权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

肝芽腫DNAメチル化プロフィールに基づく予後予測分子マーカーの確立

基于肝母细胞瘤DNA甲基化谱的预后分子标志物的建立

基本信息

批准号：
23659822
负责人：
宮城久之
金额：
$ 2.33万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

肝芽腫の悪性度を決める重要な要因はDNAメチル化異常であるという着想から、肝芽腫の予後を規定する分子マーカーをDNAメチル化解析によって探求することを目的とした。肝芽腫腫瘍検体からmacrodissectionによって胎児型・胎芽型肝芽腫の領域を分けて採取し、それぞれから抽出したDNAを次世代型シークエンサーを用いて網羅的メチル化解析をおこなった。正常肝組織と比較して2倍以上のメチル化率を示したCpGサイトを有する遺伝子は、胎児型で1,638遺伝子、胎芽型で2,019遺伝子存在した。肝腫瘍cellline(HuH6, HepG2)を5-aza-dCにて脱メチル化処理し、発現アレイ解析を用いてメチル化によって発現抑制を受ける遺伝子を解析した。脱メチル化処理により2倍以上の発現を呈した遺伝子は905個存在した。上記のメチル化アレイ解析と発現アレイ解析によって得られた遺伝子を照らし合わせることによって、83の候補癌抑制遺伝子が抽出された。現在個々の遺伝子について実際に臨床検体を用いてメチル化率を解析している所である。病理組織学的に分類される胎芽型肝芽腫(embryonal type : 高悪性度)と胎児型肝芽腫(fetal type : 低悪性度)を分別して、組織型に応じたDNAメチル化プロフィールを解析し、特異的にメチル化率の異なる候補癌抑制遺伝子を同定する本研究結果を用いて、肝芽腫のprogressionにおけるDNAメチル化異常の関与を明ちかにし、DNAメチル化異常からみた肝芽腫の予後予測因子としての分子マーカーを確立することが可能となると考えている。

The important reason for the development of liver disease is the molecular analysis of liver disease. Liver bud tissue macrodissection, fetal and fetal liver bud tissue analysis, DNA extraction, sub-generation analysis, Compared with normal liver tissue, CpG gene expression rate was more than 2 times higher. There were 1,638 genes in fetal type and 2,019 genes in embryonic type. Liver tumor cellline(HuH6, HepG2) is 5-aza-dC, which is used for the analysis of protein expression and protein expression. More than 2 times the number of samples were found in the sample. There were 905 samples. The above analysis results show that 83 candidate cancer suppressor genes are extracted. Now, we can analyze the clinical data of the patients. Pathological classification of embryonal hepatoma (embryonic type : high grade) fetal liver bud (fetal type : The results of this study were applied to the analysis and identification of candidate cancer suppressor genes in different tissue types and different rates of DNA methylation. DNA abnormalities in the liver bud and future predictive factors