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シャペロニン依存タンパク質の非依存体への変換によるシャペロニン依存性の解明

通过将伴侣蛋白依赖性蛋白转化为独立蛋白来阐明伴侣蛋白依赖性

基本信息

批准号：
08J08701
负责人：
藤原慶
金额：
$ 0.77万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

蛋白質はポリペプヂドが正しい立体構造をとることで機能する。蛋白質の中にはシャペロニンGroEの助けなしに正しい立体構造をとれないもの(GroE依存基質)が存在する。この理由を明らかにするために、GroE依存基質とGroEに依存しない蛋白質を比較した。先行研究において、GroELへの細胞内での結合頻度から、GroE依存基質が予測されていた。そこで、細胞内でフォールディングアッセイを行い、推定GroE依存基質のGroE依存性を解析した。結果、推定GroE依存基質の4割はGroE依存基質ではないことが明らかとなった。この結果は、メタボロミクスやプロテオミクスの解析によっても支持された。この4割とGroE依存基質、さらに細胞質全体の蛋白質は、アミノ酸組成、試験管合成時の凝集のしやすさ、好む立体構造が異なることが明らかとなった。特に、GroE依存基質はGroEが存在しない試験管合成時に凝集するものが濃縮されていること、アラニンとグリシンの含量が高い蛋白質が多いことが特徴であった。また、GroE依存基質のホモログのフォールディングを解析したところ、同じ生物でのホモログではGroE依存性が保存される傾向があること、GroEを持たない生物のホモログはGroEに依存しないことが明らかとなった。特にGroEを持たない生物のGroE依存基質ホモログは大腸菌のGroE依存基質と比べてアラニン、グリシンの含量が低く、アラニンとグリシンの含量の高さがGroE依存性に関与していることを支持した。また本研究で同定したGroE依存基質の分布や特徴は、シャペロンが蛋白質や生命システムの進化に関与してきたという仮説を支持した。

Protein has a three-dimensional structure. Protein in the middle of the room to help the three-dimensional structure of the (GroE-dependent matrix) exists The reason for this is that GroE depends on the substrate and GroE depends on protein. In advance, we studied the binding frequency in cells of GroEL and GroE-dependent matrix. Analysis of GroE dependence on a presumed GroE dependent substrate The results indicate that the GroE dependent matrix is 4-fold. The results of this study are as follows: 4. Growth-dependent matrix, protein composition of the entire cytoplasm, aggregation during tube synthesis, and good stereostructure. Characteristics: GroE-dependent substrate GroE is present in the presence of a high concentration of protein during tube synthesis. GroE dependency is a tendency to be preserved. In particular, GroE dependent substrates of organisms are associated with the growth of E. coli, and the growth of E. coli is associated with the growth of E. coli. This study supports the study of the relationship between protein and life cycle evolution and the distribution characteristics of GroE-dependent substrates.