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生体エネルギー変換システムの入出力のダイナミックな相関の1分子計測とモデル化

生体エネルギー変換システムの入出力のダイナミックな相関の1分子計測とモデル化
生物能量转换系统输入和输出之间动态相关性的单分子测量和建模
批准号:
05J09577
负责人:
谷口 雄一
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006

项目摘要

项目成果

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本研究の目標は、生体ナノモーターであるキネシンが、どのようなキネティクス経路を介して運動を発生するのかを記述し、キネシンによる生体エネルギー変換システムにおけるエネルギー変換の流れをモデル化することにある。現在キネシンのエネルギー変換のメカニズムに関しては、2つの相反するモデルが提唱されている。一つ目はタイトカップリングモデルであり、キネシンのメカノケミカルカップリングをギアとギアの噛み合わせに見立てたモデルである。キネシンは、ATP加水分解反応を通じて前後に単位ステップ運動を発生しながら運動機能を実現することが知られているが、このモデルの場合、キネシンの前方向へのステッチ(フォワードステップ)はATP加水分解反応とカップルしているのに対し、後ろ方向へのステップ(バックワードステップ)はATP加水分解反応とは関係なく起こる。一方、二つ目のモデルはルースカップリングモデルと呼ばれるモデルであり、キネシンのメカノケミカルカップリングがサーマルラチェットモデルなどの熱揺らぎを利用したメカニズムによって生じることを想定したモデルである。この場合、ATP加水分解反応はフォワードステップだけでなくバックワードステップにもカップルする。現在、両者のモデルのいずれが正しいかは未だ明らかとなっていないが、フォワードステップとバックワードステップのATPのカップリングを個別に調べることにより、これらの検証が可能となると考えられる。そこで我々は、1分子ナノ力学計測の技術を用いて、キネシンの前後のステップを様々なATP濃度で計測することにより、この問いを明らかとすることを試みた。その結果、キネシンの前後へのステップ頻度はATP濃度を上げることによって同様の割合で上昇することがわかった。このことは、前後のステップ運動がATPの結合反応によりトリガーされていることを直接示しており、キネシンのメカノカップリングがタイトではなくルースであることを示唆している。本研究の結果は、今後の生体ナノモーターの動作原理に関する研究に対して非常に大きな示唆を与えることが期待できる。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
It is entropy that biases the kinesin Brownian steps forward
正是熵使驱动蛋白布朗向前迈进了一步
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Biophysical Journal 90
影响因子: --
作者: [Taniguchi, Y., Karagiannis, P., Nishiyama, M., Ishii, Y., Yanagida, T.]
通讯作者: T.
DOI: 10.1016/j.biosystems.2006.08.016
发表时间: 2007-04-01
期刊: BIOSYSTEMS
影响因子: 1.6
作者: [Taniguchi, Yuichi, Karagiannis, Peter, Yanagida, Toshio]
通讯作者: Yanagida, Toshio
Entropy rectifies the Brownian steps of kinesin (24 Graphics Selection)
熵校正驱动蛋白的布朗步(24图形选择)
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Annual report of Osaka University 7
影响因子: --
作者: [Taniguchi, Y.]
通讯作者: Y.
DOI: 10.1038/nchembio741
发表时间: 2005-11-01
期刊: NATURE CHEMICAL BIOLOGY
影响因子: 14.8
作者: [Taniguchi, Y, Nishiyama, M, Yanagida, T]
通讯作者: Yanagida, T
Biophysics of higher-order molecular genome structure
  • 批准号:
    20H00460
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额:
    $28.54万
  • 财政年份:
    2020
  • 负责人:
    谷口 雄一
  • 依托单位:
1分子スケール蛍光分析化学の創出
細胞内全遺伝子発現の網羅的1分子解析
海外基金