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ヒトゲノム構造にみられる遺伝子位置の偏りの意義とその進化過程に関する研究

人类基因组结构及其进化过程中基因位置偏差的意义研究

基本信息

批准号：
16710142
负责人：
小柳香奈子
金额：
$ 1.66万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

申請者のこれまでの研究から、ヒトゲノム上の遺伝子位置及びその構造に偏りがあることが明らかとなっていた。そこで、本課題ではこの偏りの意義の解明すること(目的1)、さらにこの遺伝子構造の進化過程を明らかにすること(目的2)、を目的として研究を行った。まず、ヒトゲノム上で偏りのみられたhead-to-head遺伝子ペアについて、成人における組織特異性に関する発現情報を用いて、遺伝子ペア間の発現パターンの比較を行った。その結果、遺伝子ペア間では弱いながら発現組織に相関がみられることがわかった。また、遺伝子ペア間において何か共通の特徴はないか、機能アノテーション情報を比較したが、機能アノテーションには特徴的な偏りはみられないことがわかった。これらのことから、ヒトゲノム構造にみられる偏りと遺伝子発現調節との間に関連性のあることが示唆された。次に、ヒトゲノム上でみられたゲノム構造の偏りが他の生物種でも保存しているか、それはヒトに至る進化の過程でいつ頃進化したのか、また他の生物種にその生物種固有のヒトとは異なった偏りや特徴がないか、といった点について解明する目的で、ヒト以外の生物種(マウス、フグ、ホヤ、ハエ、カ、線虫)についてゲノム構造の比較解析を行った。その結果、この遺伝子構造は哺乳類に特異的にみられるものであり、その他の真核生物にはみられない新しく進化した構造であること、という結果を得た。最終年度には、上記の結果をまとめ、国際雑誌に発表した。また日本遺伝学会第77回大会で発表し、Best Papers賞を受賞した。

The applicant's のこれまでの research から, ヒトゲノム上の伝子 position and びそのstructure に partial りがあることが明らかとなっていた.そこで、This topic ではこの partial りの义の明すること(Purpose 1)、さらにこの伝The evolutionary process of the sub-structure is as follows: を明らかにすること (purpose 2), をpurpose and として research を行った.まず、ヒトゲノム上でskewりのみられたhead-to-head弝子ペアについて、adultにおけるTissue-specific に关する発 appear information をいて, 伝子ペア间の発现パターンの comparison を行った.そのRESULT, その子ペア间では weak いながら発appears to organize にrelated がみられることがわかった.また、伝子ペア间において何か同の特徴はないか、FUNCTIONAL アノテーションinformationをComparative and functional アノテーションには特徴's な partial りはみられないことがわかった.これらのことから、ヒトゲノムstructure にみられる partial りと legacy The 伝子発 appears to regulate the relationship between the とのにのあることが出された.に、ヒトゲノム上でみられたゲノムstructuralの partialりがhisのbiotickindでもsavingしているか、そThe process of evolution from れはヒトに to るevolution, でいつ hectares evolution, したのか, またのbiotic species, にそのbiotic species inherent のヒトとはdifferent なった partial りや特徴がないか, といったPoint について Explain するpurpose で, ヒトの生Species (マウス, フグ, ホヤ, ハエ, カ, nematode) についてゲノムstructure の comparative analysis を行った.そのRESULT, この缝子 Structure, にみられるものであり, そのの that is specific to mammals Eukaryotes にはみられない新しくevolution したstructure であること, という results を got た. The final annual report, the result of the above record, and the international record of the year.またThe 77th General Meeting of the Japanese Heritage Society, the 77th General Assembly, the Best Papers Award, and the Receiver Award.