GRAPE型専用計算機による量子化学
GRAPE型専用計算機による量子化学
批准号:
18700288
负责人:
安田 耕二
金额:
$0.7万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
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英文摘要
量子化学計算で最もよく使われる密度汎関数法を、SIMD型計算機で実行する事で、飛躍的な高速化を目指した研究である。最近のグラフィックボードは単精度で高速なSIMD型プロセッサで作られており、多数出荷されるため価格性能比が高い。そこでグラフィックボードで密度汎関数計算をするアルゴリズムを開発した。単精度演算でも必要精度が得られるよう、昨年開発したCoulomb項と交換相関項の計算アルゴリズムを改良した。NVIDIA社のGeForce8800 GTXにCUDAを用いて実装し、インターフェースC関数を書き、Gaussian03と結合した。代表分子としてTaxolやValinomycinを選び、計算精度と実行時間を調べた。単精度演算でも、倍精度と実用上差が無いエネルギーが得られた。またCoulomb項はPentium42.8GHzの約10倍、交換相関項は約80倍の速度を得た。全体では最新のQuad core CPUの約7倍の速度であり、安価なグラフィックボードで密度汎関数計算を、大幅に加速できる事が分かった。
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会议论文
The extension of the fragment molecular orbital method with the many-particle Green's function
多粒子格林函数碎片分子轨道法的推广
DOI:
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发表时间:
2006
期刊:
Journal of Chemical. Physics 125・15
影响因子:
--
作者:
[Koji Yasuda, Daisuke Yamaki]
通讯作者:
Daisuke Yamaki
Two-electron integral evaluation on the graphics processor unit
图形处理器单元的二电子积分评估
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Journal of Computational Chemistry 29
影响因子:
--
作者:
[Tsuyoshi Kato, Wataru Fujibuchi, Kiyoshi Asai, Hiroshi Ohno, 内藤 泰宏, Hitomi Itoh, 内藤 泰宏, 藤本 顕士, Koji Yasuda]
通讯作者:
Koji Yasuda
グラフニューラルネットワークによる有機遷移金属反応の機械学習
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批准号:21K12027
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2021
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负责人:安田 耕二
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依托单位:
理論的に導かれた量子力学/分子力学(QM/MM)法の開発と酵素反応への応用
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批准号:16750143
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:2004
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负责人:安田 耕二
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依托单位:
分子や固体の電子状態を解明する、密度行列汎関数理論の開発
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批准号:12042234
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:2000
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负责人:安田 耕二
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依托单位:
分子や固体の電子状態を解明する、密度行列汎関数理論の開発
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批准号:11166228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.13万
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财政年份:1999
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负责人:安田 耕二
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依托单位:
海外基金