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物理的に妥当な関係式による生体分子モーターF1-ATPaseのエネルギー論の展開

物理的に妥当な関係式による生体分子モーターF1-ATPaseのエネルギー論の展開
使用物理有效的关系表达式开发生物分子运动 F1-ATP 酶的能量学
批准号:
19H01864
负责人:
中山 洋平
金额:
$11.48万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-01 至 2024-03-31

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项目成果

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生体分子モーターF1-ATPaseの回転速度が、ATPをエネルギー源として分解して回転しているときと、ATPを合成しながら回転しているときとでは、基質であるATPおよびADPの濃度に対して異なる依存性を示す、という結果を2021年度に得ていたが、その実験において用いていた装置の問題により、F1-ATPaseにATPを合成させるために外部から加えていたトルクの大きさが非一様になってしまっていたことが判明した。そのため、トルクが一様になるように実験装置を調整した上で、全ての測定を再び行い直した。再測定で得られた結果は、前の結果と定性的には同じであり、特に、F1-ATPaseの回転速度の基質濃度依存性がATP分解と合成とで非対称である、という結論は影響なく保たれることが分かった。また、この結果によって、F1-ATPaseにおけるATP分解と合成との間の非対称性が、外部から加えるトルクに多少の非一様性があっても保たれるロバストな性質であることが明らかになった。さらに、得られた実験結果が数理モデルによって再現できるかを、数値計算を行って調べた。その結果、既存のモデルを微調整するだけで、定性的なレベルにとどまらず定量的にも実験結果を再現することに成功した。このモデルは、従来のHarada-Sasa等式を用いて得られた実験結果に基づいて提案されたものであり、今回の結果は別の角度からこのモデルの妥当性を検証したと位置付けられる。また、この結果によって、従来のHarada-Sasa等式をF1-ATPaseの実験で用いることの妥当性が補強されたと言える。
期刊论文(11)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
生体分子モーターF1のATP合成という目的に合った設計原理
生物分子马达F1 ATP合成的有目的设计原理
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Seya Atsumasa, Aoyagi Tatsuya, Itami Masato, Nakayama Yohei, Nakagawa Naoko, 中山洋平, 中山洋平,鳥谷部祥一, 中山洋平]
通讯作者: 中山洋平
Tight Chemomechanical Coupling of the F1 Motor Relies on Structural Stability
F1 电机的紧密化学机械耦合依赖于结构稳定性
DOI: 10.1016/j.bpj.2020.04.039
发表时间: 2020
期刊: Biophysical Journal
影响因子: 3.4
作者: [Tanaka Mana, Kawakami Tomohiro, Okaniwa Tomoaki, Nakayama Yohei, Toyabe Shoichi, Ueno Hiroshi, Muneyuki Eiro]
通讯作者: Muneyuki Eiro
Kinetic ratchet mechanism of F1-ATPase selectively suppresses hydrolysis of ATP
F1-ATPase 的动力学棘轮机制选择性抑制 ATP 水解
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Seya Atsumasa, Aoyagi Tatsuya, Itami Masato, Nakayama Yohei, Nakagawa Naoko, 中山洋平, 中山洋平,鳥谷部祥一, 中山洋平, 中山洋平,鳥谷部祥一, 中山洋平,鳥谷部祥一]
通讯作者: 中山洋平,鳥谷部祥一
自由エネルギーの浪費を抑えるF1-ATPaseの速度論的制御機構
F1-ATP酶抑制自由能浪费的动力学控制机制
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Seya Atsumasa, Aoyagi Tatsuya, Itami Masato, Nakayama Yohei, Nakagawa Naoko, 中山洋平, 中山洋平,鳥谷部祥一, 中山洋平, 中山洋平,鳥谷部祥一]
通讯作者: 中山洋平,鳥谷部祥一
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    歯周組織細胞間の情報伝達を担う液性因子を利用した歯肉創傷治癒促進剤の開発
    • 批准号:
      24K12935
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.91万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      中山 洋平
    • 依托单位:
    生体分子モーターF1への熱力学的不確定性関係の応用
    • 批准号:
      24K06971
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.91万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      中山 洋平
    • 依托单位:
    地方分権改革と政党政治の構造変容:仏日伊における党派ネットワークの比較分析
    • 批准号:
      23K01228
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $3.08万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      中山 洋平
    • 依托单位:
    歯周組織構成細胞による細胞間相互作用関連因子の同定と歯周病治療への応用
    • 批准号:
      21K09921
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.66万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      中山 洋平
    • 依托单位:
    海外基金