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プラスミドpCAR1の複製・接合伝達機構の解明

プラスミドpCAR1の複製・接合伝達機構の解明
阐明质粒pCAR1的复制和接合转移机制
批准号:
05J11509
负责人:
新谷 政己
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006

项目摘要

项目成果

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申請者は,カルバゾール(CAR)分解プラスミドpCAR1が宿主内で安定に保持されるためにparWAB産物が必要であることを明らかにした.またプラスミドの分配に際して必要なparB産物の結合サイト(parSと命名)の探索・同定を共同研究により行い,parA-parBの間の領域に存在することを確かめた.pCAR1の分配に関与する遺伝子領域は,pCAR1の属する不和合性群IncP-7プラスミド間で高度に保存されており,本研究の結果はIncP-7群に普遍的なものと考えられる.また,CARによるモデル汚染環境を作製し,プラスミド保持菌株接種後の挙動解析を行った.接種した菌株自身とプラスミドが接合伝達した菌株(transconjugant)とを区別する赤色蛍光タンパク質を利用するシステムを導入し,土壌(黒ボク土)および河川水(荒川中流域より採取)より作製した実環境モデル内におけるpCAR1の水平伝播現象をモニタリングした.このとき各サンプルの全菌体数,生育菌体数の変化,およびCARの消長についても経時的に解析した.その結果,河川水サンプルにおいてpCAR1の接合伝達現象を検出することに成功し,特にCAR(DMSO溶液)を添加したサンプルで,transconjugantの出現率が劇的に増加した.このとき,CARはtransconjugantの出現数と同調的に分解が進んでおり,CARの添加による(1)接種した菌株自身の増加,(2)受容菌となりうる菌株の増加,(3)transconjugantの増加,の3つの影響が考えられた.また得られたtransconjugantの90%以上がPseudomonas属細菌であったが,河川水等に存在するStenotrophomonas属細菌も見出された.これはIncP-7群プラスミドがPseudomonas属以外の菌株に接合伝達したことを示した初めての例である.
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1007/s10529-005-3892-1
发表时间: 2005-12-01
期刊: BIOTECHNOLOGY LETTERS
影响因子: 2.7
作者: [Shintani, M, Habe, H, Nojiri, H]
通讯作者: Nojiri, H
Characterization of replication, partition, and transfer functions of an IncP-7 plasmid pCAR1 carrying carbazole/dioxin degradative genes.
携带咔唑/二恶英降解基因的 IncP-7 质粒 pCAR1 的复制、分区和转移功能的表征。
DOI: --
发表时间:
期刊: Applied and Environment Microbiology 掲載予定
影响因子: --
作者: [Shintani, M., Yano, H., Habe, H., Omori, T., Yamane, H., Tsuda M., Nojiri, H.]
通讯作者: H.
DOI: 10.1128/jb.01486-06
发表时间: 2006-12
期刊: Journal of Bacteriology
影响因子: 3.2
作者: [M. Shintani;Masaaki Urata;Kengo Inoue;Kaori Eto;H. Habe;T. Omori;H. Yamane;H. Nojiri]
通讯作者: M. Shintani;Masaaki Urata;Kengo Inoue;Kaori Eto;H. Habe;T. Omori;H. Yamane;H. Nojiri
Characterization of replication, partition, and transfer functions of an IncP-7 plasmid pCAR1 carrying carbazole and dioxin degradative genes."
携带咔唑和二恶英降解基因的 IncP-7 质粒 pCAR1 的复制、分区和转移功能的表征。"
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Applied and Environment Microbiology 67
影响因子: --
作者: [Shintani, M., Yano, H., Habe, H., Omori, T., Yamane, H., Tsuda M., Nojiri, H.]
通讯作者: H.
プラスミドと細菌の共存機構に関する基盤研究
  • 批准号:
    23K26817
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $6.16万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    新谷 政己
  • 依托单位:
How can plasmids coexist with host bacteria?
  • 批准号:
    23H02124
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $12.15万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    新谷 政己
  • 依托单位:
Monitoring of plasmid behaviors in phytosphere in different climate zones
  • 批准号:
    20KK0128
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
  • 资助金额:
    $11.9万
  • 财政年份:
    2020
  • 负责人:
    新谷 政己
  • 依托单位:
海外基金