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Development of a method for high-throughput analysisof HiCEP data

Development of a method for high-throughput analysisof HiCEP data
HiCEP 数据高通量分析方法的开发
批准号：
19700273
负责人：
KADOTA Koji
金额：
$0.74万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19700273/
关键词：
バイオインフォマティクスAFLPHiCEPマイクロアレイ

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HiCEP法は、マイクロアレイなど他の技術では不可能であった未知遺伝子を含む転写物の網羅的単離およびプロファイリングが全ての生物で可能な唯一の実験技術であるが、一次元電気泳動(1-DE)パターン比較に基づく発現プロファイル解析法であるため、データ解析に多くの手間と時間がかかっていた。本研究課題によって開発された手法の適用により、データ解析の大部分において自動化が達成できた。
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会议论文
マイクロアレイ解析の話:発現変動遺伝子検山あたりを中心に
谈微阵列分析：聚焦表达变异基因检测
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [Kadota, K., 門田幸二, 成川真隆,中井雄治,南道子,門田幸二,三坂巧,阿部啓子, 新谷政己,高橋裕里香,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭, 高橋裕里香,新谷政己,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭, 門田幸二]
通讯作者： 門田幸二
トランスクリプトーム解析手法の開発
转录组分析方法的发展
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Kadota, K., 門田幸二, 成川真隆,中井雄治,南道子,門田幸二,三坂巧,阿部啓子, 新谷政己,高橋裕里香,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭, 高橋裕里香,新谷政己,徳丸裕樹,門田幸二,原啓文,宮腰昌利,西田洋巳,山根久和,野尻秀昭, 門田幸二, 門田幸二, 門田幸二]
通讯作者： 門田幸二
Evaluation of two outlier-detection-based methods for detecting tissue-selective genes from microarray data
评估两种基于异常值检测的微阵列数据检测组织选择性基因的方法
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： Gene Regulation and Systems Biology 1
影响因子： --
作者： [Kadota K, Konishi T, Shimizu K.]
通讯作者： Shimizu K.
HiCEPデータのマイクロアレイ様データへの変換 : HiCEPもアレイ用解析手法が利用可能です
将 HiCEP 数据转换为类似微阵列的数据：阵列分析方法也可用于 HiCEP。
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [Kadota K., Nakai Y, Shimizu K., 門田幸二,中井雄治,清水謙多郎, 門田幸二, 門田幸二, 門田幸二]
通讯作者： 門田幸二
共 29 条
    Update and expansion of the website "nucleotide sequence analysis (with R)"
    • 批准号：
      18K11521
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2018
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Properties of correction of motor error induced by self-body motion
    • 批准号：
      24500739
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.49万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      Osaka University
    Guidelines for differential expression analysis from RNA-seq data
    • 批准号：
      24500359
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.41万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Methods for detecting differentially expressed genes with reproducibility, sensitivity, and specificity from microarray data
    • 批准号：
      21710208
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $1.91万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    国内基金
    海外基金
    山药抗炭疽病相关的AFLP、ISSR标记及SCAR转化
    • 批准号：
      31260346
    • 项目类别：
      地区科学基金项目
    • 资助金额：
      49.0万元
    • 批准年份：
      2012
    • 负责人：
      黄东益
    • 依托单位：
      海南大学
    淡色库蚊溴氰菊酯抗性AFLP分析与QTL图谱构建
    • 批准号：
      81171610
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      58.0万元
    • 批准年份：
      2011
    • 负责人：
      朱昌亮
    • 依托单位：
      南京医科大学
    利用改良型cDNA-AFLP技术筛选木薯抗旱相关基因
    • 批准号：
      31000537
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      17.0万元
    • 批准年份：
      2010
    • 负责人：
      陈新
    • 依托单位：
      中国热带农业科学院
    不同种质忍冬AFLP指纹图谱及其药材药效组分HPLC指纹图谱关联性的研究
    • 批准号：
      30973879
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      31.0万元
    • 批准年份：
      2009
    • 负责人：
      郭庆梅
    • 依托单位：
      山东中医药大学