メダカ属の魚類に見る日本メダカ性決定遺伝子dmrtlbYの機能の分化

青鳉性别决定基因 dmrtlbY 在青鳉属鱼类中的功能分化

• 批准号: 17770002
• 负责人: 近藤 真理子
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17770002/
• 关键词: ゲノム; 進化; 遺伝子; 性決定; メダカ; 動物

日本メダカOryzias latipesの雄性決定遺伝子であるdmrt1bY遺伝子は常染色体上に存在するdmrt1a遺伝子の重複によって生じたと考えられる。今年度の研究ではその進化的側面に注目し、近縁種でのこれら2つの遺伝子のゲノム構造を解析した。日本メダカに近縁なハイナンメダカ(O.curvinotus)のOcudmrt1aとOcudmrt1bY、ルソンメダカ(O.luzonensis)のOludmrt1a遺伝子および偽遺伝子であるOludmrt1p遺伝子、インドメダカ(O.dancena)のOdadmrt1遺伝子の解析を行った。ゲノムBACまたはfosmidライブラリーからそれぞれのクローンを単離し、塩基配列を決定した。その結果、Ocudmrt1a 28kb、Ocudmrt1bY 37kb、Oludmrt1a 22kb、Odadmrt1 38kbの配列を得た。日本メダカのOladmrt1aおよびOladmrt1bY遺伝子も含めて比較した結果、全体的な相同性は系統関係を反映し、共通したintron/exon構造と、系統に特有の繰り返し配列が明らかになった。dmrt1a遺伝子は上流域の約3kbは相同性を示すものの、それよりも上流では相同性が見られない。dmrt1bYでは、相同性は上流1kbにしか見られず、これらの領域がそれぞれの遺伝子の制御領域であることが強く示唆された。ルソンメダカの偽遺伝子Oludmrt1pが起源的にはdmrt1bYに由来するものであるかを検証しようと試みた結果、ルソンメダカのこの領域は日本メダカの第18連鎖群に存在する32kbの領域に相当し、その領域にはdmrt1に類似した配列は存在しないことが明らかになった。すなわち、メダカ属の中で性決定遺伝子を生じるdmrt1の遺伝子重複意外にも遺伝子重複が少なくともルソンメダカでは起こったと考えられる。

The male of Japanese mackerel Oryzias latipes decides that there is an autosomal gene on the autosomal chromosome of the Japanese mackerel, the dmrt1a, the son, the weight, the weight, the birth, the birth, the In this year's research, we have paid close attention to the progress of this year's research, and we have made a comprehensive analysis of the recent progress in the field of research. In Japan, please tell me that you need to know that the Ocudmrt1bY (O.curvinotus) is Ocudmrt1a, the O.luzonensis (O.luzonensis) is Oludmrt1a, the child is Oludmrt1p, the O.dancena is Odadmrt1, and the line is parsed. "BAC", "fosmid", "make decisions", "determine", "determine" and "determine". Results, Ocudmrt1a 28kb, Ocudmrt1bY 37kb, Oludmrt1a 22kb, Odadmrt1 38kb were assigned to get the score. The results of the comparison results, the all identical system simulations, the common intron/exon models, and the system-specific systems that are unique to the system are included in the Japanese traditional Oladmrt1a system simulation results. The similarity of 3kb in the upper watershed of dmrt1a is similar to that of the upper stream. The dmrt1bY, the same 1kb, the higher level, and the higher level. The reason for the origin of the child Oludmrt1p is the origin of the dmrt1bY. The result of the test, the result of the test, the result of the The sex determines that the child is born, the dmrt1 is heavy, the child is heavy, and the child is heavy.

项目成果

Unprecedented intraspecific diversity of the MHC class I region of a teleost medaka, Oryzias latipes

• DOI: 10.1007/s00251-005-0009-x
• 发表时间: 2005-07
• 期刊: Immunogenetics
• 影响因子: 3.2
• 作者: Kentaro Tsukamoto;Shinpei Hayashi;M. Matsuo;M. Nonaka;M. Kondo;A. Shima;S. Asakawa;N. Shimizu;M. Nonaka

Divergent expression patterns of Sox9 duplicates in teleosts indicate a lineage specific subfunctionalization

• DOI: 10.1007/s00427-005-0477-x
• 发表时间: 2005-06-01
• 期刊: DEVELOPMENT GENES AND EVOLUTION
• 影响因子: 2.4
• 作者: Klüver, N;Kondo, M;Schartl, M
• 通讯作者: Schartl, M

Genomic organization of the sex-determining and adjacent regions of the sex chromosomes of medaka

• DOI: 10.1101/gr.5016106
• 发表时间: 2006-07-01
• 期刊: GENOME RESEARCH
• 影响因子: 7
• 作者: Kondo, Mariko;Hornung, Ute;Schartl, Manfred
• 通讯作者: Schartl, Manfred