Analyses of interaction between the reconstituted chromatin fiber and the nuclear matrix

重建染色质纤维与核基质之间相互作用的分析

• 批准号: 18770131
• 负责人: HIZUME Kohji
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18770131/
• 关键词: タンパク質; 核酸の構造; 動態; 機能; クロマチン; ヌクレオソーム; AFM; 核マトリクス

遺伝情報を担うDNA分子を含むクロマチンファイバーが、細胞核内部の骨格構造とどのように相互作用しているのかを明らかにするため、その構造を試験管内で人工的に再構築し、原子間力顕微鏡による観察を行った。その結果、核内骨格の構成因子であるtopo IIタンパク質を加えることで、クロマチンファイバーがたぐり寄せられるように集合し、ループ状構造を形成することを明らかにした。また、クロマチンのアセチル化修飾を引き金に、クロマチンファイバーが弛緩して細くなり、更に、核内骨格から遊離し易い(自由度の高い)状態へと変化することを示唆する実験結果を得た。

The information contained in the DNA molecule was analyzed by atomic force microscopy. As a result, the composition factor of the nuclear skeleton is increased, and the structure is formed. The results of this study are as follows: (1) The change of nuclear structure from free to middle (high degree of freedom) state is shown in the following table.

项目成果

Topoisomerase II, scaffold component, promotes chromatin compaction in vitro in a linker-histone H1-dependent manner

• DOI: 10.1093/nar/gkm116
• 发表时间: 2007-04-01
• 期刊: NUCLEIC ACIDS RESEARCH
• 影响因子: 14.9
• 作者: Hizume, Kohji;Araki, Sumiko;Takeyasu, Kunio
• 通讯作者: Takeyasu, Kunio

Removal of histone tails from nucleosome dissects the physical mechanisms of salt-induced aggregation, linker histone H1-induced compaction, and 30-nm fiber formation of the nucleosome array

• DOI: 10.1016/j.ultramic.2009.03.014
• 发表时间: 2009-07-01
• 期刊: ULTRAMICROSCOPY
• 影响因子: 2.2
• 作者: Hizume, Kohji;Nakai, Tonau;Takeyasu, Kunio
• 通讯作者: Takeyasu, Kunio

An insight into nucleosome-packing mechamisms obtained from chromatin reconstitution and nano-technology

通过染色质重建和纳米技术深入了解核小体包装机制

• 发表时间: 2008
• 作者: Hizume K;Nakai T;Araki S;Prieto E;Yoshikawa K;Takeyasu K
• 通讯作者: Takeyasu K

Chromatin and Disease, (Hizume K, Yoshimura SH, Kumeta M, Takeyasu K.(分担), "Structural organization of dynamic chromatin.")

染色质与疾病，（Hizume K、Yoshimura SH、Kumeta M、Takeyasu K.（贡献者），“动态染色质的结构组织。”）

• 发表时间: 2007
• 作者: T.K Kundu. Dipak D;(編)
• 通讯作者: (編)

Transcriptional coactivator PC4, a chromatin-associated protein, induces chromatin condensation

• DOI: 10.1128/mcb.00887-06
• 发表时间: 2006-11-01
• 期刊: MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.3
• 作者: Das, Chandrima;Hizume, Kohji;Kundu, Tapas K.
• 通讯作者: Kundu, Tapas K.