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Methods for detecting differentially expressed genes with reproducibility, sensitivity, and specificity from microarray data

Methods for detecting differentially expressed genes with reproducibility, sensitivity, and specificity from microarray data
从微阵列数据中检测差异表达基因的方法具有重现性、敏感性和特异性
批准号：
21710208
负责人：
KADOTA Koji
金额：
$1.91万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2009 至 2011
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21710208/
关键词：
バイオインフォマティクスマイクロアレイ遺伝子発現

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
为了提高微阵列分析的灵敏度、特异性和可重复性，研究人员需要选择合适的预处理算法和基因排序方法的组合。我们建议使用WAD。
英文摘要
In order to increase sensitivity, specificity, and reproducibility in microarray analyses, researchers need to select suitable combinations of preprocessing algorithms and gene ranking methods. We recommend the use of WAD for the purpose.
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会议论文
Ketogenic Diet Disrupts the Circadian Clock and Increases Hypofibrinolytic Risk by Inducing Expression of Plasminogen Activator Inhibitor-1
DOI： 10.1161/atvbaha.109.190140
发表时间： 2009-10-01
期刊： ARTERIOSCLEROSIS THROMBOSIS AND VASCULAR BIOLOGY
影响因子： 8.7
作者： [Oishi, Katsutaka, Uchida, Daisuke, Horie, Shuichi]
通讯作者： Horie, Shuichi
バイオチップ実用化ハンドブック
生物芯片实际应用手册
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [Takahasi, K. R., and H. Innan, 伊藤安海, 叶直樹]
通讯作者： 叶直樹
研究代表者ホームページ
研究代表主页
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
トランスクリプトーム解析におけるバイオインフォマティクス要素技術～私の相場観～,日本バイオインフォマティクス学会
转录组分析中的生物信息学基础技术 - 我的市场观点 - 日本生物信息学会
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [Matsuo, N.Mase, H.Makino, M.Takahashi, H.Banno, H., 門田幸二, N.Matsuo, 門田幸二]
通讯作者： 門田幸二
共 21 条
    Update and expansion of the website "nucleotide sequence analysis (with R)"
    • 批准号：
      18K11521
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2018
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Properties of correction of motor error induced by self-body motion
    • 批准号：
      24500739
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.49万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      Osaka University
    Guidelines for differential expression analysis from RNA-seq data
    • 批准号：
      24500359
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.41万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Development of a method for high-throughput analysisof HiCEP data
    • 批准号：
      19700273
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $0.74万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      KADOTA Koji
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    海外基金