インターフェロン誘導型抗ウイルス機構2-5Aシステムにおける機能制御の構造的基盤

干扰素诱导抗病毒机制2-5A系统功能调节的结构基础

• 批准号: 19659009
• 负责人: 田中 信忠
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Showa University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19659009/
• 关键词: インターフェロン; オリゴアデニル酸; 結晶構造; 立体構造; リボヌクレアーゼ

本研究では、抗ウイルス薬として生体内で安定な2-5A類似化合物のデザインに役立てるため、(A) 活性型ヒトRNase L/2-5A複合体の立体構造解析により、2-5AによるRNase Lの2量体化並びに活性化機構、RNase LによるRNAの認識・分解機構を解明し、(B) 活性型ヒト2-50AS(系の正の制御因子)の立体構造解析により、2-5Aの合成機構を解明し、(C) ヒト2'-PDE(系の負の制御因子)の立体構造解析により、2-5Aの認識・分解機構を解明し、これらの立体構造情報に基づいて2-5Aを鍵分子として複数の蛋白質が離合集散する系の機能制御を原子レベルで理解することを目指している。今年度は昨年度に引き続き、各々の構造解析タンパク質に関し、以下の手順でリガンド存在下、非存在下の両方において、数百種類の結晶化条件のスクリーニングを行った。しかし、いずれに関しても、未だ結晶が得られていない。(1) 大量発現条件(発現用ベクター・ホストの組み合わせ、培養温度、誘導条件など)の最適化。(2) 大腸菌の大量培養。20～25℃での低温培養により、可溶性画分の収量が増すことを確認済み。(3) 数種類(親和性、イオン交換、ゲルろ過等)のクロマトグラフィーによる、蛋白質の精製。(4) 蛋白質の濃縮、複合体の調製。(5) 結晶化条件の探索及び最適化。また、昨年度、ヒトRNaseLに関し、生理機能の類似性は無いもののアミノ酸配列に類似性が認められる酵母由来Ire1タンパク質の立体構造情報(Leeら、Cell, 2008)に基づいてRNaseLのドメイン構造の推定を行い、C末端RNaseドメインの発現系をデザインした。今年度は、その発現系を用い、組換え蛋白質の発現精製を行った。少量であるが、再現性良く精製サンプルが得られ、現在結晶化条件の探索を進めている。

In this study, we investigated the activity of 2- 5A-like compounds in vivo,(A) the stereostructural analysis of the active-type RNase L/2- 5A complex,(B) the recognition and decomposition mechanism of RNase L and RNA,(C) the stereostructural analysis of the active-type RNase L/2- 5A complex, and (D) the activation mechanism of RNase L and RNA. The analysis of the stereo structure of (positive control factor),(2-5A),(C),(2'-PDE),(C),(D),(D),(D This year, the structure analysis of each crystal is related to the quality of the crystal. The following procedures are carried out in the presence and absence of crystallization conditions. In the middle of the night, there was no light, no light, no light. (1)Optimization of mass production conditions (production parameters, culture temperature, induction conditions). (2)Coliform mass culture. When incubated at 20~25℃, the amount of soluble fraction increased and the temperature was determined. (3)Several kinds (affinity, color exchange, color exchange, etc.) of protein purification. (4)Protein concentration, complex modulation. (5)Exploration and optimization of crystallization conditions. In addition, in the past year, the relationship between RNase L and C-terminal RNase, the similarity of physiological function, the similarity of amino acid alignment, the identification of yeast origin, the three-dimensional structure information of Ire1 protein (Lee, Cell, 2008), the estimation of basic RNase L structure, and the development of C-terminal RNase. This year, the development of the system, the composition of protein development and purification. A small amount of, reproducibility, good refinement, now crystallization conditions and exploration