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Study on structures, functions and applications of novel endo-type and exo-type glycoceramidases involved in glycosphingolipid metabolism

Study on structures, functions and applications of novel endo-type and exo-type glycoceramidases involved in glycosphingolipid metabolism
鞘糖脂代谢中新型内切型和外切型神经酰胺酶的结构、功能及应用研究
批准号:
19380061
负责人:
ITO Makoto
金额:
$12.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008

项目摘要

项目成果

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スフィンゴ脂質は、形質膜ミクロドメインに主として存在し、細胞内のシグナリングや細胞間の相互作用に重要な役割を演じている。本研究では、申請者らが発見した非リソソーム性スフィンゴ脂質代謝酵素の構造と機能について研究を行い、以下のような成果を上げた。先ず、哺乳動物の細胞質に存在するグルコシルセラミド(GlcCer)分解酵素(エキソ型グリコセラミダーゼ)をクローニングした。本酵素は、老化関連タンパク質クロトーのホモログ(KLrP)であった。本酵素の活性をRNAi で抑制すると、細胞内のGlcCer 量およびGlcCer骨格を持つ糖脂質量が減少することを見出し、KLrPが細胞の糖脂質代謝に関わっていることを示した。本酵素を大腸菌で大量に発現させ、グルコース及びガラクトースとの共結晶を作製し、X線結晶構造解析を行った。その結果、KLrPはαヘリックスとβストランドを8回繰り返す、典型的なTIMバレル構造を示すこと、β-ストランド4および7のC 末に存在するE165とE373がそれぞれ酸/塩基触媒残基、求核残基であることを証明した。また、本研究においてリソソーム性の中性セラミダーゼの結晶構造解析に初めて成功した。その構造は今までに報告のない新しいものであり、その触媒機構は亜鉛を触媒中心とすることを明らかにした。構造を解くことで、スフィンゴ脂質シグナリングや食餌由来のセラミドの代謝・消化への関与等、本酵素の多彩な機能が合理的に説明できた。一方、放線菌から単離したエンド型グリコセラミダーゼ(EGALC)の基質特異性を詳細に調べ、本酵素は6ガラ系列糖脂質に特異的に作用することを明らかにした。また、EGALC は加水分解のみならず糖鎖の転移反応も効率よく触媒することも明らかになった。この特異性を利用した、6-ガラ系列糖脂質の蛍光標識法及び微量定量法を開発し、その方法を用いて、病原性の原虫、糸状菌、及び食用海藻等に6-ガラ系列糖脂質が存在することを見出した。海藻から単離した6-ガラ系列糖脂質の構造解析を行い、その構造を1-phytyl-3-O-[α-D-galactopyranosyl-(1-6)-β-D-galactopyranosyl]- glycerol と同定した。このような構造の糖脂質は初めての報告である。
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会议论文
Mechanical insights into the hydrolysis and synthesis of ceramide by neutral ceramidase
中性神经酰胺酶水解和合成神经酰胺的机械见解
DOI: --
发表时间: 2009
期刊: J. Biol. Chem
影响因子: --
作者: [Inoue T, Okino N(12人中2番目First equal contribution), Kakuta Y(12人中3番目), Ito M(12人中12番目)]
通讯作者: Ito M(12人中12番目)
Synthesis of fluorescent glycosphingolipids and neoglycoconjugates which contain 6-gala oligosaccharides using the transglycosylation reaction of a novel endogalacosylceramidase(EGALC)
利用新型内切半乳糖基神经酰胺酶 (EGALC) 的转糖基反应合成荧光鞘糖脂和含有 6-半乳糖寡糖的新糖缀合物
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: J. Biochem. 142
影响因子: --
作者: [Y. Ishibashi, M. Ito. (他2名)]
通讯作者: M. Ito. (他2名)
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [Y. Hayashi, et. al., 伊東信, M. Ito, M. Ito, 伊東信]
通讯作者: 伊東信
Comprehensive Glycoscience (Editor-in-Chief, J. P. Kamerling)
综合糖科学(J. P. Kamerling 主编)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: [S. Ogawa, T. Shimizu, H. Ohki, T. Araya, T. Okuno, K. Miyairi, M. Ito]
通讯作者: M. Ito
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    Studies on structures and functions of fungus glycolipid-metabolizing enzymes
    • 批准号:
      24380058
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.56万
    • 财政年份:
      2012
    • 负责人:
      ITO Makoto
    • 依托单位:
    Changes of developments of central auditory system following early hearing loss in animal experiment.
    • 批准号:
      22591877
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.91万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      ITO Makoto
    • 依托单位:
    Modeling of sediment-wave depositional facies
    • 批准号:
      22540465
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.66万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      ITO Makoto
    • 依托单位:
    Human Flow and the reintegration of return migrants in South East Asia:Social Anthropological perspective
    • 批准号:
      22320175
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $12.15万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      ITO Makoto
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    黄精酵素活性成分动态变化及抗衰老通路调控研究
    • 批准号:
      JCZRLH202601248
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
    • 依托单位:
    “姜枣杞”药食同源复合酵素研发及应用
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      张文林
    • 依托单位:
    农用植物酵素对油茶叶部病害的抑菌效果及防效研究
    • 批准号:
      2023JJ50469
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      郝亚伦
    • 依托单位:
    一种酵素组合物及其在美白功能化妆品中的应用