Development of a method for high-throughput analysisof HiCEP data

HiCEP 数据高通量分析方法的开发

• 批准号: 19700273
• 负责人: KADOTA Koji
• 金额: $ 0.74万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19700273/
• 关键词: バイオインフォマティクス; AFLP; HiCEP; マイクロアレイ

HiCEP法は、マイクロアレイなど他の技術では不可能であった未知遺伝子を含む転写物の網羅的単離およびプロファイリングが全ての生物で可能な唯一の実験技術であるが、一次元電気泳動(1-DE)パターン比較に基づく発現プロファイル解析法であるため、データ解析に多くの手間と時間がかかっていた。本研究課題によって開発された手法の適用により、データ解析の大部分において自動化が達成できた。

In the HiCEP method, it is not possible to detect other technical problems. It is not possible to detect the unknowns of the offline writing network. The whole biological system may be unique in terms of technical performance, single-element swimming (1-DE), comparison and analysis. To analyze multi-user mobile phone time, please do not listen to the mobile phone. The purpose of this study is to analyze most of the patients by using the method of self-initialization in this study.

项目成果

マイクロアレイ解析の話:発現変動遺伝子検山あたりを中心に

谈微阵列分析：聚焦表达变异基因检测

• 发表时间: 2009
• 作者: Kadota;K.;門田幸二;成川真隆,中井雄治,南道子,門田幸二,三坂巧,阿部啓子;新谷政己,高橋裕里香,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭;高橋裕里香,新谷政己,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭;門田幸二
• 通讯作者: 門田幸二

トランスクリプトーム解析手法の開発

转录组分析方法的发展

• 发表时间: 2008
• 作者: Kadota;K.;門田幸二;成川真隆,中井雄治,南道子,門田幸二,三坂巧,阿部啓子;新谷政己,高橋裕里香,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭;高橋裕里香,新谷政己,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭;門田幸二;門田幸二;門田幸二
• 通讯作者: 門田幸二

Evaluation of two outlier-detection-based methods for detecting tissue-selective genes from microarray data

评估两种基于异常值检测的微阵列数据检测组织选择性基因的方法

• 发表时间: 2007
• 期刊: Gene Regulation and Systems Biology 1
• 作者: Kadota K;Konishi T;Shimizu K.
• 通讯作者: Shimizu K.

HiCEPデータのマイクロアレイ様データへの変換 : HiCEPもアレイ用解析手法が利用可能です

将 HiCEP 数据转换为类似微阵列的数据：阵列分析方法也可用于 HiCEP。

• 发表时间: 2007
• 作者: Kadota K.;Nakai Y;Shimizu K.;門田幸二,中井雄治,清水謙多郎;門田幸二;門田幸二;門田幸二
• 通讯作者: 門田幸二

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