS journal に された. Now さ ら に で は, reptiles in the の で も only ゲ ノ ム プ ロ ジ ェ ク ト が into め ら れ て い る ト カ ゲ (グ リ ー ン ア ノ ー ル) の ゲ ノ ム デ ー タ を detailed analytical し に, saurias going の み な ら ず others 々 な タ イ プ new rules レ ト ロ ポ ゾ ン を 発 see し て い る. こ れ ら は future お こ な わ れ る で あ ろ う others 々 な reptiles の ゲ ノ ム parsing に お い て な necessary information と な る. <s:1> グリ グリ <s:1> アノ アノ アノ アノ である <s:1> achievements グリ recent グリ future papers と て て release schedule する confirmation である.

项目成果

Sauria SINEs: Novel short interspersed retroposable elements that are widespread in reptile genomes

• DOI: 10.1007/s00239-005-0201-5
• 发表时间: 2006-05-01
• 期刊: JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION
• 影响因子: 3.9
• 作者: Piskurek, Oliver;Austin, Christopher C.;Okada, Norihiro
• 通讯作者: Okada, Norihiro

The evolution of SINEs in lizards and snakes uncover a lateral transfer event of a SINE from a highly poisonous snake to a smallpox-related virus

蜥蜴和蛇中 SINE 的进化揭示了 SINE 从剧毒蛇到天花相关病毒的横向转移事件

• 发表时间: 2007
• 作者: Piskurek;O.;Austin;C.C.;Okada;N;Oliver Piskurek
• 通讯作者: Oliver Piskurek