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Novel metabolic pathway discovery based on contradictions between genome data and biochemical properties

Novel metabolic pathway discovery based on contradictions between genome data and biochemical properties
基于基因组数据和生化特性之间矛盾的新代谢途径发现
批准号：
19310126
负责人：
ATOMI Haruyuki
金额：
$13.23万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19310126/
关键词：
ゲノム情報機能未知遺伝子代謝超好熱菌補酵素APantoate kinasePhosphopantothenate synthetase始原菌遺伝子破壊pantoate kinaseGHMP kinaseゲノム形質代謝経路酵素遺伝子機能アノテーション

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究は超好熱始原菌の一種Thermococcus kodakaraensis を対象に新規代謝酵素や経路の同定を目的としたものである.アプローチとしてはゲノム情報に基づいて推定される代謝機能と実際の形質(細胞の増殖特性)の矛盾に着目して新規酵素・代謝系を探索する方法をとった.特にペントース代謝、アミノ酸合成経路や補酵素の合成経路を中心に進めた結果、糖代謝・アミノ酸代謝・脂質代謝で中心的な役割を果たす補酵素A(coenzyme A, CoA)の新しい合成ルートを発見することができた.
英文摘要
本研究は超好熱始原菌の一種Thermococcus kodakaraensis を対象に新規代謝酵素や経路の同定を目的としたものである.アプローチとしてはゲノム情報に基づいて推定される代謝機能と実際の形質(細胞の増殖特性)の矛盾に着目して新規酵素・代謝系を探索する方法をとった.特にペントース代謝、アミノ酸合成経路や補酵素の合成経路を中心に進めた結果、糖代謝・アミノ酸代謝・脂質代謝で中心的な役割を果たす補酵素A(coenzyme A, CoA)の新しい合成ルートを発見することができた.
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Type III Rubisco とCalvin 回路の進化
III 型 Rub​​isco 和 Calvin 电路的演变
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Barman, H.K., Takami, Y., Nishijima, H., Shibahara, K., Sanematsu, F., Nakayama, T., 跡見晴幸]
通讯作者： 跡見晴幸
Thermococcus kodakaraensisの特異なペントース代謝機構
柯达卡拉热球菌独特的戊糖代谢机制
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Kikuchi, H., Nakayama, T., 跡見晴幸]
通讯作者： 跡見晴幸
The Fur iron regulator-like protein iscryptic in the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis, FEMS Microbiol
超嗜热古菌 Thermococcus kodakaraensis 中的毛皮铁调节样蛋白是神秘的，FEMS Microbiol
DOI： --
发表时间： 2009
期刊： Lett., Online early 10.1111/j
影响因子： --
作者： [Louvel H., Kanai T, Atomi, H, Reeve JN]
通讯作者： Reeve JN
A novel ADP-forming succinyl-CoA synthetase in Thermococcus kodakaraensis structurally related to the archaeal nucleoside diphosphate-forming acetyl-CoA synthetase
柯达卡拉热球菌中一种新型 ADP 形成琥珀酰辅酶 A 合成酶，其结构与古菌核苷二磷酸形成乙酰辅酶 A 合成酶相关
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： Journal of Biological Chemistry 282
影响因子： --
作者： [Shikata K, Fukui T, Atomi H, Imanaka T]
通讯作者： Imanaka T
共 11 条
    Exploring the possibilities of genome recombination
    • 批准号：
      22655053
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.19万
    • 财政年份：
      2010
    • 负责人：
      ATOMI Haruyuki
    • 依托单位：
      Kyoto University
    Determining the regulons and their functions in hyperthermophiles
    • 批准号：
      21350092
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.23万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      ATOMI Haruyuki
    • 依托单位：
      Kyoto University
    Elucidation of gene regulation systems based on genome analysis
    • 批准号：
      17350083
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $9.66万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      ATOMI Haruyuki
    • 依托单位：
      Kyoto University
    Development of a system for enhancing protein thermostability in vivo using hyperthermophiles
    • 批准号：
      15350100
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $9.73万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      ATOMI Haruyuki
    • 依托单位：
      Kyoto University
    海外基金